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花绒寄甲线粒体基因组与合成调控基因及其COXI基因的种群遗传结构研究

摘要第6-8页
Abstract第8-10页
第一章 文献综述第15-37页
    1.1 花绒寄甲研究概况第15-19页
        1.1.1 形态学特性及生物学习性第15-16页
        1.1.2 分类地位及分布第16-17页
        1.1.3 人工繁育研究现状第17页
        1.1.4 释放技术及生物防治概况第17-19页
    1.2 花绒寄甲基因研究概况第19-22页
        1.2.1 细胞色素P450基因第20页
        1.2.2 methuselah-like基因第20-21页
        1.2.3 半胱氨酸蛋白酶caspase基因第21页
        1.2.4 抗氧化酶SOD基因第21页
        1.2.5 热休克蛋白HSP基因第21-22页
    1.3 线粒体基因组研究概况第22-26页
        1.3.1 线粒体及其基因组第22-23页
        1.3.2 昆虫线粒体基因组研究进展第23-24页
        1.3.3 线粒体基因组全序列测定第24-26页
    1.4 系统发育中分子标记的研究第26-30页
        1.4.1 分子进化与系统发育的运用第26-27页
        1.4.2 分子标记类型第27-28页
        1.4.3 细胞色素C氧化酶基因I第28-29页
        1.4.4 昆虫系统发育中的COXI基因第29页
        1.4.5 基于COX1基因的群体遗传结构第29-30页
    1.5 核基因对线粒体基因的调控第30-33页
        1.5.1 AMPK基因第30-32页
        1.5.2 PGC1-α 信号级联反应第32-33页
    1.6 研究的目的意义及内容第33-37页
第二章 花绒寄甲线粒体基因组全序列测定及分析第37-62页
    2.1 引言第37页
    2.2 材料与方法第37-44页
        2.2.1 供试昆虫第37-38页
        2.2.2 实验试剂与仪器第38页
        2.2.3 花绒寄甲总DNA提取第38-39页
        2.2.4 COXII和rRNAL基因片段PCR扩增和割胶回收第39-40页
        2.2.5 克隆测序第40-41页
        2.2.6 长片段扩增和短片段克隆验证第41-43页
        2.2.7 序列拼接、注释和分析第43-44页
        2.2.8 系统进化分析第44页
    2.3 结果与分析第44-57页
        2.3.1 花绒寄甲线粒体基因组组成和结构第44-47页
        2.3.2 非编码区第47-48页
        2.3.3 链的不对称和密码子使用情况第48-51页
        2.3.4 蛋白质编码基因(PCGs)第51-52页
        2.3.5 核糖体RNA基因第52-54页
        2.3.6 转运RNA基因第54-55页
        2.3.7 系统发育分析第55-57页
    2.4 小结与讨论第57-62页
第三章 基于线粒体COXI基因对不同寄主花绒寄甲种群遗传结构的研究第62-78页
    3.1 引言第62-63页
    3.2 材料与方法第63-66页
        3.2.1 供试昆虫第63-64页
        3.2.2 实验试剂与仪器第64页
        3.2.3 总DNA提取第64-65页
        3.2.4 线粒体COXI基因扩增第65页
        3.2.5 数据分析第65-66页
    3.3 结果与分析第66-74页
        3.3.1 单倍型多样性和核苷酸多样性第66-69页
        3.3.2 系统发育关系和单倍型网络图第69-70页
        3.3.3 单倍型和种群分布关系第70-72页
        3.3.4 种群的遗传多样性第72-74页
    3.4 小结与讨论第74-78页
第四章 花绒寄甲腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)基因的克隆鉴定和表达研究第78-99页
    4.1 引言第78-79页
    4.2 材料与方法第79-85页
        4.2.1 供试虫源和样本收集第79-80页
        4.2.2 实验试剂与仪器第80页
        4.2.3 总RNA提取第80-81页
        4.2.4 序列检索及RACE扩增第81-83页
        4.2.5 RT-qPCR第一链cDNA合成第83页
        4.2.6 RT-qPCR引物设计和标准曲线绘制第83-84页
        4.2.7 不同处理的RT-qPCR检测第84页
        4.2.8 数据分析第84-85页
    4.3 结果与分析第85-95页
        4.3.1 AMPK基因序列比对及 5' RAC-PCR第85-86页
        4.3.2 AMPK基因核苷酸和氨基酸序列特征第86-87页
        4.3.3 AMPK各亚基保守域和三级结构分析第87-89页
        4.3.4 系统发育分析第89-90页
        4.3.5 花绒寄甲AMPK基因定量表达第90-95页
    4.4 小结与讨论第95-99页
第五章 花绒寄甲PGC1-α、NRF1、mtTFA、COXI和ATP6基因的克隆鉴定和定量表达分析第99-110页
    5.1 引言第99-100页
    5.2 材料与方法第100-102页
        5.2.1 供试虫源和样本收集第100页
        5.2.2 实验试剂与仪器第100页
        5.2.3 总RNA提取第100页
        5.2.4 序列检索及RACE扩增第100-101页
        5.2.5 RT-qPCR引物设计及标准曲线绘制第101-102页
        5.2.6 不同处理的RT-qPCR检测第102页
        5.2.7 数据处理第102页
    5.3 结果与分析第102-107页
        5.3.1 基因序列及蛋白结构分析第102-103页
        5.3.2 线粒体合成调控基因的序列同源性比对及系统发育分析第103-104页
        5.3.3 线粒体合成调控基因在不同组织中的表达第104-105页
        5.3.4 线粒体合成调控基因在不同虫态中的表达第105-106页
        5.3.5 线粒体合成调控基因在羽化后不同虫龄成虫中的表达第106-107页
    5.4 小结与讨论第107-110页
第六章 全文总结第110-114页
    6.1 主要结论第110-112页
    6.2 本研究的创新点第112页
    6.3 有待进一步的研究工作第112-114页
参考文献第114-132页
附录第132-141页
致谢第141-142页
作者简介第142页

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