| 中文摘要 | 第8-9页 |
| 英文摘要 | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第11-22页 |
| 1.1 研究目的与意义 | 第11-12页 |
| 1.2 国内外研究进展 | 第12-22页 |
| 1.2.1 钩藤药材及原植物简介 | 第12-13页 |
| 1.2.2 钩藤的化学成分 | 第13-14页 |
| 1.2.3 钩藤提取物或化学成分的药理作用 | 第14-17页 |
| 1.2.4 吲哚类生物碱生物合成路径的研究 | 第17-18页 |
| 1.2.5 钩藤碱和异钩藤碱含量测定方法 | 第18-19页 |
| 1.2.6 高通量测序技术简介 | 第19-20页 |
| 1.2.7 定量PCR简介 | 第20-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-30页 |
| 2.1 材料 | 第22页 |
| 2.2 样品采集和处理 | 第22-23页 |
| 2.3 液相色谱法测定钩藤碱和异钩藤碱含量 | 第23页 |
| 2.4 RNA分离方法 | 第23-24页 |
| 2.5 转录组和表达谱测序及分析 | 第24-27页 |
| 2.6 筛选钩藤内参基因 | 第27-28页 |
| 2.7 候选基因的定量PCR分析 | 第28-30页 |
| 3 结果与分析 | 第30-94页 |
| 3.1 钩藤不同部位钩藤碱和异钩藤碱积累规律分析 | 第30-33页 |
| 3.1.1 不同部位钩藤碱和异钩藤碱含量 | 第30-31页 |
| 3.1.2 各部位钩藤碱和异钩藤碱含量的比值 | 第31-32页 |
| 3.1.3 各部位钩藤碱和异钩藤碱含量相关性分析 | 第32-33页 |
| 3.2 钩藤RNA的质量评价 | 第33-37页 |
| 3.2.1 TRIzol法 | 第33-34页 |
| 3.2.2 改良TRIzol法 | 第34页 |
| 3.2.3 去多酚多糖试剂盒 | 第34-35页 |
| 3.2.4 改良CTAB法 | 第35-37页 |
| 3.3 钩藤蒴果转录组分析 | 第37-46页 |
| 3.3.1 测序产出数据和质量分析 | 第37-39页 |
| 3.3.2 转录本拼接 | 第39-40页 |
| 3.3.3 基因功能注释 | 第40页 |
| 3.3.4 基因GO注释 | 第40-41页 |
| 3.3.5 基因KOG注释 | 第41-42页 |
| 3.3.6 基因KEGG注释 | 第42-44页 |
| 3.3.7 基因的CDS信息 | 第44-45页 |
| 3.3.8 转录组基因表达水平分析 | 第45页 |
| 3.3.9 测序数据的整体质量评估 | 第45-46页 |
| 3.4 钩藤不同发育时期蒴果的表达谱分析 | 第46-77页 |
| 3.4.1 DGE测序质量分析和有效数据提取 | 第46-48页 |
| 3.4.2 基因表达水平分析 | 第48-49页 |
| 3.4.3 测序质量整体评估 | 第49-52页 |
| 3.4.4 基因差异表达分析 | 第52-54页 |
| 3.4.5 基因差异表达模式分类 | 第54-56页 |
| 3.4.6 差异表达基因的GO释 | 第56-68页 |
| 3.4.7 差异表达基因的KO注释 | 第68-77页 |
| 3.5 钩藤碱和异钩藤碱生物合成路径分析 | 第77-88页 |
| 3.5.1 可能参与TIAs生物合成的基因 | 第77-82页 |
| 3.5.2 筛选参与AITs合成的“上游基因” | 第82-83页 |
| 3.5.3 筛选钩藤碱和异钩藤碱合成的“后期步骤基因” | 第83-88页 |
| 3.6 候选目标基因的表达分析 | 第88-94页 |
| 3.6.1 钩藤蒴果定量PCR检测体系 | 第88-89页 |
| 3.6.2 钩藤内参基因的选择 | 第89-91页 |
| 3.6.3 候选基因的定量PCR分析 | 第91-94页 |
| 4 讨论 | 第94-99页 |
| 4.1 高效液相色谱法分析钩藤碱和异钩藤碱含量 | 第94页 |
| 4.2 分离高质量的钩藤RNA | 第94-95页 |
| 4.3 钩藤转录组和表达谱实验材料的选择 | 第95-96页 |
| 4.4 转录组和表达谱的应用 | 第96页 |
| 4.5 钩藤碱和异钩藤碱生物合成路径相关酶编码基因的发掘 | 第96页 |
| 4.6 钩藤碱和异钩藤碱生物合成路径研究的应用前景 | 第96-97页 |
| 4.7 钩藤定量PCR检测体系的构建 | 第97-99页 |
| 5 结论 | 第99-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-118页 |
| 攻读博士学位期间发裹的学术论文 | 第118页 |
