| 中文摘要 | 第8-11页 |
| Abstact | 第11-13页 |
| 英文缩略词表 | 第17-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-37页 |
| 1 内阿米巴原虫种类/基因型鉴定 | 第18-26页 |
| 1.1 肠道内阿米巴原虫的种类及基因分型 | 第18-21页 |
| 1.2 内阿米巴原虫分子检测方法 | 第21-23页 |
| 1.3 基因分型方法 | 第23-24页 |
| 1.4 非人灵长类内阿米巴原虫的流行情况 | 第24-25页 |
| 1.5 小结 | 第25-26页 |
| 2 贾第虫种类/基因型及其基因分型方法 | 第26-31页 |
| 2.1 种类/基因型概况 | 第26页 |
| 2.2 十二指肠贾第虫集聚体 | 第26-27页 |
| 2.3 基因分型工具 | 第27-28页 |
| 2.4 主要动物十二指肠贾第虫流行情况 | 第28-31页 |
| 3 毕氏肠微孢子虫分子流行病学研究进展 | 第31-36页 |
| 3.1 微孢子虫的生活史 | 第31页 |
| 3.2 毕氏肠微孢子虫基因分型工具 | 第31-32页 |
| 3.3 人毕氏肠微孢子虫流行情况 | 第32-34页 |
| 3.4 主要动物毕氏肠微孢子虫流行情况 | 第34-35页 |
| 3.5 我国毕氏肠微孢子虫研究概况 | 第35-36页 |
| 4 结语 | 第36-37页 |
| 第二章 非人灵长类肠道内阿米巴原虫流行病学调查 | 第37-45页 |
| 1 引言 | 第37页 |
| 2 材料与方法 | 第37-39页 |
| 2.1 样品来源 | 第37页 |
| 2.2 试剂配制 | 第37-38页 |
| 2.3 实验器材 | 第38页 |
| 2.4 显微镜检查方法 | 第38-39页 |
| 2.5 虫种鉴定记录 | 第39页 |
| 3 结果 | 第39-43页 |
| 3.1 不同地区非人灵长类肠道内阿米巴原虫感染情况 | 第39页 |
| 3.2 不同生活方式下非人灵长类肠道内阿米巴原虫感染情况 | 第39页 |
| 3.3 不同年龄段非人灵长类肠道内阿米巴原虫感染情况 | 第39-41页 |
| 3.4 不同种类非人灵长类肠道内阿米巴原虫感染情况 | 第41-42页 |
| 3.5 卵囊形态 | 第42-43页 |
| 4 讨论 | 第43-45页 |
| 第三章 非人灵长类肠道内阿米巴原虫种类分布及种系发育研究 | 第45-58页 |
| 1 引言 | 第45页 |
| 2 材料与方法 | 第45-48页 |
| 2.1 肠道内阿米巴阳性样品 | 第45页 |
| 2.2 肠道内阿米巴原虫包囊处理 | 第45页 |
| 2.3 DNA提取 | 第45-46页 |
| 2.4 肠道内阿米巴原虫基于SSU rRNA基因的分子鉴定 | 第46-48页 |
| 2.4.1 基于SSU rRNA基因的PCR扩增 | 第46页 |
| 2.4.2 PCR扩增产物的检测 | 第46页 |
| 2.4.3 PCR扩增产物的序列测定 | 第46-47页 |
| 2.4.4 种系发育分析 | 第47-48页 |
| 3 结果 | 第48-55页 |
| 3.1 基于SSU rRNA基因PCR扩增结果 | 第48-50页 |
| 3.2 不同地区肠道内阿米巴原虫种类分布情况 | 第50页 |
| 3.3 部分PCR扩增阳性样品序列比对与种系发育分析 | 第50-55页 |
| 4 讨论 | 第55-58页 |
| 4.1 非人灵长类肠道内阿米巴原虫的种类及重要性 | 第55-56页 |
| 4.2 不同地区非人灵长类内阿米巴原虫的种类 | 第56页 |
| 4.3 非人灵长类内阿米巴原虫基于SSU rRNA的扩增效率分析 | 第56-57页 |
| 4.4 E.dispar和E.coli序列比对与种系发育分析 | 第57-58页 |
| 第四章 犬猫十二指肠贾第虫分子流行病学研究 | 第58-71页 |
| 1 引言 | 第58页 |
| 2 材料与方法 | 第58-61页 |
| 2.1 样品来源 | 第58页 |
| 2.2 DNA提取 | 第58页 |
| 2.3 十二指肠贾第虫的分子鉴定方法 | 第58-61页 |
| 2.3.1 基因的选择及引物设计 | 第58-59页 |
| 2.3.2 PCR扩增产物的检测 | 第59页 |
| 2.3.3 PCR扩增产物的测序 | 第59页 |
| 2.3.4 序列比对及种系发育分析 | 第59-61页 |
| 3 结果 | 第61-67页 |
| 3.1 基于Tpi和Bg基因PCR扩增结果 | 第61页 |
| 3.2 十二指肠贾第虫基于Tpi基因的基因型鉴定结果及种系发育分析 | 第61-64页 |
| 3.3 十二指肠贾第虫基于Bg基因的基因型鉴定结果及种系发育分析 | 第64-65页 |
| 3.4 不同来源犬和猫十二指肠贾第虫基因型分布及其感染的优势基因型 | 第65-67页 |
| 4 讨论 | 第67-71页 |
| 4.1 关于犬猫感染十二指肠贾第虫的基因型分布情况 | 第67页 |
| 4.2 不同饲养环境条件下犬猫贾第虫分布情况 | 第67-71页 |
| 第五章 犬猫毕氏肠微孢子虫基因型分布研究 | 第71-80页 |
| 1 引言 | 第71页 |
| 2 材料与方法 | 第71-74页 |
| 2.1 样品来源 | 第71页 |
| 2.2 DNA提取 | 第71页 |
| 2.3 毕氏肠微孢子虫分子鉴定 | 第71-74页 |
| 2.3.1 基因的选择及引物设计 | 第71-72页 |
| 2.3.2 PCR的扩增及扩增产物的检测 | 第72页 |
| 2.3.3 PCR扩增产物的测序 | 第72页 |
| 2.3.4 种系发育分析 | 第72-74页 |
| 3 结果 | 第74-77页 |
| 3.1 基于ITS基因毕氏肠微孢子虫PCR扩增结果 | 第74-75页 |
| 3.2 毕氏肠微孢子虫基因型及其分布情况 | 第75-76页 |
| 3.3 基于ITS基因的序列比对及种系发育分析 | 第76-77页 |
| 4 讨论 | 第77-80页 |
| 4.1 犬猫感染毕氏肠微孢子虫情况分析 | 第77页 |
| 4.2 犬猫感染的毕氏肠微孢子虫基因型及其分布情况分析 | 第77-80页 |
| 全文结论 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-104页 |
| 致谢 | 第104-106页 |
| 博士期间科研成果 | 第106-107页 |
