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MADS-box基因在水稻和太行花中的相关研究&SAGE在水稻上应用的生物信息学分析

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-10页
符号缩写第10-11页
第一章 水稻MADS-BOX 基因的序列分析、基因克隆及初步的功能分析第11-47页
 前言第11-19页
  1、花发育研究进展第11-16页
  2、水稻花发育相关基因MADS-box 研究进展第16-19页
 材料与方法第19-33页
  实验材料、药品第19页
  方法第19-33页
 结果与分析第33-38页
  1、水稻基因组水平MADS-box 基因的检索与分析第33-34页
  2、cDNA 文库的筛选第34-35页
  3、用3’-RACE 克隆基因第35-36页
  4. OsMAD514 基因的原位杂交分析第36-38页
 讨论第38-41页
 附录第41-45页
  实验所用试剂、缓冲液第41-45页
 附图第45-47页
第二章 太行花TRSEP3 基因的克隆与功能分析第47-79页
 前言第47-49页
 材料与方法第49-61页
  实验材料、试剂第49页
  方法第49-61页
 结果与分析第61-69页
  1、序列的获得第61页
  2、序列分析第61-63页
  3、原位杂交分析第63页
  4. TrSEP3 转化拟南芥的载体构建第63-64页
  5. TrSEP3 正义载体转化拟南芥(过表达)第64-66页
   ·转基因阳性株的获取第64页
   ·转基因阳性株的检测第64-66页
  6、选择压力分析第66-69页
 讨论第69-71页
 附录第71-79页
  实验所用试剂、缓冲液第71-72页
  载体构建流程第72-79页
第三章 SAGE 在水稻上应用的生物信息学分析第79-96页
 前言第79-84页
 数据与方法第84-86页
  虚拟SAGE 库、参考数据库第84页
  锚定酶及tag 长度的选择第84页
  tag 的提取、匹配及匹配准确率的确定第84-86页
 结果与分析第86-93页
  1、参考数据库的构建第86-90页
  2、不同锚定酶在不同参考数据库中识别位点出现频率的比较第90-91页
  3、SAGE-tag 长度对tag mapping 的影响第91页
  4、锚定酶组合得到的176p SAGE-tag 在tag mapping 中的效率分析第91-93页
 讨论第93-96页
  1、EST_U and EST_T 是参考数据库的首选第93-94页
  2、双锚定酶和176p 的tag 对水稻而言是理想的选择第94-96页
参考文献第96-105页
致谢第105页

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