| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1. 前言 | 第10-18页 |
| 1.1 β-葡聚糖研究概论 | 第10-14页 |
| 1.1.1 β-葡聚糖来源及其基本结构 | 第10-11页 |
| 1.1.2 β-葡聚糖的高级结构和生物学功能 | 第11页 |
| 1.1.3 β-葡聚糖的免疫调节机制 | 第11-14页 |
| 1.2 转录组测序研究概论 | 第14-16页 |
| 1.2.1 转录组测序技术产生的背景 | 第14-15页 |
| 1.2.2 转录组测序技术的发展历史 | 第15-16页 |
| 1.2.3 转录组测序技术在硬骨鱼类中的应用 | 第16页 |
| 1.3 研究目的及意义 | 第16-18页 |
| 2. 斜带石斑鱼转录组分析 | 第18-46页 |
| 2.1 实验材料 | 第18-19页 |
| 2.1.1 实验试剂 | 第18页 |
| 2.1.2 主要仪器 | 第18-19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-25页 |
| 2.2.1 斜带石斑鱼养殖及取样 | 第19-20页 |
| 2.2.2 RNA提取及测序文库构建 | 第20-21页 |
| 2.2.3 测序数据处理及De novo组装 | 第21-22页 |
| 2.2.4 unigene统计与功能注释 | 第22-23页 |
| 2.2.5 差异表达基因筛选 | 第23页 |
| 2.2.6 差异表达基因Gene Ontology富集分析 | 第23-24页 |
| 2.2.7 差异表达基因Pathway富集分析 | 第24-25页 |
| 2.2.8 qRT-PCR验证 | 第25页 |
| 2.3 实验结果与分析 | 第25-43页 |
| 2.3.1 总RNA提取质量检测 | 第25-26页 |
| 2.3.2 测序数据和质量评估 | 第26-27页 |
| 2.3.3 碱基组成与质量值分析 | 第27页 |
| 2.3.4 测序序列组装 | 第27-28页 |
| 2.3.5 unigene功能注释 | 第28-29页 |
| 2.3.6 差异表达基因的筛选 | 第29-32页 |
| 2.3.7 差异表达基因的Gene Ontology富集分析 | 第32-35页 |
| 2.3.8 差异表达基因的Pathway富集分析 | 第35-42页 |
| 2.3.9 qRT-PCR验证结果 | 第42-43页 |
| 2.4 讨论 | 第43-46页 |
| 2.4.1 原始数据分析 | 第43页 |
| 2.4.2 差异表达基因分析 | 第43-44页 |
| 2.4.3 差异表达基因Gene Ontology富集分析 | 第44页 |
| 2.4.4 差异表达基因的Pathway富集分析 | 第44-46页 |
| 3. β-葡聚糖刺激下的斜带石斑鱼免疫相关基因表达分析 | 第46-74页 |
| 3.1 实验材料 | 第46页 |
| 3.1.1 实验试剂 | 第46页 |
| 3.1.2 实验仪器 | 第46页 |
| 3.2 实验方法 | 第46-49页 |
| 3.2.1 石斑鱼养殖实验 | 第46页 |
| 3.2.2 β-葡聚糖浓度梯度的配制 | 第46页 |
| 3.2.3 免疫程序 | 第46-47页 |
| 3.2.4 组织样品的采集 | 第47页 |
| 3.2.5 组织样品RNA提取 | 第47页 |
| 3.2.6 cDNA一链的合成 | 第47-48页 |
| 3.2.7 荧光定量实验方法 | 第48-49页 |
| 3.3 实验结果与分析 | 第49-67页 |
| 3.3.1 IL-1β 基因的时序差异表达分析 | 第49-51页 |
| 3.3.2 C3-1 基因的时序差异表达分析 | 第51-54页 |
| 3.3.3 IFNα 基因的时序差异表达分析 | 第54-56页 |
| 3.3.4 TLR13基因的时序差异表达分析 | 第56-59页 |
| 3.3.5 MHC-I基因的时序差异表达分析 | 第59-61页 |
| 3.3.6 TNFα 基因的时序差异表达分析 | 第61-64页 |
| 3.3.7 CD2基因的时序差异表达分析 | 第64-67页 |
| 3.4 讨论 | 第67-74页 |
| 3.4.1 免疫相关基因在不同浓度的 β-葡聚糖刺激下的时序表达分析 | 第67-71页 |
| 3.4.2 免疫注射剂量的合理选择 | 第71-74页 |
| 4. 结论 | 第74-76页 |
| 参考文献 | 第76-89页 |
| 附录 | 第89-94页 |
| 致谢 | 第94-95页 |
| 作者简介 | 第95-96页 |
| 导师简介 | 第96页 |
