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基于基因表达谱和蛋白-蛋白相互作用网络的乳腺癌相关特异性基因的识别

摘要第3-4页
abstract第4页
第1章 绪论第7-13页
    1.1 引言第7页
    1.2 乳腺癌概述第7-8页
    1.3 三阴性乳腺癌概述第8-9页
    1.4 国内外乳腺癌的研究现状第9-11页
    1.5 论文的主要工作和创新第11-12页
    1.6 论文结构第12-13页
第2章 基于基因表达谱数据和蛋白-蛋白相互作用网络识别乳腺癌相关的特异性基因第13-38页
    2.1 研究的目的和意义第13-14页
    2.2 材料和方法第14-26页
        2.2.1 芯片数据来源第15-16页
        2.2.2 芯片数据预处理第16-20页
        2.2.3 最大相关最小冗余算法第20-22页
        2.2.4 PPI的建立以及最短路径追踪第22-24页
        2.2.5 去随机因素第24页
        2.2.6 功能富集分析第24-26页
    2.3 结果第26-32页
        2.3.1 基于PPI的最短路径算法识别基因的结果第26-28页
        2.3.2 基因功能富集分析第28-32页
    2.4 讨论第32-37页
        2.4.1 候选基因分析第32-35页
        2.4.2 GO富集分析第35-36页
        2.4.3 KEGG富集分析第36-37页
    2.5 结论第37页
    2.6 本章小结第37-38页
第3章 基于基因表达谱数据和蛋白-蛋白相互作用网络识别三阴性乳腺癌相关的特异性基因第38-53页
    3.1 研究目的及意义第38页
    3.2 材料和方法第38-40页
        3.2.1 三阴性乳腺癌的样本来源第38页
        3.2.2 基因芯片的预处理第38-39页
        3.2.3 最大相关最小冗余计算第39页
        3.2.4 最短路径计算第39-40页
        3.2.5 与乳腺癌所计算出的基因取交集第40页
    3.3 结果第40-46页
        3.3.1 与三阴性乳腺癌相关的特异性基因第40-42页
        3.3.2 GO富集分析第42-45页
        3.3.3 KEGG富集分析第45-46页
    3.4 讨论第46-52页
        3.4.1 潜在的与三阴性乳腺癌相关的特异性基因第46-50页
        3.4.2 GO富集分析第50-51页
        3.4.3 KEGG富集分析第51-52页
    3.5 结论第52页
    3.6 本章小结第52-53页
第4章 总结与展望第53-55页
    4.1 总结第53-54页
    4.2 展望第54-55页
参考文献第55-66页
发表论文和参加科研情况说明第66-67页
致谢第67页

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