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肠道病毒71型(EV71)调控EGR1表达及其促进病毒复制的研究

中文摘要第8-9页
ABSTRACT第9页
第一章 肠道病毒71型第11-23页
    1.1 病原学第11-20页
        1.1.1 人肠道病毒分型第11页
        1.1.2 理化性质第11-12页
        1.1.3 基因组结构第12页
        1.1.4 生命周期概述第12-13页
        1.1.5 病毒基因表达的调控第13-20页
    1.2 临床流行病学及分子流行病学第20-21页
        1.2.1 临床流行病学第20页
        1.2.2 分子流行病学第20-21页
    1.3 防控前景第21-23页
第二章 早期生长反应因子1(EGR1)第23-37页
    2.1 EGR家族第23-24页
    2.2 EGR1基因及蛋白的特征第24-34页
        2.2.1 EGR1基因的结构第24-25页
        2.2.2 EGR1蛋白的特性第25-28页
        2.2.3 EGR1的表达调控第28-33页
        2.2.4 EGR1 mRNA及蛋白表达第33-34页
    2.3 EGR1的功能第34-35页
    2.4 病毒与EGR1的关系第35页
    2.5 EGR1与EV71的关系第35-37页
第三章 EV71感染调控EGR1表达第37-43页
    3.1 前言第37页
    3.2 实验材料与仪器第37-38页
        3.2.1 细胞株第37页
        3.2.2 病毒第37页
        3.2.3 哺乳乳动物细胞培养基第37页
        3.2.4 抗体第37页
        3.2.5 相关仪器第37-38页
    3.3 实验方法第38-40页
        3.3.1 细胞培养第38页
        3.3.2 细胞的冻存与复苏第38页
        3.3.3 病毒的扩增第38页
        3.3.4 病毒滴度的测定第38-39页
        3.3.5 EV71感染细胞第39页
        3.3.6 病毒的灭活第39页
        3.3.7 蛋白质免疫印迹法(Western blot)第39-40页
    3.4 实验结果第40-42页
    3.5 讨论第42-43页
第四章 EV71感染早期通过激活PI3K/AKT、PKA及PKC-E信号通路诱导EGR1表达第43-47页
    4.1 前言第43页
    4.2 实验材料与仪器第43页
        4.2.1 通路抑制剂第43页
        4.2.2 干扰RNA质粒与菌种第43页
        4.2.3 抗体第43页
    4.3 实验方法第43-44页
        4.3.1 转染第43-44页
        4.3.2 细胞中加入抑制剂第44页
    4.4 实验结果第44-46页
        4.4.1 EV71感染SK-N-SH细胞中EGR1的激活涉及到PKA、PKC-ε及PI3K/Akt通路第44-46页
        4.4.2 EV71感染早期使PKA、PKC-ε及Akt发生磷酸化第46页
    4.5 讨论第46-47页
第五章 EV71感染晚期EGR1的降解源自于凋亡通路的激活第47-57页
    5.1 前言第47页
    5.2 实验材料与仪器第47页
        5.2.1 质粒第47页
        5.2.2 抗体及试剂第47页
        5.2.3 相关仪器第47页
    5.3 实验方法第47-51页
        5.3.1 质粒构建第47-49页
        5.3.2 质粒提取第49-50页
        5.3.3 RNA的提取第50页
        5.3.4 逆转录第50页
        5.3.5 半定量PCR第50-51页
        5.3.6 流式细胞术第51页
    5.4 实验结果第51-56页
        5.4.1 EV71 2A及3C蛋白酶可以使EGR1降解第51-54页
        5.4.2 EGR1的切割降解是由Caspase引起的非特异性降解第54-56页
    5.5 讨论第56-57页
第六章 EGR1蛋白与EV71 5'UTR相互作用第57-70页
    6.1 前言第57页
    6.2 实验材料与仪器第57页
        6.2.1 抗体与试剂第57页
        6.2.2 相关仪器第57页
    6.3 实验方法第57-60页
        6.3.1 共沉淀及RT-PCR第57-58页
        6.3.2 生物素标记的RNA与蛋白pull-down实验第58-59页
        6.3.3 构建5'UTR截短质粒及EGR1截短质粒第59-60页
        6.3.4 免疫荧光第60页
    6.4 实验结果第60-68页
        6.4.1 EGR1能够直接结合在EV71 5'UTR上第60-62页
        6.4.2 EGR1结合在EV71 5'UTR的第1、4号茎环上第62-64页
        6.4.3 EGR1利用前两个C2H2结构域结合EV71 5’UTR第64-66页
        6.4.4 EGR1能和EV71病毒RNA定位在一起第66-68页
    6.5 讨论第68-70页
第七章 EGR1促进EV71病毒的复制第70-76页
    7.1 前言第70页
    7.2 实验材料与仪器第70页
        7.2.1 质粒第70页
        7.2.2 相关仪器第70页
    7.3 实验方法第70-72页
        7.3.1 EGR1干扰质粒构建第70-71页
        7.3.2 荧光素酶检测第71页
        7.3.3 EV71病毒正负链cDNA转录及Real-Time PCR检测第71页
        7.3.4 TCID_(50)法测量细胞上清中病毒滴度第71-72页
    7.4 实验结果第72-75页
        7.4.1 EGR1上调EV71 IRES活性第72-73页
        7.4.2 EGR1促进EV71 RNA及蛋白的合成第73-74页
        7.4.3 EGR1促进细胞上清中EV71病毒滴度水平第74-75页
    7.5 讨论第75-76页
第八章 EGR1可不依赖MIR-141途径促进EV71病毒的复制第76-83页
    8.1 前言第76页
    8.2 实验材料与仪器第76页
        8.2.1 抗体及试剂第76页
        8.2.2 菌种第76页
        8.2.3 仪器第76页
    8.3 实验方法第76-78页
        8.3.1 miR-141检测第76-77页
        8.3.2 miR-141 Inhibitor转染第77页
        8.3.3 蛋白表达纯化第77页
        8.3.4 EMSA实验第77-78页
    8.4 实验结果第78-82页
        8.4.1 EGR1 C2H21-3截短蛋白能够促进EV71复制第78-80页
        8.4.2 EGR1在miR-141抑制剂存在的情况下可以促进EV71复制第80-82页
    8.5 讨论第82-83页
第九章 研究意义和创新第83-84页
参考文献第84-102页
博士在读期间发表与待发表论文第102-103页
致谢第103页

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