| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 1 绪论 | 第14-34页 |
| 1.1 研究背景 | 第14-25页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第25-30页 |
| 1.3 研究内容 | 第30-32页 |
| 1.4 论文组织结构 | 第32-34页 |
| 2 基于稀疏矩阵向量乘的相似度计算优化机制 | 第34-56页 |
| 2.1 研究背景 | 第34-36页 |
| 2.2 基本稀疏矩阵存储格式分析 | 第36-39页 |
| 2.3 新稀疏矩阵存储格式的设计与实现 | 第39-46页 |
| 2.4 性能测试与分析 | 第46-55页 |
| 2.5 本章小结 | 第55-56页 |
| 3 基于矩阵分解的多GPU相似度计算方法 | 第56-69页 |
| 3.1 研究背景 | 第56-58页 |
| 3.2 基于分而治之模型的奇异值分解 | 第58-60页 |
| 3.3 奇异值分解的多GPU实现方法 | 第60-64页 |
| 3.4 性能测试与分析 | 第64-68页 |
| 3.5 本章小结 | 第68-69页 |
| 4 基于压缩的序列比对多线程处理方法 | 第69-91页 |
| 4.1 研究背景 | 第69-70页 |
| 4.2 Smith-Waterman算法描述与分析 | 第70-73页 |
| 4.3 优化方案设计与实现 | 第73-81页 |
| 4.4 GPU内存分析 | 第81-83页 |
| 4.5 性能测试与分析 | 第83-89页 |
| 4.6 本章小结 | 第89-91页 |
| 5 相似拷贝检测优化机制 | 第91-103页 |
| 5.1 研究背景 | 第91-92页 |
| 5.2 simhash和汉明距离的描述与分析 | 第92-95页 |
| 5.3 相似拷贝检测方案设计 | 第95-99页 |
| 5.4 性能测试与分析 | 第99-101页 |
| 5.5 本章小结 | 第101-103页 |
| 6 总结与展望 | 第103-106页 |
| 致谢 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-117页 |
| 附录1 缩略词简表 | 第117-119页 |
| 附录2 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第119-120页 |
| 附录3 攻读博士学位期间申请发明专利与软件著作版权 | 第120-121页 |
| 附录4 攻读博士学位期间参加的主要科研项目 | 第121-122页 |
| 附录5 个人简历 | 第122页 |