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水稻土壤重金属和硫分子形态转化的功能微生物作用机制

致谢第1-8页
摘要第8-10页
ABSTRACT第10-13页
目录第13-18页
第一章 引言第18-48页
 1 土壤硫形态转化对重金属迁移转化的作用第18-21页
   ·土壤硫形态及硫循环第18-19页
   ·土壤硫形态转化对重金属迁移转化的影响第19-21页
 2 硫氧化还原菌作用下的土壤硫形态转化第21-33页
   ·硫氧化还原菌对土壤硫形态转化的影响第21-22页
   ·硫还原菌的耐氧机制第22-23页
   ·硫还原菌的检测方法第23-29页
     ·用培养法检测硫还原菌第23-24页
     ·基于16S rRNA基因方法检测硫还原菌第24-27页
     ·基于硫还原菌的异化型亚硫酸盐还原酶特性的检测法第27-29页
   ·硫氧化菌代谢途径相关机理研究第29-33页
     ·硫氧化菌对金属硫化物的代谢途径第29页
     ·硫氧化菌对硫代硫酸盐的代谢途径第29-30页
     ·硫氧化菌体内硫球及其形态第30-32页
     ·二氧化碳利用及梭酶体第32-33页
 3 基于同步辐射技术的重金属和硫分子形态及分布研究第33-45页
   ·同步辐射X射线吸收光谱(XAS)第33-35页
   ·利用XAS分析环境中重金属分子形态第35-36页
   ·利用XAS分析环境中硫分子形态第36-42页
     ·硫的XANES理论基础第36-38页
     ·实验设备第38-40页
     ·数据分析第40-41页
     ·硫的XANES分析的应用第41-42页
   ·基于同步辐射X射线荧光(XRF)微区分布定位研究第42-45页
 4 研究背景、研究内容及技术路线第45-48页
   ·研究背景及研究内容第45-47页
   ·技术路线第47-48页
第二章 土壤-水稻系统中重金属铜与硫的分子形态转化及关系第48-65页
 1 引言第48页
 2 材料与方法第48-53页
   ·水稻土的采集及分析第49页
   ·实验设计第49页
   ·土壤、植物样的采集及Eh测定第49-50页
   ·土壤能谱分析第50页
   ·土壤重金属连续提取第50-51页
   ·土壤硫分级提取第51页
   ·土壤及水稻中重金属Cu的XAS分析第51-52页
   ·土壤及水稻中硫K边XANES分析第52-53页
 3 结果与讨论第53-63页
   ·水稻根际土、非根际土中铜形态研究第53-57页
   ·土壤-水稻系统中铜与硫形态转化的相互关系第57-60页
   ·水稻体内硫的分子形态研究第60-61页
   ·水稻体内铜分子形态研究第61-63页
 4 小结第63-65页
第三章 硫对重金属有效性及土壤微生物群落结构的影响第65-84页
 1 引言第65页
 2 材料与方法第65-70页
   ·实验设计第65-68页
   ·土壤、植物样的采集第68页
   ·硫处理对重金属形态及水稻吸收重金属的影响第68页
   ·土壤微生物PCR-DGGE分析第68-70页
 3 结果与讨论第70-83页
   ·硫对水稻根际土壤重金属生物有效性的影响第70-76页
   ·硫对铜铅污染土壤水稻根际总细菌群落结构的影响第76-83页
 4 小结第83-84页
第四章 土壤硫氧化还原菌种群分布及其与重金属铅和硫形态转化的关系第84-104页
 1 引言第84-85页
 2 材料与方法第85-90页
   ·实验设计第85页
   ·根际土中SOB及SRB荧光原位杂交实验(FISH)第85页
   ·硫氧化菌子群Thiomicrospira属PCR-DGGE分析第85-86页
   ·直接PCR及Nest PCR-DGGE分析水稻根际土SRB群落结构第86-88页
   ·DNA片段回收及克隆、测序第88-89页
   ·硫还原菌实时荧光定量PCR分析第89页
   ·根际土中硫和铅形态分析第89-90页
 3 结果与讨论第90-102页
   ·土壤理化性质分析第90-91页
   ·硫氧化还原菌FISH分析第91-93页
   ·硫氧化菌PCR-DGGE分析第93-94页
   ·水稻根际硫还原菌群落结构及其对铅及硫形态转化的作用第94-100页
   ·铅对水稻根际硫还原菌活性的影响第100-102页
   ·小结第102-104页
第五章 水稻土中硫氧化菌的筛选鉴定及其代谢途径研究第104-118页
 1 引言第104页
 2 材料与方法第104-107页
   ·菌株的分离纯化第104-105页
   ·分离菌株的16S rRNA基因鉴定第105-106页
   ·分离菌株的生理生化性质测定第106页
   ·分离菌株的soxB基因检测第106-107页
   ·分离菌株体内硫形态分析第107页
 3 结果与讨论第107-116页
   ·硫氧化菌的筛选及16S rRNA基因鉴定第107-110页
   ·菌株Halothiobacillus HT1生理生化性质分析第110-114页
   ·菌株Halothiobacillus HT1的代谢途径分析第114-115页
   ·菌株Halothiobacillus HT1体内硫形态分析第115-116页
 4 小结第116-118页
第六章 硫氧化菌作用下重金属和硫形态转化及其生物膜空间结构研究第118-132页
 1 引言第118-119页
 2 材料与方法第119-121页
   ·菌株Halothiobacillus HT1对重金属离子吸附实验第119页
   ·菌株Halothiobacillus HT1对重金属硫化矿氧化及吸附实验第119页
   ·菌株Halothiobacillus HT1在金属硫化物上生物膜分布及其与重金属的作用第119-121页
 3 结果与讨论第121-130页
   ·菌株Halothiobacillus HT1对金属离子的吸附第121-122页
   ·菌株Halothiobacillus HT1对金属硫化矿氧化及吸附第122-123页
   ·金属硫化物表面生长的Halothiobacillus HT1生物膜结构及其与重金属的作用第123-128页
     ·金属硫化物上Halothiobacillus HT1生物膜中死活细胞的分布规律第124-127页
     ·菌株Halothiobacillus HT1生物膜上重金属分布第127-128页
   ·菌株Halothiobacillus HT1生物膜中水平不同微区铜分子形态分析第128-130页
 4 小结第130-132页
第七章 全文总结与展望第132-136页
 1 全文总结第132-134页
   ·土壤-水稻系统中Cu和S的形态转化及相互关系第132页
   ·硫对重金属有效性及土壤微生物群落结构的影响第132页
   ·土壤硫氧化还原菌种群分布及其与重金属铅和硫形态转化的关系第132-133页
   ·水稻土中硫氧化菌的筛选鉴定及其代谢途径研究第133页
   ·硫氧化菌作用下重金属和硫形态转化及其生物膜空间结构研究第133-134页
 2 研究展望第134-136页
参考文献第136-151页
作者简历第151页
攻读博士期间撰写的文章第151-152页
 已发表期刊论文第151-152页
 已投稿论文第152页

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