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四种被子植物热激转录因子基因家族的分子进化研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
1 文献综述第10-15页
    1.1 植物热激转录因子(HSF)的基本结构第10-11页
    1.2 植物HSF基因家族及其功能研究第11-12页
        1.2.1 植物HSF基因家族第11页
        1.2.2 植物HSF基因家族的功能研究第11-12页
    1.3 植物热激转录因子的调控机制第12页
    1.4 被子植物中比较基因组学的研究进展第12-13页
        1.4.1 种间比较基因组研究第12-13页
        1.4.2 种内比较基因组研究第13页
        1.4.3 被子植物的研究进展第13页
    1.5 基因复制和进化事件第13-15页
        1.5.1 基因复制第13页
        1.5.2 分子进化速率第13-15页
2 引言第15-18页
    2.1 研究目的与意义第15-17页
    2.2 技术路线第17-18页
3 材料与方法第18-25页
    3.1 实验材料与仪器设备第18-19页
        3.1.1 植株第18页
        3.1.2 质粒与菌株第18页
        3.1.3 仪器设备第18页
        3.1.4 酶与试剂第18-19页
        3.1.5 引物和合成及测序第19页
    3.2 主要试剂、培养基的配制第19页
        3.2.1 植物基因组中DNA和RNA提取试剂第19页
        3.2.2 细菌培养时LB、YEP培养基的配制第19页
    3.3 研究材料与方法第19-25页
        3.3.1 HSF基因在杨树和其它被子植物中的鉴定及命名第19-20页
        3.3.2 HSF基因结构域的系统进化树、基因结构和保守基序的分析第20页
        3.3.3 物种内的微共线性分析第20页
        3.3.4 物种间的微共线性分析第20页
        3.3.5 复制时间计算和选择压力分析第20-21页
        3.3.6 杨树HSF基因的表达谱分析第21页
        3.3.7 杨树HSF家族基因诱导表达模式分析第21-22页
        3.3.8 PtHsf-10 基因的克隆及测序第22-25页
4 结果与分析第25-46页
    4.1 杨树及其他被子植物中HSF基因的鉴定第25-28页
    4.2 HSF基因系统进化树的构建、结构和Motif分析第28-30页
    4.3 HSF 在四种被子植物中的复制事件第30-33页
    4.4 复制时间的计算第33-34页
    4.5 物种间的微共线性第34-35页
    4.6 HSF的纯化选择分析第35-39页
    4.7 杨树HSF基因在不同组织中的电子表达谱分析第39-41页
    4.8 杨树HSF基因家族诱导表达模式分析第41-43页
    4.9 PtHsf-10 基因的系统发育分析第43页
    4.10 PtHsf-10 基因在南林95杨中的荧光定量分析第43-44页
    4.11 PtHsf-10 基因的克隆及测序第44页
    4.12 PtHsf-10 基因的过表达载体构建与农杆菌转化第44-46页
讨论第46-48页
结论第48-49页
参考文献第49-54页
附录 A:qRT-PCR 扩增使用的引物列表第54-56页
附录 B:三十个 Motif 功能注释第56-58页
附录 C:保守复制基因的复制区块数量和相对分子质量第58-60页
致谢第60-61页
作者简介第61页
攻读硕士期间的研究成果第61页

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