中文摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第一章 绪论 | 第9-21页 |
1.1 引言 | 第9页 |
1.2 蛋白激酶 CK2 | 第9-12页 |
1.2.1 蛋白激酶 CK2 的结构 | 第10-11页 |
1.2.2 蛋白激酶 CK2 的细胞功能 | 第11页 |
1.2.3 蛋白激酶 CK2 与癌症 | 第11-12页 |
1.2.4 蛋白激酶 CK2 的抑制剂 | 第12页 |
1.3 蛋白激酶 PAK4 | 第12-15页 |
1.3.1 蛋白激酶 PAK4 的结构特点 | 第12-13页 |
1.3.2 蛋白激酶 PAK4 激活的机制 | 第13-14页 |
1.3.3 蛋白激酶 PAK4 的生物学功能 | 第14页 |
1.3.4 蛋白激酶 PAK4 在肿瘤中的功能 | 第14页 |
1.3.5 蛋白激酶 PAK4 作为药物靶点 | 第14-15页 |
1.4 癌症的治疗 | 第15页 |
1.5 计算机辅助药物分子设计方法 | 第15页 |
1.6 本课题的立题依据、意义及研究内容 | 第15-16页 |
1.6.1 立题依据和意义 | 第15-16页 |
1.6.2 研究内容 | 第16页 |
参考文献 | 第16-21页 |
第二章 蛋白激酶 CK2 与抑制剂 CX-4945 及衍生物相互作用的研究 | 第21-53页 |
2.1 引言 | 第21-22页 |
2.2 材料和方法 | 第22-27页 |
2.2.1 分子对接 | 第22-25页 |
2.2.2 分子动力学模拟 | 第25-26页 |
2.2.3 MM/GBSA 和 MM/PBSA 结合自由能计算 | 第26-27页 |
2.2.4 MM/GBSA 结合自由能分解 | 第27页 |
2.3 结果与讨论 | 第27-42页 |
2.3.1 通过分子对接的方法得到抑制剂/CK2 复合物模型 | 第27-30页 |
2.3.2 分子动力学模拟 | 第30-33页 |
2.3.3 MM/GBSA 和 MM/PBSA 结合自由能计算 | 第33-34页 |
2.3.4 MM/GBSA 结合自由能分解分析 | 第34-40页 |
2.3.5 蛋白激酶 CK2 抑制剂的合理设计 | 第40-42页 |
2.4 本章小结 | 第42页 |
参考文献 | 第42-53页 |
第三章 基于蛋白激酶 PAK4 结构的小分子抑制剂筛选 | 第53-62页 |
3.1 引言 | 第53-54页 |
3.2 理论计算与实验方法 | 第54-57页 |
3.2.1 基于计算机的虚拟筛选方法 | 第54-55页 |
3.2.2 生物实验的材料、试剂和设备 | 第55-56页 |
3.2.3 基于激酶活性的测定筛选 | 第56-57页 |
3.2.4 基于细胞活性的测定筛选 | 第57页 |
3.3 结果与讨论 | 第57-60页 |
3.3.1 虚拟筛选 | 第57-58页 |
3.3.2 激酶活性测试 | 第58-59页 |
3.3.3 细胞活性测试 | 第59-60页 |
3.4 本章小结 | 第60页 |
参考文献 | 第60-62页 |
第四章 总结 | 第62-64页 |
攻读学位期间本人出版或公开发表的论著、论文 | 第64-65页 |
致谢 | 第65-66页 |