| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 引言 | 第11-29页 |
| 1.1 栽培作物的起源与驯化 | 第11-19页 |
| 1.1.1 植物驯化的概念 | 第11-12页 |
| 1.1.2 栽培起源和驯化中心 | 第12-15页 |
| 1.1.3 作物的起源方式与驯化阶段 | 第15-16页 |
| 1.1.4 考古学对于驯化的研究 | 第16-17页 |
| 1.1.5 遗传学对于驯化的研究 | 第17-18页 |
| 1.1.6 驯化历史的模型检测 | 第18-19页 |
| 1.2 人参的研究背景与概述 | 第19-23页 |
| 1.2.1 人参的系统分类背景及药用价值 | 第19-21页 |
| 1.2.2 野生人参和栽培人参概况 | 第21-22页 |
| 1.2.3 人参产业现状 | 第22-23页 |
| 1.3 分子标记技术在人参研究中的运用 | 第23-27页 |
| 1.3.1 分子标记概念 | 第23-24页 |
| 1.3.2 分子标记方法及应用 | 第24-25页 |
| 1.3.3 DNA测序技术在人参研究中的应用 | 第25-27页 |
| 1.4 本研究的目的、意义和研究内容 | 第27-29页 |
| 1.4.1 研究目的和意义 | 第27页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第27-29页 |
| 第二章 基于叶绿体基因的人参属系统发育研究 | 第29-42页 |
| 2.1 前言 | 第29页 |
| 2.2 材料和方法 | 第29-38页 |
| 2.2.1 材料采集 | 第29-31页 |
| 2.2.2 主要实验试剂、仪器和来源 | 第31-32页 |
| 2.2.3 植物材料总DNA提取 | 第32-34页 |
| 2.2.4 叶绿体通用引物筛选和PCR扩增测序 | 第34-36页 |
| 2.2.5 序列比对和系统树构建 | 第36-38页 |
| 2.3 结果分析 | 第38-40页 |
| 2.3.1 栽培人参与野生人参叶绿体基因多态性 | 第38页 |
| 2.3.2 叶绿体基因序列多态性分析结果 | 第38-39页 |
| 2.3.3 系统发育分析 | 第39-40页 |
| 2.4 讨论 | 第40-42页 |
| 2.4.1 栽培人参野生亲本的鉴定 | 第40-41页 |
| 2.4.2 人参属的系统发育 | 第41-42页 |
| 第三章 基于单拷贝核基因的栽培人参起源研究 | 第42-65页 |
| 3.1 前言 | 第42页 |
| 3.2 材料与方法 | 第42-50页 |
| 3.2.1 材料 | 第42-44页 |
| 3.2.2 DNA提取 | 第44页 |
| 3.2.3 人参单拷贝核基因的筛选和引物设计 | 第44-46页 |
| 3.2.4 PCR扩增和克隆 | 第46-48页 |
| 3.2.5 序列处理和比对 | 第48页 |
| 3.2.6 单倍型网络图分析 | 第48-49页 |
| 3.2.7 群体遗传多样性分析 | 第49页 |
| 3.2.8 中性检验 | 第49-50页 |
| 3.3 实验结果 | 第50-62页 |
| 3.3.1 引物筛选结果 | 第50-52页 |
| 3.3.2 三个核基因片段特点及功能 | 第52-53页 |
| 3.3.3 野生人参和栽培人参的遗传多样性及中性检验 | 第53-58页 |
| 3.3.4 单倍型统计分析 | 第58-62页 |
| 3.4 讨论 | 第62-65页 |
| 第四章 栽培人参与野生人参遗传结构研究 | 第65-82页 |
| 4.1 前言 | 第65页 |
| 4.2 材料和方法 | 第65-69页 |
| 4.2.1 单拷贝核基因开发 | 第66页 |
| 4.2.2 PCR扩增和检测 | 第66页 |
| 4.2.3 PCR产物混样测序 | 第66-67页 |
| 4.2.4 参考序列的获取 | 第67页 |
| 4.2.5 PCR产物Illumina测序 | 第67页 |
| 4.2.6 运用生物信息学处理高通量测序数据 | 第67-68页 |
| 4.2.7 遗传多样性统计 | 第68页 |
| 4.2.8 popABC（模型） | 第68-69页 |
| 4.3 结果 | 第69-80页 |
| 4.3.1 单拷贝核基因筛选和测序统计 | 第69-76页 |
| 4.3.2 栽培人参和野生人参之间的遗传多样性分析 | 第76-77页 |
| 4.3.3 栽培人参各品系之间的遗传多样性差异 | 第77-78页 |
| 4.3.4 不同地理分布的野生人参遗传多样性差异 | 第78页 |
| 4.3.5 评估不同基因在遗传多样性水平上的差异 | 第78-79页 |
| 4.3.6 栽培人参驯化历史模拟 | 第79-80页 |
| 4.4 讨论 | 第80-82页 |
| 结论 | 第82-85页 |
| 参考文献 | 第85-97页 |
| 附录 | 第97-109页 |
| 在学期间公开发表论文及著作情况 | 第109-110页 |
| 致谢 | 第110页 |