| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 第一章 综述 | 第10-20页 |
| 1.1 蜱类内共生菌研究概况 | 第10-12页 |
| 1.1.1 CandidatusM.mitochondrii | 第11页 |
| 1.1.2 类立克次体 | 第11页 |
| 1.1.3 类沃尔巴克氏体 | 第11页 |
| 1.1.4 类杀雄菌 | 第11-12页 |
| 1.1.5 类考克斯体 | 第12页 |
| 1.1.6 类弗朗西斯氏体 | 第12页 |
| 1.2 蜱传病原体研究概况 | 第12-16页 |
| 1.2.1 疏螺旋体 | 第13页 |
| 1.2.2 立克次体 | 第13-14页 |
| 1.2.3 无形体 | 第14页 |
| 1.2.4 考克斯体 | 第14页 |
| 1.2.5 埃立克体 | 第14页 |
| 1.2.6 弗朗西斯菌 | 第14-15页 |
| 1.2.7 病毒 | 第15-16页 |
| 1.2.8 原生动物 | 第16页 |
| 1.3 微生物分子生态学研究技术 | 第16-19页 |
| 1.3.1 细菌16SrRNA基因克隆文库 | 第16-17页 |
| 1.3.2 PCR-RFLP | 第17页 |
| 1.3.3 PCR-DGGE | 第17页 |
| 1.3.4 实时定量PCR | 第17-18页 |
| 1.3.5 高通量测序技术 | 第18-19页 |
| 1.4 研究意义和展望 | 第19-20页 |
| 第二章 日本锐蜱微生物多样性分析 | 第20-32页 |
| 2.1 材料与方法 | 第20-23页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第20页 |
| 2.1.2 主要实验仪器与试剂 | 第20页 |
| 2.1.3 微生物16SrRNA基因测序及分析流程 | 第20-22页 |
| 2.1.4 生物信息学分析 | 第22-23页 |
| 2.1.5 序列分析及构建系统发育树 | 第23页 |
| 2.2 实验结果 | 第23-30页 |
| 2.2.1 OTU统计 | 第23页 |
| 2.2.2 稀释曲线 | 第23-24页 |
| 2.2.3 群落多样性指数 | 第24页 |
| 2.2.4 物种丰富度预估 | 第24页 |
| 2.2.5 Alpha多样性指数分析 | 第24-25页 |
| 2.2.6 RankAbundance曲线 | 第25页 |
| 2.2.7 物种组成分析 | 第25-29页 |
| 2.2.8 立克次体16SrRNA基因系统发育分析 | 第29-30页 |
| 2.3 讨论 | 第30-32页 |
| 第三章 日本锐蜱细菌组成及内共生菌检测 | 第32-38页 |
| 3.1 材料与方法 | 第32-35页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第32页 |
| 3.1.2 主要实验仪器和试剂 | 第32页 |
| 3.1.3 DNA的提取 | 第32页 |
| 3.1.4 PCR扩增 | 第32-33页 |
| 3.1.5 目的基因的检测和纯化 | 第33页 |
| 3.1.6 基因克隆和阳性克隆的检测 | 第33-34页 |
| 3.1.7 PCR-RFLP | 第34页 |
| 3.1.8 序列分析 | 第34页 |
| 3.1.9 日本锐蜱内共生菌的检测 | 第34-35页 |
| 3.2 实验结果 | 第35-36页 |
| 3.2.1 日本锐蜱细菌组成 | 第35-36页 |
| 3.2.2 内共生菌的检测 | 第36页 |
| 3.3 讨论 | 第36-38页 |
| 第四章 日本锐蜱立克次体鉴定及病原体检测 | 第38-44页 |
| 4.1 材料与方法 | 第38-39页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第38页 |
| 4.1.2 主要实验仪器及试剂 | 第38页 |
| 4.1.3 DNA的提取 | 第38页 |
| 4.1.4 立克次体多位点序列分析 | 第38-39页 |
| 4.1.5 日本锐蜱病原体的检测 | 第39页 |
| 4.2 实验结果 | 第39-42页 |
| 4.2.1 立克次体感染率 | 第39-40页 |
| 4.2.2 立克次体鉴定 | 第40-42页 |
| 4.2.3 病原体的检测 | 第42页 |
| 4.3 讨论 | 第42-44页 |
| 第五章 总结和展望 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-58页 |
| 个人简介 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59页 |
