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基于分子生物学技术的污泥微生物群落结构分析

学位论文数据集第3-4页
摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 绪论第18-32页
    1.1 环境微生物研究的现状第18-21页
        1.1.1 环境微生物学简介第18页
        1.1.2 环境微生物学主要研究对象第18-20页
            1.1.2.1 自然界的微生物群落结构及其演变第18-19页
            1.1.2.2 废水处理过程中污泥微生物群落结构及其演变第19页
            1.1.2.3 餐厨垃圾处理过程中污泥微生物群落结构及其演变第19-20页
        1.1.3 环境微生物群落结构特点第20页
        1.1.4 传统环境微生物群落结构研究方法存在的问题第20-21页
    1.2 分子生物学技术在污泥微生态研究方面的应用第21-25页
        1.2.1 分子生物学技术简介第21页
        1.2.2 分子生物学在环境微生物研究中的应用第21-22页
        1.2.3 用于污泥微生态研究的分子生物学技术难点第22-23页
            1.2.3.1 污泥样品DNA的获取第22页
            1.2.3.2 PCR误差第22-23页
        1.2.4 PCR-DGGE技术在污泥微生态研究方面的应用第23-24页
        1.2.5 454-焦磷酸高通量测序技术在污泥微生态研究中的应用第24-25页
        1.2.6 污泥微生态群落结构研究的其他常用分子生物学技术第25页
    1.3 污泥微生物群落结构研究的相关简介第25-29页
        1.3.1 好氧颗粒污泥的快速培养第25-27页
        1.3.2 厌氧折流板反应器处理餐厨废水第27-28页
        1.3.3 厌氧消化产甲烷第28-29页
    1.4 本课题目的、意义及研究思路第29-32页
第二章 基于PCR-DGGE的好氧颗粒污泥制备和应用过程中菌群变化分析第32-46页
    2.1 引言第32页
    2.2 实验材料与方法第32-36页
        2.2.1 实验试剂与仪器第32-34页
        2.2.2 实验分析方法第34-36页
            2.2.2.1 污泥样品的获取第34页
            2.2.2.2 污泥总DNA提取方法第34页
            2.2.2.3 目标片段的PCR扩增第34-35页
            2.2.2.4 DGGE第35页
            2.2.2.5 条带分离与测序第35-36页
            2.2.2.6 图谱分析第36页
    2.3 结果与讨论第36-43页
        2.3.1 制备好氧颗粒污泥过程菌群变化分析第36-40页
            2.3.1.1 制备过程中污泥样品DNA提取结果及PCR扩增结果第36-37页
            2.3.1.2 制备过程中污泥样品DGGE图谱分析第37-39页
            2.3.1.3 制备过程中污泥样品优势菌分析第39-40页
        2.3.2 SBR异常状态下的菌群分析第40-42页
        2.3.3 好氧颗粒污泥降解苯胺过程中菌群变化第42-43页
            2.3.3.1 降解苯胺过程样品DNA提取结果及PCR扩增结果第42-43页
            2.3.3.2 降解苯胺过程DGGE结果第43页
    2.4 本章小结第43-46页
第三章 基于PCR-DGGE的A/OBR各隔室菌群分析第46-58页
    3.1 引言第46页
    3.2 实验材料与方法第46-48页
        3.2.1 实验试剂与仪器第46页
        3.2.2 实验分析方法第46-48页
            3.2.2.1 污泥样品的获取第46-48页
            3.2.2.2 污泥总DNA提取方法第48页
            3.2.2.3 目标片段的PCR扩增第48页
            3.2.2.4 DGGE第48页
            3.2.2.5 条带分离与测序第48页
            3.2.2.6 图谱分析第48页
    3.3 结果与讨论第48-55页
        3.3.1 以单口进料方式进料的各隔室菌群结构第48-51页
            3.3.1.1 以单口进料方式进料的各隔室样品DNA提取及PCR结果第48-49页
            3.3.1.2 以单口进料方式进料的各隔室不同时间段DGGE分析第49-51页
        3.3.2 以6:3:1方式进料的各隔室菌群结构第51-53页
            3.3.2.1 以6:3:1方式进料的各隔室样品DNA提取及PCR结果第51-52页
            3.3.2.2 以6:3:1方式进料的各隔室不同时间段DGGE第52-53页
        3.3.3 以6:2:2方式进料的各隔室菌群结构第53-55页
            3.3.3.1 以6:2:2方式进料的各隔室样品DNA提取及PCR结果第53-54页
            3.3.3.2 以6:2:2方式进料的各隔室不同时间段DGGE第54-55页
        3.3.4 三种进料方式对比第55页
    3.4 本章小结第55-58页
第四章 基于PCR-DGGE的厌氧消化过程菌群分析第58-72页
    4.1 引言第58-59页
    4.2 实验材料与方法第59-60页
        4.2.1 实验试剂与仪器第59页
        4.2.2 实验分析方法第59-60页
            4.2.2.1 污泥样品的获取第59页
            4.2.2.2 污泥总DNA提取方法第59页
            4.2.2.3 目标片段的PCR扩增第59-60页
            4.2.2.4 DGGE第60页
            4.2.2.5 条带分离与测序第60页
            4.2.2.6 图谱分析第60页
    4.3 结果与讨论第60-70页
        4.3.1 添加物对厌氧消化体系菌群结构的影响第60-65页
            4.3.1.1 厌氧消化各阶段样品DNA提取及PCR结果第60-61页
            4.3.1.2 厌氧消化各阶段样品DGGE结果第61-62页
            4.3.1.3 细菌图谱测序结果第62-63页
            4.3.1.4 厌氧消化各阶段样品古细菌PCR结果第63-64页
            4.3.1.5 厌氧消化各阶段样品古细菌DGGE结果第64-65页
            4.3.1.6 古细菌图谱测序结果第65页
        4.3.2 添加物对实际餐厨垃圾厌氧消化体系菌群结构的影响第65-70页
            4.3.2.1 实际餐厨厌氧消化各阶段样品DNA提取及PCR结果第65-66页
            4.3.2.2 实际餐厨厌氧消化各阶段样品DGGE结果第66-68页
            4.3.2.3 厌氧消化各阶段样品古细菌PCR结果第68-69页
            4.3.2.4 厌氧消化各阶段样品古细菌DGGE结果第69-70页
    4.4 本章小结第70-72页
第五章 高通量测序分析添加物对厌氧消化体系菌群的影响第72-84页
    5.1 引言第72页
    5.2 实验材料与方法第72-74页
        5.2.1 实验试剂与仪器第72页
        5.2.2 实验分析方法第72-74页
            5.2.2.1 高通量测序第72-73页
            5.2.2.2 测序结果处理第73-74页
    5.3 结果与讨论第74-81页
        5.3.1 16S rRNA gene高通量测序结果评估第74-76页
        5.3.2 细菌群落分析第76-80页
        5.3.3 古细菌群落分析第80-81页
        5.3.4 高通量测序与PCR-DGGE技术对于微生物群落鉴定的对比第81页
    5.4 本章小结第81-84页
第六章 结论第84-86页
第七章 问题与建议第86-88页
参考文献第88-94页
致谢第94-96页
研究成果及发表的学术论文第96-98页
作者和导师简介第98-100页
附表第100-101页

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