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假单胞菌M18中全局性基因qscR和gacA对次生代谢的调控作用

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
绪论第12-37页
 1 假单胞菌的生物防治机理第12-19页
   ·抗生素的作用第13-19页
     ·吩嗪及其衍生物第15-17页
     ·藤黄绿菌素第17-18页
     ·2,4-二乙酰藤黄酚第18页
     ·硝吡咯菌素第18-19页
     ·氢氰酸第19页
     ·粘质酰胺第19页
 2 双元组分调控系统第19-23页
   ·双元组分调控系统第19-23页
     ·RsmA 和RsmE第22页
     ·RsmY 和RsmZ第22-23页
 3 菌群传感系统(Quorum Sensing System)第23-33页
   ·革兰氏阴性细菌(G-)中感知种内数量的QS 系统第24-28页
   ·LuxR 蛋白以及qscR 基因第28-31页
     ·结构和功能第28页
     ·LuxR 蛋白的作用模型第28-30页
     ·LuxR 型的阻遏物第30页
     ·qscR 基因第30-31页
   ·革兰氏阳性细菌(G+)中感知种内数量的QS 系统第31-33页
 4 信号分子介导的基因调控第33-34页
 5 泳动能力和群集运动能力第34-35页
 6 假单胞菌株M18 在生物防治方面的应用第35-36页
 7 研究目的和内容第36-37页
   ·研究的目的第36页
   ·研究的主要内容第36-37页
第一章 qscR 基因突变菌株M18Q 的构建第37-49页
 1 假单胞菌M1895cR 基因PCR 扩增第37-40页
   ·实验培养基、抗生素及菌株第37页
   ·假单胞菌M18 基因组DNA 的提取第37-38页
   ·引物和聚合酶链式(PCR)反应第38页
   ·电泳定性检验DNA第38-39页
   ·PCR DNA 片段的回收纯化及测序第39页
   ·M18 基因组DNA 抽提结果及qscR 基因片段PCR 和测序结果第39-40页
 2 假单胞菌M1895cR 基因的体外突变及突变株的构建第40-49页
   ·材料与方法第40-43页
     ·实验用菌株及质粒第40-41页
     ·质粒DNA 抽提操作第41页
     ·酶切反应和DNA 片段回收第41页
     ·连接反应第41-42页
     ·感受态细胞制备第42页
     ·感受态细胞转化第42-43页
     ·细菌接合转移第43页
     ·突变株验证第43页
   ·结果第43-49页
     ·qscR 基因的克隆第43-44页
     ·qscR 基因的体外突变第44-46页
     ·qscR 基因突变菌株M18Q 的获得和验证第46-49页
第二章 假单胞菌M1895cR 基因对PCA 和Plt 区别性调控研究第49-57页
 1 材料与方法第49-52页
   ·菌株和质粒第49页
   ·培养基及培养条件第49-50页
   ·生长曲线测定及PCA 和Plt 的提取和定量测定第50页
   ·β-半乳糖苷酶活性测定第50-52页
     ·原理第50页
     ·试剂及工作液组分第50-51页
     ·β-半乳糖苷酶活性测定方法第51-52页
   ·过表达质粒pME6032Q 构建第52页
 2. 结果第52-56页
   ·PCA 和Plt 生物合成的动力学分析第52-55页
   ·QscR 对PCA 生物合成基因表达的影响第55-56页
 3. 讨论第56-57页
第三章 gacA 基因对两套吩嗪合成基因簇表达的调控第57-73页
 1. 转录融合法测定GacA 对phz 表达的影响第57-62页
   ·材料与方法第57-60页
     ·试验用菌株质粒及引物第57-58页
     ·构建phzA1-lacZ 转录融合第58页
     ·构建phzA2-lacZ 转录融合第58-60页
     ·测定phzA1-lacZ 和phzA1-lacZ 转录融合的表达情况第60页
   ·实验结果与讨论第60-62页
 2 用Real-Time PCR 的方法测定GacA 对phz 表达的调控作用第62-73页
   ·材料与方法第62-67页
     ·材料,菌株,质粒与引物第62-63页
     ·UNIQ-10 柱式Trizol 提取总RNA第63-64页
     ·反转录第64-65页
     ·PCR 检测RNA 是否被成功反转录第65页
     ·内参基因rpOD 进行Real Time-PCR第65-66页
     ·常规PCR,结果显示GacA 对phz 表达的影响第66-67页
   ·实验结果第67-69页
     ·菌种:M18, M18G 的RT-PCR 结果第67页
     ·菌种:M18G/pME6000, M18G/pXUG 的RT-PCR 结果第67-68页
     ·GacA 对M18 phz 基因表达的影响第68-69页
   ·讨论与分析第69-73页
第四章 gacA 对M18 菌株次生代谢的其他影响第73-85页
 1 GacA 对M18 中quorum-sensing 系统的调控作用第73-79页
   ·材料与方法第73-76页
     ·试验用菌株质粒及引物第73-74页
     ·构建rhlR第74-75页
     ·构建lasI第75页
     ·测定翻译融合质粒pME6015lasI,pME6015lasR,pMEIZ,pME6015rhlR在M18 和M18G 中的表达情况第75-76页
   ·结果与讨论第76-79页
 2 假单胞菌M18gacA 基因对运动力的影响研究第79-80页
   ·材料与方法第79-80页
     ·实验培养基第79页
     ·泳动能力( Swimming motility)的检测第79页
     ·群集运动能力(swarming motility)的检测第79-80页
   ·结果与讨论第80页
     ·运动力检测结果第80页
 3 CAS 法检测gacA 对M18 铁载体分泌的影响第80-85页
   ·材料与方法第80-81页
     ·CAS 琼脂培养基的配制第80-81页
     ·检测方法第81页
   ·结果与讨论第81-85页
     ·铁载体分泌检测结果第81-82页
     ·实验分析与讨论第82-85页
第五章 GacA 和QscR 的相互关系第85-90页
 1 材料与方法第85-87页
   ·试验用菌株和质粒第85页
   ·构建 qscR’-’lacZ 转录融合第85-86页
   ·β-半乳糖苷酶活性测定第86-87页
 2 结果与讨论第87-90页
参考文献第90-97页
附录 实验所用试剂及仪器设备第97-99页
致谢第99-100页
发表论文第100页

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