| 致谢 | 第4-8页 |
| 摘要 | 第8-9页 |
| 1 前言 | 第9-19页 |
| 1.1 亲缘地理学研究进展 | 第9-11页 |
| 1.1.1 亲缘地理学概念 | 第9页 |
| 1.1.2 植物亲缘地理学的研究进展 | 第9-11页 |
| 1.1.3 亲缘地理学研究的问题 | 第11页 |
| 1.1.3.1 推断物种的历史进程 | 第11页 |
| 1.1.3.2 推测物种的冰期避难所 | 第11页 |
| 1.1.3.3 估计各遗传谱系的分歧时间（Divergence Time） | 第11页 |
| 1.1.3.4 确定保护单元（Conservation Units） | 第11页 |
| 1.2 景观遗传学研究进展 | 第11-15页 |
| 1.2.1 景观遗传学概念 | 第11-12页 |
| 1.2.2 景观遗传学研究进展 | 第12-13页 |
| 1.2.3 景观遗传学研究的主要问题 | 第13-15页 |
| 1.2.3.1 分析量化景观变量与景观格局对遗传变异的影响 | 第13页 |
| 1.2.3.2 确认基因交流的障碍 | 第13-14页 |
| 1.2.3.3 源-汇生境动态 | 第14页 |
| 1.2.3.4 时空尺度 | 第14-15页 |
| 1.2.3.5 特异性生态假说的验证 | 第15页 |
| 1.3 连翘的研究概况 | 第15-16页 |
| 1.3.1 连翘的形态学特征 | 第15-16页 |
| 1.3.2 连翘的保育价值 | 第16页 |
| 1.3.2.1 药用价值 | 第16页 |
| 1.3.2.2 生态价值 | 第16页 |
| 1.4 研究背景、目的及意义 | 第16-19页 |
| 1.4.1 研究背景 | 第16-17页 |
| 1.4.2 研究目的 | 第17页 |
| 1.4.3 研究意义 | 第17-19页 |
| 2 连翘的亲缘地理学研究 | 第19-39页 |
| 2.1 背景 | 第19-20页 |
| 2.2 样本采集 | 第20页 |
| 2.3 方法 | 第20-23页 |
| 2.3.1 提取总基因组DNA | 第20-21页 |
| 2.3.2 PCR扩增 | 第21页 |
| 2.3.3 分子数据分析 | 第21-23页 |
| 2.3.4 过去和现在适宜气候的推论 | 第23页 |
| 2.4 结果与分析 | 第23-35页 |
| 2.4.1 cpDNA多样性和种群结构 | 第23-31页 |
| 2.4.2 nrDNA多样性和种群结构 | 第31-34页 |
| 2.4.3 生态位模型推论气候适宜性 | 第34-35页 |
| 2.5 讨论 | 第35-38页 |
| 2.5.1 遗传多样性和空间种群遗传结构 | 第35-36页 |
| 2.5.2 连翘亲缘地理历史的推论 | 第36-38页 |
| 2.6 小结 | 第38-39页 |
| 3 SSR引物开发 | 第39-43页 |
| 3.1 前言 | 第39页 |
| 3.2 材料和方法 | 第39-42页 |
| 3.2.1 微卫星标记的分离 | 第39-40页 |
| 3.2.2 PCR扩增和基因分型 | 第40页 |
| 3.2.3 数据分析 | 第40-42页 |
| 3.3 结论和讨论 | 第42-43页 |
| 4 连翘的景观遗传学研究 | 第43-53页 |
| 4.1 引言 | 第43页 |
| 4.2 材料与方法 | 第43-46页 |
| 4.2.1 样品采集 | 第43-44页 |
| 4.2.2 DNA提取及PCR扩增 | 第44-45页 |
| 4.2.3 数据分析 | 第45-46页 |
| 4.3 结论 | 第46-50页 |
| 4.3.1 连翘的遗传多样性 | 第46-47页 |
| 4.3.2 连翘的遗传分化 | 第47-50页 |
| 4.4 讨论 | 第50-52页 |
| 4.4.1 连翘的遗传多样性 | 第50-51页 |
| 4.4.2 种群空间遗传结构 | 第51-52页 |
| 4.4.3 保育遗传学的启示 | 第52页 |
| 4.5 总结 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-67页 |
| 附表 | 第67-76页 |
| 附录 | 第76-77页 |
| 英文摘要 | 第77-78页 |
