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红麻叶片全长cDNA文库的构建及ESTs分析

摘要第8-10页
Abstract第10-11页
第一章 文献综述第12-18页
    1.1 红麻概述第12-13页
        1.1.1 红麻起源第12页
        1.1.2 红麻的综合利用第12-13页
    1.2 cDNA文库概述第13-15页
        1.2.1 全长cDNA文库第13-14页
        1.2.2 全长cDNA文库的构建方法第14页
        1.2.3 cDNA文库的应用前景及技术的局限性第14-15页
            1.2.3.1 cDNA文库的应用第14-15页
            1.2.3.2 cDNA文库的局限性第15页
    1.3 EST概述第15-17页
        1.3.1 EST技术简介第15页
        1.3.2 EST序列分析软件第15-16页
        1.3.3 EST技术应用第16-17页
        1.3.4 EST技术的局限性第17页
    1.4 课题学术及研究意义第17页
    1.5 创新之处第17-18页
第二章 红麻叶片总RNA的提取第18-27页
    2.1 材料第18页
    2.2 主要仪器第18页
    2.3 试剂及用具器皿的处理第18-19页
    2.4 总RNA的提取第19-21页
        2.4.1 Trizol法参照杨成君方法并加以改良第19页
        2.4.2 蛋白酶K法参照武耀廷法并加以改良第19-20页
        2.4.3 SDS法参照杨成君法并加以改良第20页
        2.4.4 CTAB法参照胡根海法并加以改良第20-21页
        2.4.5 试剂盒法第21页
    2.5 琼脂糖凝胶电泳检测第21页
    2.6 紫外分光光度计检测第21页
    2.7 结果与讨论第21-25页
        2.7.1 结果第21-23页
        2.7.2 讨论第23-25页
            2.7.2.1 Trizol法第23-24页
            2.7.2.2 热硼酸法第24页
            2.7.2.3 SDS法第24-25页
            2.7.2.4 CTAB法第25页
            2.7.2.5 试剂盒法第25页
    2.8 本章小结第25-27页
第三章 红麻叶片全长cDNA文库的构建第27-38页
    3.1 实验材料与菌株第27页
    3.2 主要仪器和试剂第27页
        3.2.1 主要仪器第27页
        3.2.2 实验主要试剂第27页
    3.3 实验方法第27-28页
    3.4 实验步骤第28-32页
        3.4.1 高质量红麻叶片总RNA的提取第28页
        3.4.2 红麻叶片cDNA第一链的合成第28-29页
        3.4.3 红麻叶片cDNA第二链的合成第29-30页
        3.4.4 双链cDNA的纯化第30页
            3.4.4.1 方案1:蛋白酶K消化第30页
            3.4.4.2 方案2:使用PCR产物纯化试剂盒第30页
        3.4.5 cDNA片段的分级分离第30页
            3.4.5.1 方案1:使用CHROMA SPIN-400柱进行分级分离第30页
            3.4.5.2 方案2:使用回收试剂盒进行分级分离第30页
        3.4.6 载体连接与转化第30-31页
            3.4.6.1 载体连接第30页
            3.4.6.2 转化第30-31页
        3.4.7 初始文库滴度测定与文库扩增及保存第31页
        3.4.8 菌液PCR第31-32页
    3.5 结果分析第32-35页
        3.5.1 红麻叶片总RNA提取结果第32页
        3.5.2 红麻叶片cDNA第一链的合成结果第32-33页
        3.5.3 红麻叶片cDNA第二链的合成结果第33页
        3.5.4 双链cDNA纯化结果第33-34页
        3.5.5 红麻cDNA片段分级分离结果第34页
        3.5.6 cDNA文库质量检测结果第34-35页
            3.5.6.1 文库滴度测定结果第34-35页
            3.5.6.2 菌液PCR结果第35页
    3.6 讨论第35-36页
        3.6.1 总RNA的提取第35-36页
        3.6.2 双链cDNA的合成第36页
        3.6.3 双链cDNA的纯化与分级分离第36页
        3.6.4 双链cDNA的连接与转化第36页
    3.7 本章小结第36-38页
第四章 EST测序及分析第38-47页
    4.1 实验材料与仪器第38页
        4.1.1 实验材料第38页
        4.1.2 实验仪器第38页
    4.2 实验方法第38页
        4.2.1 单克隆的获得第38页
        4.2.2 测序第38页
        4.2.3 生物信息学分析第38页
    4.3 结果与分析第38-45页
        4.3.1 红麻叶片EST序列基本特征分析第39-40页
        4.3.2 同源序列比较与功能注释分析第40-42页
        4.3.3 红麻叶片EST同源序列物种来源第42-43页
        4.3.4 红麻叶片EST序列的基因GO分类结果第43-45页
    4.4 讨论第45页
        4.4.1 单克隆的获得第45页
        4.4.2 文库序列特征分析第45页
        4.4.3 unigene的同源序列比对及功能分析第45页
        4.4.4 红麻叶片EST序列的基因GO分类第45页
    4.5 本章小结第45-47页
第五章 结论与展望第47-48页
    5.1 结论第47页
    5.2 展望第47-48页
参考文献第48-55页
附录1第55-56页
附录2第56-58页
附录3第58-59页
附录4第59-61页
致谢第61页

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