| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第12-37页 |
| 1.1 文昌鱼概况 | 第12-14页 |
| 1.2 文昌鱼研究现状 | 第14-19页 |
| 1.2.1 文昌鱼发育过程研究进展 | 第14-16页 |
| 1.2.2 文昌鱼免疫系统研究进展 | 第16-17页 |
| 1.2.3 文昌鱼在进化过程中的独特地位 | 第17-19页 |
| 1.3 NF-κB、NFAT和TGFBI研究进展 | 第19-30页 |
| 1.3.1 NF-κB研究进展 | 第19-24页 |
| 1.3.2 NFAT在先天性免疫中的作用 | 第24-28页 |
| 1.3.3 TGFBI蛋白家族研究进展 | 第28-30页 |
| 1.4 TLR信号通路与网络水平进化 | 第30-34页 |
| 1.5 本论文的研究意义 | 第34-35页 |
| 1.6 本论文的创新点 | 第35-36页 |
| 1.7 技术路线 | 第36-37页 |
| 第二章 文昌鱼REL基因的克隆、进化及功能研究 | 第37-65页 |
| 2.1 前言 | 第37-38页 |
| 2.2 材料、试剂和仪器 | 第38页 |
| 2.2.1 文昌鱼的收集与培养 | 第38页 |
| 2.2.2 实验试剂 | 第38页 |
| 2.2.3 实验仪器 | 第38页 |
| 2.3 实验方法 | 第38-51页 |
| 2.3.1 白氏文昌鱼AmphiREL基因的cDNA全长克隆 | 第38-47页 |
| 2.3.2 文昌鱼急性免疫刺激后检测AmphiREL基因的表达变化 | 第47-49页 |
| 2.3.3 REL亚家族同源基因的搜索 | 第49页 |
| 2.3.4 序列比对、系统发育分析、motif分析和三级结构预测 | 第49-50页 |
| 2.3.5 选择压力分析 | 第50-51页 |
| 2.4 结果和讨论 | 第51-65页 |
| 2.4.1 白氏文昌鱼总RNA的提取 | 第51页 |
| 2.4.2 白氏文昌鱼AmphiREL基因全长扩增 | 第51-55页 |
| 2.4.3 白氏文昌鱼AmphiREL基因功能验证 | 第55-56页 |
| 2.4.4 Rel亚家族基因系统发生关系和共线性分析 | 第56-58页 |
| 2.4.5 Rel亚家族蛋白的结构多样性 | 第58-61页 |
| 2.4.6 Rel亚家族基因选择压力分析 | 第61-65页 |
| 第三章 文昌鱼NFAT基因的克隆、进化与功能研究 | 第65-85页 |
| 3.1 前言 | 第65-66页 |
| 3.2 材料、试剂和仪器 | 第66-67页 |
| 3.2.1 文昌鱼的收集与培养 | 第66页 |
| 3.2.2 实验试剂 | 第66-67页 |
| 3.2.3 实验仪器 | 第67页 |
| 3.3 实验方法 | 第67-70页 |
| 3.3.1 白氏文昌鱼AmphiNFAT基因全长的克隆 | 第67-68页 |
| 3.3.2 文昌鱼急性免疫刺激后检测AmphiNFAT基因的表达变化 | 第68页 |
| 3.3.3 文昌鱼AmphiNFAT基因空间表达模式分析 | 第68页 |
| 3.3.4 NFAT蛋白家族同源基因的搜索 | 第68-69页 |
| 3.3.5 多序列比对、保守motif和系统发育关系分析 | 第69页 |
| 3.3.6 基于密码子的序列分析 | 第69-70页 |
| 3.4 实验结果 | 第70-79页 |
| 3.4.1 白氏文昌鱼AmphiNFAT基因全长扩增 | 第70-73页 |
| 3.4.2 白氏文昌鱼不同组织中AmphiNFAT基因的表达谱分析 | 第73页 |
| 3.4.3 LPS刺激后白氏文昌鱼AmphiNFAT基因时间表达模式分析 | 第73-74页 |
| 3.4.4 NFAT蛋白家族系统发育关系、保守motif和共线性分析 | 第74-79页 |
| 3.4.5 NFAT蛋白家族基因选择压力分析 | 第79页 |
| 3.5 讨论 | 第79-85页 |
| 3.5.1 NFAT蛋白家族基因从刺胞动物门到脊椎动物都保守 | 第79-81页 |
| 3.5.2 NFAT蛋白家族的进化历程 | 第81-83页 |
| 3.5.3 NFAT蛋白家族能够参与先天性免疫应答过程 | 第83-85页 |
| 第四章 文昌鱼TGFBI基因的克隆、进化与功能研究 | 第85-102页 |
| 4.1 前言 | 第85-86页 |
| 4.2 材料、试剂和仪器 | 第86-87页 |
| 4.2.1 文昌鱼的收集与培养 | 第86页 |
| 4.2.2 实验试剂 | 第86页 |
| 4.2.3 实验仪器 | 第86-87页 |
| 4.3 实验方法 | 第87-90页 |
| 4.3.1 白氏文昌鱼AmphiTGFBI基因全长的克隆 | 第87-88页 |
| 4.3.2 文昌鱼AmphiTGFBI基因空间表达模式分析 | 第88页 |
| 4.3.3 TGFBI蛋白家族同源基因的搜索 | 第88-89页 |
| 4.3.4 多序列比对、保守motif和系统发育关系分析 | 第89页 |
| 4.3.5 基于密码子的序列分析 | 第89-90页 |
| 4.4 实验结果 | 第90-99页 |
| 4.4.1 文昌鱼AmphiTGFBI基因全长扩增 | 第90-93页 |
| 4.4.2 白氏文昌鱼不同组织中AmphiTGFBI基因表达模式分析 | 第93-94页 |
| 4.4.3 TGFBI蛋白家族的系统发育关系、保守motif和基因结构分析 | 第94-98页 |
| 4.4.4 TGFBI蛋白家族基因选择压力分析 | 第98-99页 |
| 4.5 讨论 | 第99-102页 |
| 4.5.1 TGFBI蛋白家族基因从多孔动物到哺乳动物是保守的 | 第99-100页 |
| 4.5.2 TGFBI蛋白家族基因受到的正选择作用可能与该基因的基因结构有关 | 第100-102页 |
| 第五章 TLR信号通路的起源与进化研究 | 第102-119页 |
| 5.1 前言 | 第102-103页 |
| 5.2 实验材料和方法 | 第103-105页 |
| 5.2.1 数据收集 | 第103-104页 |
| 5.2.2 多序列比对与系统发育分析 | 第104页 |
| 5.2.3 基于密码子序列的分析 | 第104-105页 |
| 5.2.4 多变量分析 | 第105页 |
| 5.3 结果和讨论 | 第105-119页 |
| 5.3.1 进化速率分析 | 第105-107页 |
| 5.3.2 选择压力的大小和网络结构 | 第107-110页 |
| 5.3.3 多变量分析 | 第110-111页 |
| 5.3.4 NF-κB介导的TLR信号通路的进化和起源 | 第111-119页 |
| 第六章 结论 | 第119-121页 |
| 附录 | 第121-140页 |
| 参考文献 | 第140-168页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第168-169页 |
| 致谢 | 第169-170页 |
