| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 一 绪论 | 第10-15页 |
| 1.1 课题背景 | 第10页 |
| 1.2 研究地区概况 | 第10-12页 |
| 1.3 盐碱湖中微生物群落结构的研究现状 | 第12-13页 |
| 1.4 454焦磷酸高通量测序在环境微生物生态研究方面的应用 | 第13-14页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第14-15页 |
| 二 材料与方法 | 第15-26页 |
| 2.1 样品采集与采样地区 | 第15-17页 |
| 2.2 仪器设备 | 第17页 |
| 2.3 研究方法 | 第17-26页 |
| 2.3.1 水样中氯化钠(NaCl)浓度的测定 | 第17-21页 |
| 2.3.2 其他理化性状的测定 | 第21页 |
| 2.3.3 湖泊水体微生物基因组DNA的提取 | 第21-23页 |
| 2.3.4 目的基因的PCR扩增 | 第23-24页 |
| 2.3.5 扩增目的基因序列的高通量测序 | 第24页 |
| 2.3.6 有效序列长度的统计及优化 | 第24页 |
| 2.3.7 OTU分析 | 第24-25页 |
| 2.3.8 稀释曲线分析(Rarefaction curve) | 第25页 |
| 2.3.9 微生物群落结构分析 | 第25页 |
| 2.3.10 微生物多样性分析 | 第25-26页 |
| 三 细菌群落结构及多样性分析 | 第26-34页 |
| 3.1 主要结果 | 第26-32页 |
| 3.1.1 有效序列分析 | 第26-27页 |
| 3.1.2 OTU生成及比较 | 第27页 |
| 3.1.3 稀释性曲线 | 第27-28页 |
| 3.1.4 细菌群落多样性分析 | 第28-29页 |
| 3.1.5 门水平下细菌群落结构分析 | 第29-30页 |
| 3.1.6 属水平下细菌群落结构多样性 | 第30-31页 |
| 3.1.7 属水平Heatmap分析 | 第31-32页 |
| 3.2 讨论 | 第32-34页 |
| 四 古菌的群落多样性研究 | 第34-43页 |
| 4.1 主要结果 | 第34-41页 |
| 4.1.1 有效序列分析 | 第34-35页 |
| 4.1.2 OTU生成及比较 | 第35页 |
| 4.1.3 稀释性曲线 | 第35-36页 |
| 4.1.4 古菌群落多样性分析 | 第36页 |
| 4.1.5 门水平古菌群落结构分析 | 第36-39页 |
| 4.1.6 属水平古菌群落结构分析 | 第39页 |
| 4.1.7 属水平Heatmap分析 | 第39-41页 |
| 4.2 讨论 | 第41-43页 |
| 五 真菌群落多样性的研究 | 第43-52页 |
| 5.1 主要结果 | 第43-49页 |
| 5.1.1 有效序列的分析 | 第43-44页 |
| 5.1.2 OTU生成及比较 | 第44页 |
| 5.1.3 稀释性曲线 | 第44-45页 |
| 5.1.4 样品多样性指数分析 | 第45-46页 |
| 5.1.5 门水平真菌群落结构分析 | 第46-47页 |
| 5.1.6 属水平真菌群落结构分析 | 第47-48页 |
| 5.1.7 属水平Heatmap分析 | 第48-49页 |
| 5.2 讨论 | 第49-52页 |
| 六 结论与展望 | 第52-55页 |
| 6.1 结论 | 第52页 |
| 6.2 展望 | 第52-55页 |
| 参考文献 | 第55-60页 |
| 攻读硕士期间发表的学术论文 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |