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褪黑素和生长素诱导的差异转录组及拟南芥和二穗短柄草中14-3-3基因家族功能分析

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第1章 前言第13-27页
    1.1 褪黑素研究概况第13-16页
        1.1.1 褪黑素的发现及命名第13页
        1.1.2 褪黑素合成途径第13-14页
        1.1.3 褪黑素在植物中的作用第14-15页
        1.1.4 褪黑素与非生物胁迫第15-16页
    1.2 生长素第16-19页
        1.2.1 生长素的生理作用第16页
        1.2.2 生长素的合成第16-18页
        1.2.3 生长素的运输第18页
        1.2.4 褪黑素与IAA的关系第18-19页
    1.4 14-3-3蛋白的研究概况第19-24页
        1.4.1 14-3-3蛋白命名及其结构第19页
        1.4.2 14-3-3蛋白配体第19-20页
        1.4.3 14-3-3蛋白在植物中的作用第20-24页
    1.5 本研究的目的及意义第24-25页
    1.6 该研究技术路线第25-27页
第2章 实验材料与方法第27-45页
    2.1 实验材料与试剂第27-28页
    2.2 常用试剂的制备第28-30页
        2.2.1 MS培养基的制备第28页
        2.2.2 LB培养基的制备第28页
        2.2.3 褪黑素溶液的制备第28-29页
        2.2.4 种子消毒液的配制第29页
        2.2.5 大肠杆菌感受态的制备第29-30页
    2.3 种子的消毒第30页
    2.4 拟南芥的生长环境第30-31页
        2.4.1 拟南芥在MS培养基上的生长第30页
        2.4.2 拟南芥在土壤中上的生长第30-31页
    2.5 拟南芥在不同平板上的生长第31页
    2.6 RNA-seq实验材料的准备第31页
        2.6.1 低浓度褪黑素和生长素RNA-Seq样品的准备第31页
        2.6.2 高浓度褪黑素RNA-Seq样品的准备第31页
    2.7 RNA-Seq数据的分析第31-32页
    2.8 拟南芥14-3-3家族的基因克隆与转基因植株的获得第32-33页
        2.8.1 拟南芥14-3-3家族过表达载体的构建第32页
        2.8.2 拟南芥14-3-3家族RNAi载体的构建第32-33页
        2.8.3 拟南芥14-3-3家族转基因株系的获得第33页
    2.9 二穗短柄草14-3-3基因家族进化树分析第33-34页
    2.10 二穗短柄草14-3-3家族染色体定位分析第34页
    2.11 二穗短柄草14-3-3家族基因在不同激素处理下的表达模式第34页
    2.12 二穗短柄草4-3-3家族基因在不同非生物胁迫下的表达模式第34页
    2.13 二穗短柄草14-3-3家族基因的克隆第34-39页
        2.13.1 引物设计第34-35页
        2.13.2 二穗短柄草RNA的提取第35-36页
        2.13.3 DNA消除第36页
        2.13.4 cDNA的合成:第36页
        2.13.5 候选基因的克隆第36-38页
        2.13.6 连接产物转化及重组质粒的蓝白筛选第38页
        2.13.7 菌落PCR鉴定第38-39页
    2.14 质粒的提取第39页
    2.15 过表达载体构建第39-40页
    2.16 农杆菌的转化第40页
    2.17 拟南芥侵染第40页
    2.18 筛选抗性植株第40-41页
    2.19 干旱实验第41页
    2.20 盐胁迫第41-42页
        2.20.1 在土壤中的盐胁迫第41-42页
        2.20.2 种子萌发过程中的盐胁迫第42页
        2.20.3 幼苗生长过程中的盐胁迫第42页
    2.21 冻害胁迫第42页
        2.21.1 土壤中的冻害胁迫第42页
        2.21.2 MS培养基上的冻害胁迫第42页
    2.22 渗透胁迫第42-43页
    2.23 生理指标的测定第43-44页
    2.24 荧光定量实验(Real Time PCR,RT-PCR)第44-45页
第3章 褪黑素对拟南芥根系生长和转录组的影响第45-73页
    3.1 材料与方法第45页
        3.1.1 实验材料第45页
        3.1.2 转录组样品的的准备第45页
        3.1.3 RNA-seq数据的分析第45页
        3.1.4 拟南芥的种植与生长环境第45页
        3.1.5 根长实验第45页
    3.2 实验结果第45-68页
        3.2.1 低浓度褪黑素促进野生型拟南芥根系的生长第45-46页
        3.2.2 低浓度褪黑素处理对转录组的影响第46-47页
        3.2.3 低浓度褪黑素和生长素诱导差异基因的GO富集性分析第47-50页
        3.2.4 低浓度褪黑素和生长素处理后各代谢途径的富集性分析第50-52页
        3.2.5 低浓度褪黑素和生长素诱导的相关基因的表达第52-53页
        3.2.6 低浓度褪黑素对IAA突变体yucQ的根系生长的影响第53-54页
        3.2.7 生长素运输抑制剂TIBA对褪黑素促进拟南芥根系伸长效果的影响第54-55页
        3.2.8 生长素合成抑制剂对褪黑素促进拟南芥根系伸长效果的影响第55-56页
        3.2.9 高浓度褪黑素抑制野生型拟南芥根系伸长第56-57页
        3.2.10 高浓度褪黑素处理后转录组水平的变化第57-58页
        3.2.11 高浓度褪黑素与生长素以及放线菌酮诱导的基因的聚类分析比较第58-59页
        3.2.12 高浓度褪黑素诱导的基因的变化第59页
        3.2.13 高浓度褪黑素调控基因的代谢通路富集性分析第59-61页
        3.2.14 高低浓度褪黑素处理后拟南芥代谢路径的富集性分析的比较第61-62页
        3.2.15 不同浓度褪黑素和生长素处理对拟南芥转录组的聚类分析比较第62-64页
        3.2.16 不同浓度褪黑素和生长素处理对拟南芥代谢通路的影响第64-66页
        3.2.17 高低浓度生长素以及高低浓度褪黑素共同诱导的基因网络分析第66-68页
    3.3 讨论第68-72页
    3.4 小结第72-73页
第4章 拟南芥及二穗短柄草14-3-3蛋白功能解析第73-97页
    4.1 实验材料和方法第73页
        4.1.1 实验材料第73页
        4.1.2 实验方法第73页
    4.2 拟南芥中14-3-3家族基因在非生物胁迫中的作用第73-78页
        4.2.1 拟南芥14-3-3家族进化分析第73-74页
        4.2.2 拟南芥14-3-3家族基因突变体以及过表达株系的获得及其对ABA的敏感性分析第74-76页
        4.2.3 拟南芥14-3-3家族GRF1、GRF2、GRF4对干旱胁迫的响应第76-77页
        4.2.4 拟南芥14-3-3家族GRF9、GRF11、GRF12对干旱胁迫的响应第77-78页
    4.3 单子叶植物二穗短柄草14-3-3家族基因的鉴定分析以及在干旱胁迫中的作用第78-92页
        4.3.1 二穗短柄草14-3-3家族基因的鉴定以及进化树分析第78-81页
        4.3.2 二穗短柄草14-3-3家族基因结构以及保守性分析第81-82页
        4.3.3 二穗短柄草14-3-3家族基因中顺式作用元件分析第82-84页
        4.3.4 二穗短柄草14-3-3家族基因对不同非生物胁迫的响应第84-86页
        4.3.5 二穗短柄草14-3-3家族基因对不同激素处理的响应第86-87页
        4.3.6 二穗短柄草家族基因的克隆以及转基因植株的构建第87-88页
        4.3.7 转基因植株干旱胁迫实验第88-89页
        4.3.8 BdGF14a转基因植株在干旱胁迫条件下抗氧化酶活性的变化以及MDA含量的变化第89-91页
        4.3.9 BdGF14a调控的干旱响应基因第91-92页
    4.4 讨论第92-95页
    4.5 小结第95-97页
第5章 结论第97-99页
参考文献第99-113页
致谢第113-117页
附录第117-143页
作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果第143页

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