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大豆叶形调控基因的图位克隆与功能分析

摘要第1-14页
ABSTRACT第14-20页
缩略语第20-21页
第一章 文献综述第21-45页
 1 株型及其在育种中的应用第21-22页
   ·理想株型概念的提出第21页
   ·叶形与理想株型育种第21-22页
 2 大豆叶形研究进展第22-25页
   ·叶形的分类及遗传第22页
   ·叶形与每荚粒数及产量的关系第22-23页
   ·叶形与生理性状的关系第23-24页
   ·叶形与地理生态分布第24页
   ·大豆叶形基因定位及克隆第24页
   ·大豆叶形相关突变体研究第24-25页
 3 叶器官形态建成第25-33页
   ·叶的发生、起始及其三维形态组成第25-26页
   ·叶三维形态建成机制第26-29页
   ·植物激素及其相关因子在叶起始与发育中的作用第29-30页
   ·叶脉结构及其调控第30-31页
   ·细胞周期(cell cycle)与叶发育第31-33页
 4 基因克隆及功能研究的主要策略第33-42页
   ·图位克隆第33-34页
   ·病毒诱导的基因沉默(VIGS)第34-37页
   ·功能基因组学第37-42页
 本研究的目的、意义与技术路线第42-45页
第二章 栽培大豆种质资源叶形变异与主要叶形参数第45-61页
 引言第45页
 1 材料和方法第45-49页
   ·试验材料第45-46页
   ·叶形参数定义及其相互关系第46-47页
   ·田间试验设计与性状调查第47-48页
   ·数据分析第48-49页
 2 结果与分析第49-56页
   ·不同叶形参数的次数分布特征第49-50页
   ·叶形指数、最大叶宽相对位置和叶尖张角归一化数据的比较第50-51页
   ·三种复合叶形参数对叶形的区分能力比较第51-52页
   ·依据叶尖张角对242份大豆叶形的划分第52-55页
   ·叶形指数、最大叶宽相对位置和叶尖张角相互关系验证第55-56页
 3 讨论第56-61页
   ·大豆传统叶形评价的局限第56-57页
   ·对大豆叶形经验判断的思考分析第57-58页
   ·叶形参数的生物学意义第58-59页
   ·表型与基因型的对应第59-61页
第三章 Ln基因的图位克隆与验证第61-83页
 引言第61页
 1 材料与方法第61-67页
   ·试验材料第61-62页
   ·遗传分析第62页
   ·分子标记选择及基因定位方法第62-63页
   ·基因型分析第63页
   ·候选基因分析第63-64页
   ·关键候选基因全长获取——3'RACE和5'RACE第64-65页
   ·VIGS干扰分析第65-66页
   ·Ln在拟南芥中的过表达分析第66-67页
   ·系统进化分析第67页
 2 结果与分析第67-78页
   ·群体构建及遗传分析第67-68页
   ·基因精细定位及候选基因分析第68-74页
   ·VIGS干扰分析第74-76页
   ·在拟南芥中的过表达分析第76-77页
   ·系统进化分析第77-78页
 3 讨论第78-83页
   ·窄叶大豆的人工选择和扩散第78-79页
   ·JAGGED家族基因结构、功能与演化第79-80页
   ·大豆基因图位克隆的困难与策略第80-83页
第四章 Ln基因功能分析第83-133页
 引言第83页
 1 材料与方法第83-91页
   ·蛋白二级结构预测第83页
   ·亚细胞定位分析第83-84页
   ·转录抑制活性检测第84-85页
   ·不同转录本对叶形和每荚粒数的影响分析第85-86页
   ·转录组分析第86-88页
   ·Ln近等基因系表型分析第88-89页
   ·Ln家族基因JAG对生长素分布的影响分析第89页
   ·蛋白组分析第89-90页
   ·Ln近等基因系对环境胁迫的响应分析第90-91页
   ·中国大豆品种的叶形与地理生态分布分析第91页
 2 结果与分析第91-120页
   ·Ln位点不同转录本蛋白的分子功能比较及对表型的影响第91-95页
   ·Ln→ln突变对全基因组基因转录水平的影响第95-99页
   ·Ln对下游基因表达的调控第99-102页
   ·Ln通过调控细胞周期相关基因的表达影响大豆叶形第102-107页
   ·Ln→ln突变对大豆光合系统的影响第107-108页
   ·Ln→ln突变对大豆生态环境适应的影响第108-111页
   ·Ln→ln突变对全基因组蛋白表达水平的影响第111-117页
   ·Ln→ln突变对全基因组转录和翻译水平影响的综合分析第117-118页
   ·Ln蛋白潜在结合元件第118-120页
 3 讨论第120-133页
   ·Ln基因对大豆叶形的调控第120-121页
   ·窄叶大豆和每荚粒数的关系第121-122页
   ·Ln在基因调控网络中的地位第122-123页
   ·窄叶大豆的生理特征与地理生态分布第123-126页
   ·Ln基因多效性的分子基础及可能的调控途径第126-133页
第五章 一个新的叶形突变体alf的初步研究第133-151页
 引言第133页
 1 材料与方法第133-137页
   ·试验材料第133-134页
   ·试验方法第134-137页
 2 结果与分析第137-148页
   ·表型鉴定及遗传分析第137-138页
   ·蛋白测定标准曲线建立第138-139页
   ·蛋白2-DE图谱第139页
   ·差异蛋白点鉴定第139-141页
   ·GO富集分析第141-143页
   ·差异表达蛋白GeneBins功能分析第143页
   ·分子标记连锁分析第143-144页
   ·基因定位及目标区段剩余杂合系选择第144-148页
 3 讨论第148-151页
   ·基于遗传背景来源、表型和引起的差异表达蛋白对alf基因变异及功能的推测第148-149页
   ·对双向电泳技术及结果分析的思考第149-151页
第六章 全文讨论、结论、创新点及研究展望第151-157页
 1. 全文讨论第151-154页
   ·Ln位点对叶形的贡献及鉴定第151-152页
   ·Ln基因对叶形的调控机制第152页
   ·Ln基因多效性及其对育种的启发第152-154页
   ·alf基因特征和潜在价值第154页
 2. 全文结论第154-155页
 3. 创新点第155-156页
 4. 研究展望第156-157页
参考文献第157-173页
附录第173-187页
致谢第187-189页
攻读博士期间发表及待发表的论文第189页

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