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猪miR-15b前体单碱基突变对其生物加工过程的影响

摘要第4-6页
Summary第6-7页
第一部分 文献综述第12-30页
    1 MiRNA的研究进展第12-18页
        1.1 MiRNA的发现第12-13页
        1.2 MiRNA家族及其命名第13页
        1.3 动物体miRNA的生物加工过程第13-18页
            1.3.1 MiRNA的转录第13-14页
            1.3.2 细胞核内miRNA的加工过程第14-16页
            1.3.3 细胞质中miRNA的加工过程第16-17页
            1.3.4 RNA诱导的沉默复合体的形成第17-18页
            1.3.5 非经典的miRNA生成途径第18页
        1.4 MiRNA的作用机制及其功能第18页
    2 MiRNA突变对其功能的影响第18-21页
        2.1 MiRNA突变对其加工过程及靶基因选择的影响第19-20页
        2.2 MiRNA突变引起诸多人类疾病第20-21页
    3 MiR-15b的研究进展第21-25页
        3.1 MiR-15a/b家族简介第21页
        3.2 MiR-15b的功能第21-25页
            3.2.1 MiR-15b对细胞的增殖、分化和凋亡的调控第21-23页
            3.2.2 MiR-15b对细胞新陈代谢的调节第23页
            3.2.3 MiR-15b在免疫细胞中的功能第23-25页
    4 MiRNA的反转录与实时荧光定量PCR第25-29页
        4.1 MiRNA成熟体的反转录与qPCR第25-28页
        4.2 MiRNA前体的qPCR第28-29页
    5 本研究的目的及意义第29-30页
第二部分 试验部分第30-65页
    第一章 材料与方法第30-49页
        1 试验材料第30-33页
            1.1 试验动物第30页
            1.2 样品采集第30页
            1.3 细胞系及质粒来源第30-31页
            1.4 主要仪器设备第31页
            1.5 主要试剂第31-32页
            1.6 主要溶液及其配制第32-33页
        2 试验方法第33-49页
            2.1 基因组DNA的提取及检测第33-34页
                2.1.1 基因组DNA的提取第33-34页
                2.1.2 基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳检测第34页
                2.1.3 基因组DNA的分光光度计检测第34页
            2.2 基因多态性分析第34-35页
                2.2.1 引物设计第34页
                2.2.2 PCR反应体系及扩增程序第34-35页
                2.2.3 PCR产物的琼脂糖凝胶电泳检测第35页
                2.2.4 PCR产物的测序第35页
            2.3 Pre-miR-15b二级结构及其自由能预测第35-36页
            2.4 MiRNA表达载体的构建第36-42页
                2.4.1 目的片段的获得第36-37页
                2.4.2 重组T载体的构建第37-39页
                2.4.3 Pre-miR-15b重组质粒的构建第39-42页
            2.5 细胞培养及转染第42-44页
                2.5.1 细胞复苏第42-43页
                2.5.2 细胞传代第43页
                2.5.3 转染第43-44页
            2.6 细胞、组织与血液RNA的提取第44-46页
                2.6.1 细胞、组织RNA的提取第44-45页
                2.6.2 血液RNA的提取第45-46页
            2.7 MiRNA的反转录与实时荧光定量PCR第46-48页
                2.7.1 MiRNA的反转录第46页
                2.7.2 MiRNA及其前体的qPCR第46-48页
            2.8 数据处理方法第48-49页
                2.8.1 群体遗传分析第48页
                2.8.2 荧光定量PCR数据处理第48-49页
    第二章 结果与分析第49-65页
        1 基因组DNA提取结果第49页
        2 基因多态性分析结果第49-51页
            2.1 Pre-miR-15b的PCR扩增结果第49-50页
            2.2 PCR产物的测序结果第50页
            2.3 基因型和等位基因频率及分布第50-51页
        3 突变前后pre-miR-15b二级结构及其自由能预测结果第51-53页
        4 +58C>T突变对miR-15b表达影响的体外验证试验结果第53-61页
            4.1 MiRNA重表达组质粒的获得第53-54页
                4.1.1 Pre-miR-15b片段的PCR扩增结果第53页
                4.1.2 目的片段的T载体克隆结果第53-54页
            4.2 MiRNA重组表达载体的获得第54-56页
                4.2.1 双酶切获得目的片段及表达载体片段第54-55页
                4.2.2 MiRNA重组质粒的双酶切检测结果第55-56页
            4.3 MiRNA表达载体的转染及细胞RNA提取结果第56-57页
            4.4 qPCR及miRNA表达量分析结果第57-61页
                4.4.1 miR-15b-5p及miR-15b-3p的相对表达量分析结果第57-58页
                4.4.2 miR-15b前体的相对表达量分析结果第58-59页
                4.4.3 MiR-15b-5p与miR-15b-3p相对表达量的比值分析结果第59-60页
                4.4.4 MiR-16的相对表达量分析结果第60-61页
        5 +58C>T突变对miR-15b表达影响的体内验证实验结果第61-63页
            5.1 新生小猪的基因分型及血液RNA的提取结果第61-62页
            5.2 血液中miR-15b-5p/3p的相对表达量检测结果第62-63页
        6 猪miR-15b不同组织表达差异性分析结果第63-65页
            6.1 猪不同组织RNA提取结果第63页
            6.2 MiR-15b不同组织表达差异性分析结果第63-65页
第三部分 讨论第65-71页
    1 关于试验方法的讨论第65页
    2 猪miR-15b基因的群体多态性及群体遗传学分析第65-67页
    3 Pre-miR-15bW/M二级结构及其自由能分析第67页
    4 +58C>T突变对pre-miR-15b的表达的影响第67-70页
    5 MiR-15b-5p不同组织表达差异性分析第70-71页
第四部分 结论第71-72页
参考文献第72-84页
致谢第84-85页
作者简介第85-86页
导师简介第86-87页

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