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芥菜型油菜白花基因的定位及候选基因分析

摘要第7-9页
Abstract第9-11页
缩略语表第12-13页
1 文献综述第13-32页
    1.1 植物花色的重要意义第13页
    1.2 油菜花色的变异及其来源第13-18页
        1.2.1 自然变异第16-17页
        1.2.2 人工诱变第17页
        1.2.3 远缘杂交第17-18页
        1.2.4 基因工程第18页
    1.3 油菜花色的研究进展第18-20页
        1.3.1 油菜花色的遗传研究进展第18-19页
        1.3.2 油菜花色形成的分子机制第19-20页
    1.4 类胡萝卜素的研究进展第20-28页
        1.4.1 植物中类胡萝卜素的组成及功能第20-22页
        1.4.2 植物中类胡萝卜素的生物合成第22-25页
        1.4.3 植物中类胡萝卜素的裂解第25-26页
        1.4.4 植物中类胡萝卜素的贮存及质体的发育第26-28页
    1.5 基因定位第28-30页
        1.5.1 图位克隆第29页
        1.5.2 重测序分析第29-30页
        1.5.3 转录组测序分析第30页
    1.6 本研究的目的和意义第30-32页
2 材料及方法第32-48页
    2.1 试验材料第32页
    2.2 群体构建及遗传分析第32-33页
    2.3 分子标记分析第33-34页
        2.3.1 油菜DNA的提取第33页
        2.3.2 AFLP标记及SCAR标记转化第33-34页
        2.3.3 SSR标记的开发第34页
        2.3.4 连锁图谱构建第34页
    2.4 花瓣透射电镜照片制作第34-35页
    2.5 等位性分析第35-37页
    2.6 BjPC2位点重测序分析第37-41页
        2.6.1 建库测序第37页
        2.6.2 生物信息学分析第37-41页
        2.6.3 基因定位第41页
    2.7 转录组分析第41-45页
        2.7.1 转录组测序过程第41-42页
        2.7.2 转录组生物信息分析第42-45页
    2.8 类胡萝卜素成分的测定第45-47页
    2.9 定量PCR分析第47-48页
        2.9.1 RNA提取及cDNA合成第47页
        2.9.2 定量PCR第47-48页
3 结果与分析第48-79页
    3.1 白花突变体表型及质体透射电镜分析第48-49页
    3.2 遗传分析第49-50页
    3.3 BjPC1基因的定位第50-56页
        3.3.1 构建BjPC1定位群体第50页
        3.3.2 近等基因系花瓣中类胡萝卜素含量分析第50-51页
        3.3.3 SSR标记的筛选第51页
        3.3.4 AFLP标记筛选第51-52页
        3.3.5 SSR标记开发第52-53页
        3.3.6 BjPC1基因的精细定位第53-54页
        3.3.7 候选基因预测第54-56页
    3.4 基因分离及等位性分析第56页
        3.4.1 标记分离BjPC1和BjPC2第56页
        3.4.2 BjPC1和BjPC2的等位性分析第56页
    3.5 BjPC2基因定位及候选基因功能分析第56-79页
        3.5.1 分离群体的重测序分析第59-62页
        3.5.2 分子标记的开发第62-63页
        3.5.3 BjPC2基因的遗传定位第63-65页
        3.5.4 候选基因鉴定第65-67页
        3.5.5 近等基因系黄白花花瓣中类胡萝卜素的分析第67-70页
        3.5.6 花瓣中类胡萝卜素积累结构的超微观察第70-71页
        3.5.7 转录组分析BjPC2调控第71-79页
4 讨论第79-85页
    4.1 高通量测序与正向遗传学的结合在基因定位中的应用第79-81页
    4.2 类胡萝卜素的含量是芥菜型油菜花色变异的基础第81-82页
    4.3 酯化及质体发育对类胡萝卜素储存的影响第82-83页
    4.4 芥菜型油菜花色变异分子机制探讨第83-84页
    4.5 下一步研究计划第84-85页
参考文献第85-104页
附录第104-110页
    附录1 芥菜型油菜BjPC1定位群体构建示意图第104页
    附录2 芥菜型油菜BjPC2定位群体构建示意图第104-105页
    附录3 重测序测序数据质控信息第105-106页
    附录4 转录组测序数据质控信息第106-107页
    附录5 转录组测序注释到类胡萝卜素生物合成路径的相关基因的表达第107-109页
    附录6 作者简介和研究生阶段发表的文章第109-110页
致谢第110-112页

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