生物网络中基于模体相关性分析的模体功能预测
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第1章 绪论 | 第8-17页 |
| ·课题背景 | 第8-9页 |
| ·国内外研究现状 | 第9-13页 |
| ·生物网络的主要研究对象 | 第9-13页 |
| ·基于网络模体的生物网络研究 | 第13页 |
| ·本课题的研究目的和意义 | 第13-15页 |
| ·本文的主要研究内容和组织结构 | 第15-17页 |
| 第2章 网络模体发现算法分析 | 第17-30页 |
| ·概述 | 第17-18页 |
| ·图的相关定义 | 第18-21页 |
| ·网络模体研究 | 第21-25页 |
| ·网络模体的定义 | 第21-22页 |
| ·网络模体的生物学意义 | 第22-23页 |
| ·网络模体发现算法的基本步骤 | 第23-25页 |
| ·几种网络模体发现算法分析 | 第25-28页 |
| ·mFinder 算法 | 第25-26页 |
| ·FANMOD 算法 | 第26-27页 |
| ·Kavosh 算法 | 第27-28页 |
| ·网络模体发现算法研究与比较 | 第28-29页 |
| ·数据集 | 第28页 |
| ·算法性能比较及影响因素分析 | 第28-29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第3章 基于子图分析的网络模体结构独立性研究 | 第30-38页 |
| ·子网络模体 | 第30-32页 |
| ·子网络模体的概念 | 第30-31页 |
| ·子网络模体特点分析 | 第31页 |
| ·关联度序列同构算法 | 第31-32页 |
| ·网络模体结构独立性分析 | 第32-37页 |
| ·结构独立性 | 第32-33页 |
| ·结构独立性研究意义 | 第33页 |
| ·结构独立性计算 | 第33-37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 第4章 基于向量空间模型的网络模体相似度研究 | 第38-47页 |
| ·向量空间模型概述 | 第38-40页 |
| ·空间向量构造 | 第40-41页 |
| ·不同大小的网络模体之间的关系 | 第40页 |
| ·特征向量提取 | 第40-41页 |
| ·向量相似度计算 | 第41页 |
| ·网络模体功能预测分析 | 第41-45页 |
| ·基于向量距离的网络模体功能预测 | 第42-43页 |
| ·基于统计的网络模体功能比较 | 第43-45页 |
| ·本章小结 | 第45-47页 |
| 第5章 网络模体分析系统 | 第47-55页 |
| ·网络模体分析系统框架 | 第47-48页 |
| ·系统的输入和输出 | 第47页 |
| ·系统组成 | 第47-48页 |
| ·网络模体分析系统功能模块介绍 | 第48-50页 |
| ·子图获取模块 | 第48-49页 |
| ·基于关联度序列的网络模体比较模块 | 第49-50页 |
| ·大肠杆菌基因调控网络分析 | 第50-54页 |
| ·网络模体相似度分析 | 第51页 |
| ·网络模体功能预测 | 第51-53页 |
| ·结构独立性分析 | 第53-54页 |
| ·本章小结 | 第54-55页 |
| 结论 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
