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蒙古马毛色性状相关基因多态性分析及组织表达研究

摘要第1-5页
Abstract第5-16页
1 引言第16-43页
   ·哺乳动物毛色形成的遗传机制第16-18页
   ·马的毛色及形成机制第18-20页
   ·与毛色形成有关的毛色基因第20-31页
     ·黑色素皮质激素受体1(Melanocortin 1 receptor,MC1R)基因第20-22页
     ·野灰位点信号蛋白(Agouti-signalling Protein,ASIP)基因第22-24页
     ·原癌(Proto-oncogene c-kit,KIT)基因第24-27页
     ·酪氨酸酶关联蛋白家族(Tyrosinase-related Protein,TYRP)基因第27-29页
     ·内皮素受体 B(Endothelins Receptor B,EDNRB)基因第29-30页
     ·突触融合蛋白17(Syntaxin-17,STX17)基因第30页
     ·膜相关转运蛋白(Membrane-associated transporter protein,MATP)基因第30-31页
     ·前黑色素体蛋白(Pre-melanosomal protein 17,PMEL17)基因第31页
   ·毛色遗传研究常用理论与技术手段第31-40页
     ·基因间互作效应分析方法第31-32页
     ·限制性酶切片段长度多态性第32-33页
     ·扩增片段长度多态性第33页
     ·单链构象多态性第33-34页
     ·巢式 PCR 技术第34页
     ·实时荧光定量 PCR(Real-time Quantitative PCR,QRT-PCR)第34-38页
     ·酶联免疫吸附剂测定第38-39页
     ·蛋白免疫印迹技术第39-40页
   ·本研究的目的、意义及主要研究内容第40-43页
     ·蒙古马毛色遗传研究的意义第40-41页
     ·本研究的主要内容与技术路线第41-43页
2 实验一 蒙古马MC1R 基因、ASIP 基因、TYRP1 基因、STX17 基因的多态性检测及与毛色表型相关性分析第43-73页
   ·实验材料第43-47页
     ·实验样品第43-44页
     ·仪器设备第44页
     ·主要试剂第44-46页
     ·菌株和克隆载体第46页
     ·主要试剂和溶液的配制第46-47页
     ·主要分子生物学软件及相关网站第47页
   ·实验方法第47-56页
     ·血液基因组 DNA 的提取第47-48页
     ·PCR 反应体系及过程第48-50页
     ·各基因多态性检测方法第50-52页
     ·不同基因型的克隆与测序第52-54页
     ·基因多态参数的统计分析方法第54-56页
   ·结果与分析第56-65页
     ·血液基因组 DNA 提取结果第56页
     ·各引物的 PCR 扩增结果第56-57页
     ·各基因的分型结果第57-59页
     ·重组质粒的筛选和鉴定结果第59页
     ·不同基因型重组质粒的测序结果分析第59-61页
     ·各基因多态位点群体遗传学分析第61-64页
     ·各基因多态位点与毛色表型相关性分析第64-65页
   ·讨论第65-73页
     ·MC1R 基因多态性与毛色表型的分析第65-67页
     ·ASIP 基因多态性与毛色表型的分析第67-68页
     ·TYRP1 基因多态性与毛色表型的分析第68-69页
     ·MC1R 基因、ASIP 基因、TYRP1 基因三者间的互作关系第69页
     ·STX17 基因多态性与毛色表型关系第69-70页
     ·内含子在基因表达中的重要作用第70-71页
     ·蒙古马毛色基因各多态位点的群体遗传学分析第71-73页
3 实验二 蒙古马MC1R 与ASIP 基因对皮肤反射系数影响的遗传效应剖分第73-82页
   ·材料和方法第73-75页
     ·实验材料第73页
     ·基因多态性检测及分型第73页
     ·统计分析方法第73-75页
   ·结果与分析第75-77页
     ·基因分型与 Hardy–Weinberg 平衡检测第75-76页
     ·遗传效应剖分结果第76-77页
     ·遗传方差剖分结果第77页
   ·讨论第77-82页
     ·关于皮肤反射系数的测量第77-78页
     ·关于 NOIA 模型的适用性第78-79页
     ·MC1R 基因与ASIP 基因的上位作用关系第79-80页
     ·毛色形成的遗传因素与环境因素第80-82页
4 实验三 蒙古马不同毛色相关基因的组织差异表达分析第82-105页
   ·实验材料第82页
     ·实验动物及其组织第82页
     ·主要仪器设备第82页
     ·主要试剂第82页
   ·实验方法第82-85页
     ·各组织总 RNA 的提取第82-83页
     ·QRT-PCR 反应第83-85页
     ·标准品的制备及标准曲线的制作第85页
     ·数据分析方法第85页
   ·结果与分析第85-95页
     ·蒙古马各组织总 RNA 的提取结果第85-86页
     ·蒙古马β-actin 及毛色相关基因的QRT-PCR 扩增结果分析第86-95页
   ·讨论第95-105页
     ·实时荧光定量 PCR 的特点第95页
     ·内参基因的选择第95-96页
     ·实时荧光定量 PCR 的引物设计第96页
     ·实时荧光定量 PCR 的结果评估第96-97页
     ·实时荧光定量 PCR 结果的数据分析方法第97页
     ·实验样品选择及基因表达量分析说明第97-98页
     ·毛色基因的表达量与毛色形成的关系第98-105页
5 实验四 蒙古马 MC1R 与 ASIP 蛋白在不同毛色皮肤和垂体组织中的差异表达研究第105-137页
   ·实验材料第105-106页
     ·实验动物第105页
     ·主要仪器和设备第105页
     ·主要试剂第105-106页
   ·实验步骤第106-114页
     ·MC1R 多克隆抗体制备方法第106-110页
     ·ASIP 多克隆抗体制备方法第110-114页
     ·Western blotting 检测MC1R 蛋白在组织中的差异表达情况第114页
   ·结果与分析第114-129页
     ·MC1R 多克隆抗体制备结果第114-122页
     ·ASIP 多克隆抗体制备结果第122-128页
     ·Western blotting 检测MC1R 蛋白在组织中的差异表达情况第128-129页
   ·讨论第129-137页
     ·关于抗原表位预测第129页
     ·关于抗原的制备第129-130页
     ·关于外源基因蛋白质表达第130-131页
     ·关于多克隆抗体制备第131-132页
     ·ELISA 实验中的注意事项第132页
     ·Western blotting 实验中的注意事项第132-133页
     ·关于本实验抗体制备的可靠性第133-134页
     ·MC1R 蛋白的差异表达与毛色表型的相关性第134-137页
6 结论、创新点及进一步研究的问题第137-140页
   ·结论第137-138页
   ·创新点第138页
   ·进一步研究的问题第138-140页
致谢第140-141页
参考文献第141-159页
作者简介第159页

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