| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-22页 |
| 1.1 核小体概述 | 第10-16页 |
| 1.1.1 核小体 | 第10-12页 |
| 1.1.2 核小体定位与转录调控作用 | 第12-16页 |
| 1.2 核小体位置的测定及其数据分析 | 第16-19页 |
| 1.2.1 ChIP-Chip技术 | 第16-17页 |
| 1.2.2 ChIP-Seq技术 | 第17-18页 |
| 1.2.3 MNase-Seq技术 | 第18页 |
| 1.2.4 核小体测序数据分析 | 第18-19页 |
| 1.3 课题主要工作 | 第19-21页 |
| 1.3.1 研究内容和意义 | 第19-20页 |
| 1.3.2 论文结构 | 第20-21页 |
| 1.4 本章小结 | 第21-22页 |
| 第二章 核小体数据处理及分析方法 | 第22-30页 |
| 2.1 核小体数据特点 | 第22-24页 |
| 2.1.1 核小体常见数据存储格式 | 第22-23页 |
| 2.1.2 核小体数据库构建 | 第23-24页 |
| 2.2 核小体常用信号处理方法 | 第24-29页 |
| 2.2.1 核小体数据分析基础算法MACS | 第24-25页 |
| 2.2.2 核小体定位算法NPS、iNPS、mspeaks | 第25-27页 |
| 2.2.3 核小体比较算法DiNuP与DANPOS | 第27-29页 |
| 2.3 本章小结 | 第29-30页 |
| 第三章 AlignNuP：一种样本间的核小体比对算法 | 第30-39页 |
| 3.1 基于动态规划的算法设计 | 第30-33页 |
| 3.1.1 算法基本思想 | 第30页 |
| 3.1.2 算法设计 | 第30-33页 |
| 3.1.3 算法分析 | 第33页 |
| 3.2 软件开发 | 第33-38页 |
| 3.2.1 初级C++版本 | 第33-36页 |
| 3.2.2 升级PHP版本 | 第36-38页 |
| 3.3 本章小结 | 第38-39页 |
| 第四章 CD4~+T细胞核小体定位的动态变化分析 | 第39-45页 |
| 4.1 基因表达差异与核小体动态定位分析 | 第39-42页 |
| 4.1.1 数据和方法 | 第39页 |
| 4.1.2 结果与讨论 | 第39-42页 |
| 4.2 单外显子基因与核小体动态定位分析 | 第42-43页 |
| 4.2.1 数据和方法 | 第42-43页 |
| 4.2.2 结果与讨论 | 第43页 |
| 4.3 本章小结 | 第43-45页 |
| 第五章 酿酒酵母基因组核小体动态变化分析 | 第45-54页 |
| 5.1 酵母复制衰老过程中核小体动态变化分析 | 第45-49页 |
| 5.1.1 数据和方法 | 第46页 |
| 5.1.2 结果与分析 | 第46-49页 |
| 5.2 酵母组蛋白突变体核小体动态变化分析 | 第49-53页 |
| 5.2.1 数据和方法 | 第49-50页 |
| 5.2.2 结果与分析 | 第50-53页 |
| 5.3 本章小结 | 第53-54页 |
| 第六章 总结与展望 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 附录 | 第60-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 作者简介 | 第63页 |
| 论文发表 | 第63页 |
