摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
1 文献综述 | 第14-25页 |
前言 | 第14页 |
1.1 山羊绒毛生长及毛囊的发育规律 | 第14-17页 |
1.1.1 绒山羊毛被生长特点 | 第15页 |
1.1.2 毛囊的生物学基础 | 第15-17页 |
1.2 甲状腺激素受体 | 第17-21页 |
1.2.1 甲状腺激素受体概述 | 第17页 |
1.2.2 TR的分类 | 第17-18页 |
1.2.3 TR的分子结构 | 第18-19页 |
1.2.4 甲状腺激素对绒山羊被毛生长的影响 | 第19-20页 |
1.2.5 TR的表达及多态性研究 | 第20-21页 |
1.3 毛囊皮脂腺单位 | 第21-22页 |
1.4 细胞视黄酸结合蛋白基因 | 第22-24页 |
1.4.1 CRABPs的分类 | 第22-23页 |
1.4.2 CRABPⅡ在皮肤组织中的作用 | 第23-24页 |
1.4.3 CRABPⅡ的表达与多态性 | 第24页 |
1.5 本研究的目的与意义 | 第24-25页 |
2. 试验材料与方法 | 第25-38页 |
2.1 试验材料 | 第25页 |
2.1.1 皮肤组织样品 | 第25页 |
2.1.2 血液样品 | 第25页 |
2.2 仪器与试剂 | 第25-27页 |
2.2.1 主要仪器设备 | 第25-26页 |
2.2.2 主要试剂盒与试剂 | 第26页 |
2.2.3 主要试剂的配制 | 第26-27页 |
2.3 试验方法 | 第27-37页 |
2.3.1 总RNA的提取及检测 | 第27-28页 |
2.3.1.1 提取前准备 | 第27-28页 |
2.3.1.2 总RNA提取 | 第28页 |
2.3.1.3 总RNA质量和浓度的检测 | 第28页 |
2.3.2 cDNA第一条链合成 | 第28-29页 |
2.3.3 TRα和CRABPⅡ基因的克隆 | 第29-31页 |
2.3.3.1 TRα和CRABPⅡ基因克隆引物的设计和合成 | 第29页 |
2.3.3.2 RT-PCR扩增 | 第29-30页 |
2.3.3.3 TRα和CRABPⅡ基因RT-PCR产物胶回收 | 第30页 |
2.3.3.4 TRα和CRABPⅡ基因RT-PCR胶回收产物与载体的连接 | 第30页 |
2.3.3.5 连接产物的转化 | 第30-31页 |
2.3.3.6 菌落筛选 | 第31页 |
2.3.3.7 菌液PCR测序 | 第31页 |
2.3.3.8 菌液PCR测序结果生物信息学分析 | 第31页 |
2.3.4 TRα和CRABPⅡ基因在内蒙古绒山羊胚胎皮肤中的表达研究 | 第31-33页 |
2.3.4.1 实时荧光定量引物设计 | 第31-32页 |
2.3.4.2 实时荧光定量PCR | 第32-33页 |
2.3.5 TRα和CRABPⅡ基因的单核苷酸多态性研究 | 第33-37页 |
2.3.5.1 血液基因组DNA的提取 | 第33页 |
2.3.5.2 山羊基因组DNA的浓度和纯度检测 | 第33-34页 |
2.3.5.3 TRα和CRABPⅡ基因的SNPs检测 | 第34-35页 |
2.3.5.4 PCR-RFLP | 第35-37页 |
2.4 数据处理 | 第37-38页 |
2.4.1 TRα和CRABPⅡ基因相对表达量数据处理 | 第37页 |
2.4.2 TRα和CRABPⅡ基因基因频率和基因型频率计算 | 第37-38页 |
2.4.2.1 等位基因频率和基因型频率 | 第37页 |
2.4.2.2 群体Hardy-Weinberg平衡状态的检验 | 第37页 |
2.4.2.3 遗传多样性分析 | 第37-38页 |
2.4.3 基因多态位点与南江黄羊生长性状的相关分析 | 第38页 |
3 试验结果与分析 | 第38-62页 |
3.1 总RNA的提取与检测 | 第38-39页 |
3.2 RT-PCR扩增结果 | 第39页 |
3.3 目的片段测序结果 | 第39页 |
3.4 TRα和CRABPⅡ基因CDS区序列生物信息学分析 | 第39-46页 |
3.4.1 CDS区序列分析 | 第39-41页 |
3.4.2 基于TRα和CRABPⅡ蛋白的系统发育分析 | 第41-42页 |
3.4.3 TRα和CRABPⅡ理化性质分析 | 第42页 |
3.4.4 TRα和CRABPⅡ磷酸化位点分析 | 第42-43页 |
3.4.5 TRα和CRABPⅡ疏水性分析 | 第43-44页 |
3.4.6 TRα和CRABPⅡ二级结构预测 | 第44页 |
3.4.7 TRα和CRABPⅡ保守结构域预测 | 第44-45页 |
3.4.8 TRα和CRABPⅡ功能位点预测 | 第45-46页 |
3.5 TRα和CRABPⅡ基因的组织表达 | 第46-49页 |
3.5.1 实时荧光定量引物验证 | 第46页 |
3.5.2 实时荧光定量PCR标准曲线的建立 | 第46-47页 |
3.5.3 实时荧光定量PCR结果 | 第47页 |
3.5.4 TRα基因在内蒙古绒山羊皮肤组织不同日龄的表达研究 | 第47-48页 |
3.5.5 CRABPⅡ基因在内蒙古绒山羊皮肤组织不同日龄的表达研究 | 第48-49页 |
3.6 TRα和CRABPⅡ基因的多态检测 | 第49-62页 |
3.6.1 山羊基因组DNA的提取和检测 | 第49页 |
3.6.2 PCR扩增结果与分析 | 第49-50页 |
3.6.3 测序结果与分析 | 第50-53页 |
3.6.4 PCR产物酶切结果 | 第53-54页 |
3.6.4.1 山羊TRα基因C230T位点限制性酶切检测结果 | 第53页 |
3.6.4.2 山羊TRα基因G173A位点限制性酶切检测结果 | 第53-54页 |
3.6.5 不同基因型(基因)频率的分布与遗传特性分析 | 第54-55页 |
3.6.6 不同位点各基因型与部分生长性状的关联分析 | 第55-62页 |
3.6.6.1 南江黄羊TRα基因C230T位点与生长性状的相关分析 | 第55-57页 |
3.6.6.2 南江黄羊TRα基因G173A位点与生长性状的相关分析 | 第57-59页 |
3.6.6.3 C230T位点与G173A位点的基因型组合与生长性状的相关分析 | 第59-62页 |
4 讨论 | 第62-67页 |
4.1 关于试验皮肤组织样品的选取 | 第62页 |
4.2 TRα和CRABPⅡ基因的克隆与序列分析 | 第62-63页 |
4.3 TRα和CRABPⅡ基因在内蒙古绒山羊皮肤组织中的表达 | 第63-65页 |
4.4 TRα基因多态性分析及其与南江黄羊生长性状相关分析 | 第65-67页 |
5 结论 | 第67-68页 |
参考文献 | 第68-74页 |
致谢 | 第74页 |