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MiR15a/16对HBV复制的调节作用及HBV所编码的蛋白质HBx反向调节microRNA表达的研究

摘要第12-14页
Abstract第14-15页
第一章 序言第16-46页
    1. MicroRNA简介第16-28页
        1.1 MicroRNA的定义和基本特征第16-17页
        1.2 microRNA的发现第17-18页
        1.3 microRNA的命名第18-19页
        1.4 microRNA的生物合成第19-20页
        1.5 microRNA的作用机制和生物学功能第20-28页
            1.5.1 microRNA调控基因的作用机制第20-24页
            1.5.2 miRNA的正向调控和可逆的抑制第24-25页
            1.5.3 P-body,Stress Granules(SG),Multivesicular Bodies和Endosomes在miRNA介导基因表达沉默中的功能第25-26页
            1.5.4 microRNA的生物学功能第26-28页
    2. 乙肝病毒(HBV)简介第28-36页
        2.1 肝病毒(HBV)的定义和基本特征第28-31页
        2.2 乙肝病毒(HBV)所编码蛋白的生物学功能第31-34页
            2.2.1 表面蛋白(S蛋白)的生物学功能第31-32页
            2.2.2 核心蛋白(C蛋白)和e抗原(HBeAg)的生物学功能第32页
            2.2.3 聚合酶P蛋白的生物学功能第32-33页
            2.2.4 X蛋白的生物学功能第33-34页
        2.3 HBV相关疾病以及相关治疗的近况和进展第34-36页
    3. microRNA与病毒之间的网络调控作用第36-44页
        3.1 microRNA对病毒的调控作用第36页
        3.2 病毒自身编码的microRNA对其自身复制以及宿主的调控作用第36-40页
            3.2.1 病毒自身编码的microRNA(vmiRNA)第36-38页
            3.2.2 病毒编码的microRNA对病毒自身编码的基因表达,转录本RNA以及复制的调控作用第38页
            3.2.3 病毒自身编码的microRNA对宿主mRNA的调控作用第38-40页
        3.3 病毒对microRNA的调节作用第40页
        3.4 miRNA在相关肝疾病中作用第40-42页
        3.5 microRNA与HBV病毒的复制以及由其感染所引发的肝癌疾病中等相互调控作用的研究进展第42-44页
            3.5.1 miRNA调控乙肝病毒HBV的复制第42-43页
            3.5.2 miRNA与肝炎病毒导致的HCC第43-44页
    4. miR15a/16的生物学功能第44-45页
    5. 本课题的研究内容及意义第45-46页
        5.1 本课题的研究内容第45页
        5.2 本课题的研究意义第45-46页
第二章 材料与方法第46-72页
    1. 材料第46-56页
        1.1 实验所用到的菌株,质粒和细胞系第46页
        1.2 实验中所用到主要的生化试剂以及来源第46页
        1.3 分子克隆相关实验中所用到的酶和试剂盒及来源第46-47页
        1.4 分子克隆和生化实验等相关实验中所用到溶液及配置第47-50页
            1.4.1 制备感受态细胞以及检测所用的溶液及配置第47-48页
            1.4.2 SDS碱裂解法提取质粒所用的溶液及配置第48页
            1.4.3 核酸电泳以及蛋白质电泳所用到的溶液及配置第48-50页
        1.5 细胞实验中所用到的试剂来源以及所用的溶液的配置第50-51页
            1.5.1 试剂第50-51页
            1.5.2 细胞实验中所用到溶液的配置第51页
        1.6 本实验中所用到的引物第51-54页
        1.7 本实验所用到RNA oligo第54页
        1.8 本实验中所构建的质粒第54-55页
        1.9 本实验用到的仪器第55页
        1.10 绘图软件第55-56页
        1.11 分析软件第56页
    2. 方法第56-72页
        2.1 普通克隆的构建方法第56页
        2.2 制备大肠杆菌(E.coli DH5α)感受态细胞以及检测转化效率第56-57页
            2.2.1 受体菌的活化培养第56页
            2.2.2 感受态细胞的制备第56-57页
            2.2.3 感受态细胞转化效率的检测第57页
        2.3 SDS碱裂解法质粒DNA的制备(分子克隆所用)第57-58页
        2.4 超纯质粒的制备(细胞转染所用)第58页
        2.5 从DMEM培养液中提取HBV病毒颗粒(以24孔板为例)第58-59页
        2.6 乙型肝炎病毒(HBV)表面抗原的检测(酶联免疫法)第59页
        2.7 细胞实验操作第59-63页
            2.7.1 细胞的复苏第59-60页
            2.7.2 细胞传代培养第60页
            2.7.3 细胞转染第60-62页
            2.7.4 细胞冻存第62-63页
        2.8 RT-PCR第63-64页
            2.8.1 RNA的提取(以24孔的培养板为例)第63页
            2.8.2 基因组DNA的消解第63页
            2.8.3 RNA的逆转录第63-64页
            2.8.4 用制备好的cDNA为模板进行PCR第64页
        2.9 荧光定量PCR第64-65页
            2.9.1 标准样品的制备第64页
            2.9.2 样品及标准样品的扩增第64-65页
        2.10 Western blot第65-70页
            2.10.1 蛋白样品的制备一第65页
            2.10.2 蛋白样品的制备二(从TRIzol中提取蛋白)第65-66页
            2.10.3 蛋白含量的测定第66-67页
            2.10.4 SDS-PAGE电泳第67-68页
            2.10.5 转膜第68-69页
            2.10.6 免疫反应第69页
            2.10.7 化学发光,显影,定影第69-70页
            2.10.8 凝胶图像定量分析第70页
        2.11 双色荧光的检测第70-72页
            2.11.1 细胞样品的处理第70-71页
            2.11.2 荧光素酶活性的测定第71-72页
第三章 结果与讨论第72-86页
    1. 结果第72-83页
        1.1 microRNA与HBV病毒之间存在重要的相互作用第72-74页
            1.1.1 miRNApathway参与并影响HBV的复制第72-73页
            1.1.2 HBV侵染宿主细胞之后,miRNA表达水平的变化第73-74页
        1.2 miR15a/16抑制HBV增殖第74-77页
            1.2.1 预测miR15a在HBV基因组上潜在的靶标信息第74-75页
            1.2.2 miR-15a抑制HBV复制第75-77页
        1.3 miR-15a分别靶定在HBx和HBp的CDS区域第77-80页
            1.3.1 荧光素酶报告基因证实miR-15a对靶定在HBx和HBp的重叠区域的调控第77-78页
            1.3.2 荧光索酶报告检测证实miR-15a对靶定在HBp区域的靶标位点的调控第78-79页
            1.3.3 miR-15a对HBx蛋白的调节第79-80页
        1.4 HBx可以调节miRNA的表达第80-83页
    2. 讨论第83-86页
第四章 研究工作总结与展望第86-87页
参考文献第87-95页
致谢第95页

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