影响多聚腺苷化效能的全基因组SNPs的提取方法
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| Content | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-27页 |
| 1.1 研究背景 | 第11-19页 |
| 1.1.1 生物信息学 | 第11-12页 |
| 1.1.2 中心法则 | 第12-13页 |
| 1.1.3 基因表达 | 第13-15页 |
| 1.1.4 多聚腺苷化 | 第15-17页 |
| 1.1.5 单核苷酸多态性 | 第17-19页 |
| 1.2 研究现状 | 第19-23页 |
| 1.2.1 Poly(A)的研究现状 | 第19-21页 |
| 1.2.2 SNPs的研究现状 | 第21-23页 |
| 1.3 本文内容 | 第23-24页 |
| 1.4 本文结构 | 第24-27页 |
| 第二章 提取影响多聚腺苷化效能的全基因组SNPs | 第27-41页 |
| 2.1 分析流程 | 第27-31页 |
| 2.1.1 实现步骤 | 第28-29页 |
| 2.1.2 实现环境 | 第29-31页 |
| 2.2 提取影响poly(A)信号的SNPs | 第31-33页 |
| 2.3 多聚腺苷化效能评估 | 第33-38页 |
| 2.3.1 GHMM框架 | 第33-34页 |
| 2.3.2 GHMM模型设计 | 第34-36页 |
| 2.3.3 计算预测分值差异 | 第36-38页 |
| 2.4 SNPs分类 | 第38-39页 |
| 2.5 本章小结 | 第39-41页 |
| 第三章 结果分析与讨论 | 第41-55页 |
| 3.1 实验数据 | 第41-42页 |
| 3.2 数据分析结果 | 第42-48页 |
| 3.2.1 Poly(A)位点周围的SNPs分布 | 第42-43页 |
| 3.2.2 影响poly(A)信号的SNPs分布 | 第43-44页 |
| 3.2.3 SNPs改变poly(A)信号的形式 | 第44-46页 |
| 3.2.4 评价指标D值的分布 | 第46-48页 |
| 3.3 SNPs的分类结果 | 第48-51页 |
| 3.4 与其他方法的比较 | 第51-52页 |
| 3.4.1 Thomas方法 | 第51-52页 |
| 3.4.2 结果比较 | 第52页 |
| 3.5 本章小结 | 第52-55页 |
| 第四章 总结与展望 | 第55-58页 |
| 4.1 全文总结 | 第55-56页 |
| 4.2 后续展望 | 第56-58页 |
| 附录 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-66页 |
| 攻读硕士期间所发表论文与参与项目 | 第66-67页 |
| 致谢 | 第67页 |
