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肽体药物分子设计的结构生物信息学研究

摘要第5-6页
ABSTRACT第6页
第一章 绪论第9-19页
    1.1 多肽药物第9-12页
        1.1.1 改变构型第9-10页
        1.1.2 化学修饰第10页
        1.1.3 融合蛋白技术第10-11页
        1.1.4 结语第11-12页
    1.2 肽体药物第12-15页
        1.2.1 罗米司亭第13-14页
        1.2.2 AMG386(Trebanib)第14-15页
        1.2.3 AMG623第15页
        1.2.4 小结第15页
    1.3 肽体药物研究中遇到的问题第15-16页
    1.4 本文的研究内容和研究意义第16-17页
    1.5 本论文的结构安排第17-19页
第二章 模型构建第19-36页
    2.1 背景及研究问题第19-20页
    2.2 材料与方法第20-28页
        2.2.1 同源建模与分子对接第20-22页
        2.2.2 分子动力学基本理论第22-27页
        2.2.3 建模方法第27-28页
    2.3 结果与讨论第28-34页
        2.3.1 单条肽链结构模型第28-29页
        2.3.2 TPOR的同源建模第29-30页
        2.3.3 单肽和受体的作用模型第30-32页
        2.3.4 C-罗米司亭模型第32-33页
        2.3.5 N-罗米司亭模型第33-34页
    2.4 本章小结第34-36页
第三章 受体与配体静态作用分析第36-42页
    3.1 材料与方法第36页
    3.2 各模型作用力分析第36-41页
        3.2.1 单肽和受体的作用模型1第36-38页
        3.2.2 单肽和受体的作用模型2第38页
        3.2.4 C-罗米司亭模型第38-39页
        3.2.5 N-罗米司亭模型第39-40页
        3.2.6 结果与讨论第40-41页
    3.3 本章小结第41-42页
第四章 受体与配体分子动力学模拟分析第42-50页
    4.1 材料与方法第42-45页
        4.1.1 结合自由能计算方法第42-44页
        4.1.2 计算策略第44-45页
    4.2 结果与讨论第45-49页
        4.2.1 动力学模拟前后结构比较第45-48页
        4.2.2 结合自由能计算第48-49页
    4.3 本章小结第49-50页
第五章 总结与展望第50-53页
    5.1 全文总结第50-51页
    5.2 后续展望第51-53页
致谢第53-54页
参考文献第54-59页
附录第59-60页
硕士期间取得的研究成果第60页

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