| 摘要 | 第6-10页 |
| Abstract | 第10-14页 |
| 第1章 前言 | 第20-43页 |
| 1.1 亲缘地理学研究概况 | 第20-27页 |
| 1.1.1 亲缘地理学研究进展 | 第20-21页 |
| 1.1.2 生态位模型概念 | 第21-22页 |
| 1.1.3 中国亚热带地区亲缘地理学研究现状 | 第22-27页 |
| 1.2 景观遗传学研究概况 | 第27-34页 |
| 1.2.1 景观遗传学概念及其研究方法 | 第28-31页 |
| 1.2.2 景观基因组学及其研究进展 | 第31-34页 |
| 1.3 香果树研究现状 | 第34-43页 |
| 1.3.1 香果树的生物学特征及系统分类 | 第34-36页 |
| 1.3.2 香果树系统学研究 | 第36页 |
| 1.3.3 香果树地理分布 | 第36-37页 |
| 1.3.4 香果树种群生态学 | 第37-39页 |
| 1.3.5 香果树群落生态学研究 | 第39-40页 |
| 1.3.6 香果树群体遗传多样性与遗传结构 | 第40页 |
| 1.3.7 香果树保护生物学 | 第40-41页 |
| 1.3.8 香果树研究需要解决的问题 | 第41页 |
| 1.3.9 本研究的目的与意义 | 第41-42页 |
| 1.3.10 技术路线 | 第42-43页 |
| 第2章 野外群落调查与采样 | 第43-57页 |
| 2.1 野外调查和采样方法 | 第43-45页 |
| 2.2 野外群落及生境调查 | 第45-57页 |
| 第3章 基于叶绿体DNA和核基因ITS的亲缘地理学研究 | 第57-79页 |
| 3.1 试剂与仪器 | 第58-59页 |
| 3.2 研究材料与方法 | 第59-65页 |
| 3.2.1 研究材料 | 第59页 |
| 3.2.2 全基因组DNA提取 | 第59-60页 |
| 3.2.3 序列筛选、扩增及测序 | 第60-62页 |
| 3.2.4 遗传多样性与谱系地理结构分析 | 第62页 |
| 3.2.5 系统发育与谱系分化时间估算 | 第62-64页 |
| 3.2.6 群体动态历史分析 | 第64-65页 |
| 3.3 结果 | 第65-75页 |
| 3.3.1 cpDNA和ITS遗传多样性与群体遗传结构 | 第65-68页 |
| 3.3.2 cpDNA谱系地理结构分析 | 第68-71页 |
| 3.3.3 ITS谱系地理分析 | 第71-73页 |
| 3.3.4 基于cpDNA的谱系分化时间以及群体历史动态 | 第73-75页 |
| 3.4 讨论 | 第75-78页 |
| 3.4.1 种内遗传多样性高,群体分化大,具有明显谱系地理结构 | 第75-76页 |
| 3.4.2 中新世/上新世地质与气候的变化促进谱系分化 | 第76页 |
| 3.4.3 南部谱系进化式样符合“方阵式”扩张模型 | 第76-77页 |
| 3.4.4 北部谱系经历了冰期地理扩张 | 第77-78页 |
| 3.5 本章小结 | 第78-79页 |
| 第4章 基于AFLPs的群体遗传多样性与遗传结构 | 第79-92页 |
| 4.1 材料与方法 | 第80-84页 |
| 4.1.1 研究材料 | 第80页 |
| 4.1.2 主要试剂、仪器及其来源 | 第80-81页 |
| 4.1.3 AFLPs实验 | 第81-82页 |
| 4.1.4 AFLPs数据统计与分析 | 第82-84页 |
| 4.2 结果 | 第84-89页 |
| 4.2.1 基于AFLPs的遗传多样性分析 | 第84-87页 |
| 4.2.2 基于AFLPs的群体遗传结构分析 | 第87-89页 |
| 4.2.3 基因流和花粉流/种子流(r) | 第89页 |
| 4.3 讨论 | 第89-91页 |
| 4.3.1 基于AFLPs的香果树遗传多样性与形成原因 | 第89-90页 |
| 4.3.2 香果树群体的遗传结构及地理分组 | 第90-91页 |
| 4.4 本章小结 | 第91-92页 |
| 第5章 香果树分布区重建以及生态位分化分析 | 第92-101页 |
| 5.1 研究方法与步骤 | 第92-94页 |
| 5.1.1 基于生态位模拟的香果树分布区重建 | 第92-93页 |
| 5.1.2 香果树谱系生态位分化分析 | 第93-94页 |
| 5.2 研究结果 | 第94-98页 |
| 5.2.1 不同时期的分布区重建 | 第94-95页 |
| 5.2.2 香果树南北谱系生态位分化分析 | 第95-98页 |
| 5.3 讨论 | 第98-100页 |
| 5.3.1 间冰期避难所与亚热带山地落叶阔叶林变迁 | 第98页 |
| 5.3.2 全球气候变化下潜在适宜分布区压缩 | 第98-99页 |
| 5.3.3 香果树南北谱系的生态位分化 | 第99-100页 |
| 5.4 本章小结 | 第100-101页 |
| 第6章 香果树景观遗传学分析 | 第101-110页 |
| 6.1 分析方法与步骤 | 第101-104页 |
| 6.1.1 Outlier位点检测分析及潜在受选择位点检验 | 第101-103页 |
| 6.1.2 IBD与IBE分析 | 第103-104页 |
| 6.2 研究结果 | 第104-107页 |
| 6.2.1 潜在受选择位点：outlier位点检测,MLR分析 | 第104-106页 |
| 6.2.2 IBD和IBE结果 | 第106-107页 |
| 6.3 讨论 | 第107-108页 |
| 6.4 本章小结 | 第108-110页 |
| 第7章 讨论、结论与展望 | 第110-117页 |
| 7.1 讨论 | 第110-114页 |
| 7.1.1 基于cpDNA和ITS的群体遗传多样性与结构特征 | 第110-111页 |
| 7.1.2 谱系地理结构及早期分化原因 | 第111页 |
| 7.1.3 第四纪气候动荡对群体动态历史的影响 | 第111-112页 |
| 7.1.4 景观异质性对近期群体空间遗传结构的影响 | 第112-113页 |
| 7.1.5 物种保护的启示 | 第113-114页 |
| 7.2 结论 | 第114-115页 |
| 7.3 展望 | 第115-117页 |
| 参考文献 | 第117-140页 |
| 附录 | 第140-146页 |
| 在读期间的主要成果 | 第146-148页 |
| 致谢 | 第148-151页 |
