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高产铁载体假单胞菌HYS铁载体合成调控机理研究

本研究工作的主要创新点第5-6页
目录第6-10页
摘要第10-13页
Abstract第13-15页
第1章 前言第16-43页
    1.1 铁载体是微生物获取铁的重要方式第16-18页
    1.2 铁载体生物合成及转运第18-23页
        1.2.1 铁载体生物合成第18-21页
        1.2.2 Fe~(3+)-铁载体复合物的转运第21-23页
    1.3 假单胞菌铁载体第23-31页
        1.3.1 假单胞菌铁载体种类多样性第23-28页
        1.3.2 假单胞菌铁载体利用的等级制度第28-30页
        1.3.3 假单胞菌TonB依赖的受体的多样性及异种铁载体的摄取第30-31页
    1.4 铁载体合成及转运的调控第31-34页
    1.5 GacS/GacA双组份调控系统第34-41页
        1.5.1 双组份调控系统第34-35页
        1.5.2 GacS/GacA双组份系统调控模型第35-37页
        1.5.3 GacS/GacA系统的生物学效应第37-41页
        1.5.4 GacS/GacA系统与铁载体的相关性第41页
    1.6 本研究的目的、内容和意义第41-43页
第2章 Pseudomonas sp.HYS高产铁载体合成突变株的筛选及基因鉴定第43-71页
    2.1 实验材料第43-47页
        2.1.1 菌株、质粒和引物第43-45页
        2.1.2 仪器和试剂第45页
        2.1.3 培养基和溶液配制第45-47页
    2.2 实验方法第47-55页
        2.2.1 质粒提取第47页
        2.2.2 一步法提质粒第47页
        2.2.3 假单胞菌基因组提取第47-48页
        2.2.4 大肠杆菌感受态制备及转化第48-49页
        2.2.5 铁载体的检测第49页
        2.2.6 生长曲线与铁载体分泌曲线的测定第49页
        2.2.7 HYS转座子插入突变株的构建第49-50页
        2.2.8 HYS铁载体合成突变株的筛选及鉴定第50页
        2.2.9 TAIL-PCR第50-53页
        2.2.10 半随机引物PCR第53-55页
        2.2.11 转座子挽救第55页
    2.3 实验结果与分析第55-67页
        2.3.1 HYS与其他假单胞菌产铁载体对比第55-57页
        2.3.2 HYS转座子突变库的构建及铁载体合成突变株的筛选鉴定第57-62页
        2.3.3 HYS铁载体合成突变株转座子插入基因定位与分析第62-67页
    2.4 讨论第67-70页
        2.4.1 转座子诱变法筛选相关基因的使用心得第67-68页
        2.4.2 铁载体合成突变株及相关基因的分析第68-70页
    2.5 小结第70-71页
第3章 GacS/GacA双组分系统对HYS铁载体合成调控的研究第71-99页
    3.1 实验材料第71-75页
        3.1.1 菌株、质粒和引物第71-74页
        3.1.2 仪器和试剂第74页
        3.1.3 培养基及溶液配制第74-75页
    3.2 实验方法第75-78页
        3.2.1 铁载体检测方法第75-76页
        3.2.2 铁载体紫外可见吸收光谱测定第76页
        3.2.3 细菌接合实验第76-77页
        3.2.4 基因敲除菌株构建第77-78页
        3.2.5 回补及过表达菌株的构建第78页
    3.3 实验结果与分析第78-95页
        3.3.1 HYS产生非荧光和荧光两类铁载体第78-82页
        3.3.2 GacS/GacA对HYS铁载体的调控作用第82-86页
        3.3.3 非荧光、荧光铁载体特性比较第86-92页
        3.3.4 Gac/Rsm通路对HYS铁载体的调控第92-95页
    3.4 讨论第95-97页
        3.4.1 HYS两类不同性质铁载体共存的意义第95-96页
        3.4.2 GacS/GacA双组份系统对HYS两类铁载体的调控作用第96-97页
    3.5 小结第97-99页
第4章 HYS高产铁载体相关基因簇(nfs基因簇)的功能研究第99-123页
    4.1 实验材料第99-104页
        4.1.1 菌株、质粒和引物第99-104页
        4.1.2 仪器和试剂第104页
        4.1.3 培养基及溶液配制第104页
    4.2 实验方法第104-108页
        4.2.1 △pvdA转座子插入突变株的构建、筛选及鉴定第104-105页
        4.2.2 △pvdA铁载体合成突变株转座子插入位点的定位第105页
        4.2.3 铁载体检测方法第105页
        4.2.4 总RNA提取及反转录PCR(RT-PCR)第105-106页
        4.2.5 包含lacZ翻译融合载体菌株的构建第106-107页
        4.2.6 β-半乳糖苷酶活性测定第107-108页
    4.3 实验结果与分析第108-121页
        4.3.1 △pvdA转座子插入突变株的构建、筛选及插入基因定位第108-110页
        4.3.2 nfs基因簇与HYS非荧光铁载体的相关性第110-116页
        4.3.3 nfs基因簇的表达与外界铁浓度的关系第116-119页
        4.3.4 nfs基因簇的表达与GacS/GacA的关系第119-121页
    4.4 讨论第121-122页
    4.5 小结第122-123页
研究总结与展望第123-126页
    一 研究总结第123-124页
    二 展望第124-126页
参考文献第126-143页
博士研究生期间科研成果第143-144页
致谢第144-145页

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