| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-21页 |
| 1.1 DNA序列压缩研究背景与意义 | 第10页 |
| 1.2 DNA序列压缩研究现状 | 第10-19页 |
| 1.2.1 DNA序列特点 | 第10-12页 |
| 1.2.1.1 结构特点 | 第10-11页 |
| 1.2.1.2 功能特点 | 第11页 |
| 1.2.1.3 信息特点 | 第11页 |
| 1.2.1.4 相似特点 | 第11-12页 |
| 1.2.2 DNA序列压缩常用基准序列 | 第12-13页 |
| 1.2.3 DNA序列压缩常用评价标准 | 第13-16页 |
| 1.2.4 DNA序列压缩国内外经典算法 | 第16-19页 |
| 1.2.4.1 基于替代的DNA序列压缩算法 | 第16-18页 |
| 1.2.4.2 基于统计信息学的DNA序列压缩算法 | 第18-19页 |
| 1.3 论文主要工作以及章节安排 | 第19-21页 |
| 1.3.1 主要工作 | 第19页 |
| 1.3.2 章节安排 | 第19-21页 |
| 第二章 DNA序列压缩的替代理论以及统计理论基础 | 第21-36页 |
| 2.1 DNA序列压缩的替代理论基础 | 第21-29页 |
| 2.1.1 DNA序列片段分类 | 第21-23页 |
| 2.1.2 LZ经典压缩原理 | 第23-27页 |
| 2.1.3 RAY迭代字典创建原理(通用迭代算法RAY) | 第27-29页 |
| 2.2 DNA序列压缩的统计理论基础 | 第29-35页 |
| 2.2.1 预测序列符号概率 | 第30-33页 |
| 2.2.2 概率模型的压缩编码 | 第33-35页 |
| 2.3 本章小结 | 第35-36页 |
| 第三章 基于混合概率分布算子的DNA序列压缩算法 | 第36-47页 |
| 3.1 DNA序列符号的概率预测 | 第36-41页 |
| 3.1.1 XM算法原理描述 | 第36页 |
| 3.1.2 有限上下文算子描述 | 第36-38页 |
| 3.1.3 各类上下文算子的贡献权重 | 第38-39页 |
| 3.1.4 混合概率分布算子 | 第39-41页 |
| 3.2 DNA序列编码 | 第41-43页 |
| 3.3 实验数据与结果分析 | 第43-46页 |
| 3.3.1 参数设置 | 第43页 |
| 3.3.2 结果与分析 | 第43-46页 |
| 3.4 本章小结 | 第46-47页 |
| 第四章 基于迭代字典创建的DNA序列压缩算法 | 第47-57页 |
| 4.1 创建迭代字典 | 第47-50页 |
| 4.1.1 第一次迭代 | 第47-49页 |
| 4.1.1.1 频率字典创建 | 第47-49页 |
| 4.1.1.2 替代 | 第49页 |
| 4.1.2 第二次迭代以及后续迭代 | 第49-50页 |
| 4.2 基于改进LZ算法进行预处理 | 第50-53页 |
| 4.3 实验数据与结果分析 | 第53-56页 |
| 4.3.1 基于改进LZ算法预处理的参数选取比较 | 第53-54页 |
| 4.3.2 基于创建迭代字典的主压缩过程实验结果与分析 | 第54页 |
| 4.3.3 增加改进LZ算法预处理的最终实验结果与分析 | 第54-56页 |
| 4.4 本章小结 | 第56-57页 |
| 第五章 总结与展望 | 第57-59页 |
| 内容总结 | 第57页 |
| 主要贡献及创新点 | 第57-58页 |
| 后续工作展望 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-63页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 附件 | 第65页 |
