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海参肠道微生物多样性分析及菌株s12~T褐藻胶裂解酶研究

摘要第12-14页
ABSTRACT第14-16页
缩略语词汇表第17-19页
第一章 绪论第19-31页
    1.1 海洋微生物研究概况第19-21页
        1.1.1 海洋微生物多样性第19页
        1.1.2 海洋动物肠道微生物资源第19-20页
        1.1.3 海洋微生物多样性的研究方法第20-21页
    1.2 褐藻胶第21-23页
        1.2.1 褐藻胶的来源第21-22页
        1.2.2 褐藻胶的结构第22页
        1.2.3 褐藻胶的性质和应用第22-23页
    1.3 褐藻胶的降解与褐藻寡糖第23-24页
        1.3.1 褐藻胶的降解方法第23页
        1.3.2 褐藻寡糖的活性与应用第23-24页
    1.4 褐藻胶裂解酶的研究现状第24-29页
        1.4.1 褐藻胶裂解酶的来源第24-25页
        1.4.2 褐藻胶裂解酶的分类第25页
        1.4.3 褐藻胶裂解酶的催化机制第25-26页
        1.4.4 褐藻胶裂解酶活性的检测方法第26-27页
        1.4.5 褐藻胶裂解酶的酶学性质第27-29页
        1.4.6 褐藻胶裂解酶的应用第29页
    1.5 本论文研究的立题依据与研究内容第29-31页
第二章 海参肠道微生物多样性分析第31-50页
    2.1 实验材料第31页
        2.1.1 实验样品第31页
        2.1.2 培养基和实验试剂第31页
        2.1.3 实验仪器第31页
    2.2 实验方法第31-33页
        2.2.1 样品的采集和处理第31-32页
        2.2.2 可培养微生物的多样性第32-33页
        2.2.3 海参肠道及海参养殖环境微生物群落结构第33页
    2.3 实验结果与分析第33-49页
        2.3.1 菌株分离及分类第33-40页
        2.3.2 可培养细菌的多样性分析第40-42页
        2.3.3 海参肠道及养殖环境微生物区系组成第42-49页
    2.4 本章小结第49-50页
第三章 海参肠道产褐藻胶裂解酶菌株的筛选第50-57页
    3.1 实验材料第50页
        3.1.1 实验菌株第50页
        3.1.2 培养基和实验试剂第50页
        3.1.3 实验仪器第50页
    3.2 实验方法第50-52页
        3.2.1 产褐藻胶裂解酶菌株的初筛第50页
        3.2.2 高产褐藻胶裂解酶菌株的验证第50-51页
        3.2.3 发酵过程中的酶活检测第51页
        3.2.4 酶活计算第51-52页
    3.3 实验结果与分析第52-56页
        3.3.1 产褐藻胶裂解酶菌株的初筛第52-53页
        3.3.2 产酶菌株的复筛第53-55页
        3.3.3 发酵过程中褐藻胶裂解酶的酶活变化第55-56页
    3.4 本章小结第56-57页
第四章 菌株s12~T褐藻胶裂解酶的异源表达及酶学性质研究第57-77页
    4.1 实验材料第57-58页
        4.1.1 实验菌株与质粒第57页
        4.1.2 培养基、缓冲液和实验试剂第57-58页
        4.1.3 实验仪器第58页
    4.2 实验方法第58-64页
        4.2.1 褐藻胶裂解酶的序列分析第58页
        4.2.2 褐藻胶裂解酶的异源表达第58-62页
        4.2.3 重组酶的纯化第62页
        4.2.4 重组酶的酶学性质检测第62-64页
    4.3 实验结果与分析第64-75页
        4.3.1 表达所用褐藻胶裂解酶基因的序列分析第64-66页
        4.3.2 褐藻胶裂解酶的异源表达第66-70页
        4.3.3 基因表达产物的活性检测第70页
        4.3.4 重组褐藻胶裂解酶的纯化第70-71页
        4.3.5 重组酶的酶学性质检测第71-75页
    4.4 本章小结第75-77页
第五章 三株海洋新菌的多相分类鉴定第77-111页
    5.1 实验材料第77页
        5.1.1 菌株第77页
        5.1.2 培养基和试剂第77页
        5.1.3 实验仪器第77页
    5.2 实验方法第77-83页
        5.2.1 16S rRNA基因序列克隆分析第77-78页
        5.2.2 基因组测序分析第78页
        5.2.3 系统发育分析第78页
        5.2.4 多位点序列分析(MLSA)第78页
        5.2.5 菌株的表型和生理生化特征分析第78-81页
        5.2.6 细菌细胞化学组分测定第81-83页
        5.2.7 菌种保藏第83页
    5.3 实验结果与分析第83-110页
        5.3.1 白色弧菌(Vibrio albus sp. nov.)E4404~T的多相分类鉴定第83-90页
        5.3.2 舌齿鲈海棍菌(Pelagivirga dicentrarchi sp. nov.)YLY04~T的多相分类鉴定第90-96页
        5.3.3 沉积物卢金星菌(Lujinxingia sediminis sp. nov.)SEH01~T的多相分类鉴定第96-110页
    5.4 本章小结第110-111页
第六章 全文总结与展望第111-113页
    6.1 全文总结第111-112页
    6.2 展望第112-113页
附录第113-125页
    附录一 本文所使用的培养基、试剂配方第113-118页
    附录二 实验使用的主要仪器第118-119页
    附录三 本文部分实验数据及相关方法第119-125页
参考文献第125-135页
致谢第135-136页
资助情况第136-137页
攻读学位期间发表和撰写的学术论文目录第137-138页
附件第138页

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