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线性泛素化连接酶LUBAC高通量底物筛选体系的建立

缩略词表第1-6页
摘要第6-9页
Abstract第9-12页
前言第12-17页
材料与方法第17-24页
 1 材料第17-18页
   ·菌株、细胞与质粒第17页
   ·主要试剂第17-18页
   ·主要仪器第18页
   ·主要试剂配方第18页
 2 方法第18-24页
   ·细胞培养及细胞冻存复苏第18-19页
   ·CRISPR敲除HOIP细胞系的构建第19-20页
     ·CRISPR靶序列设计第19页
     ·lentiCRISPRv2-sg RNA敲除表达载体的构建及阳性克隆的筛选第19页
     ·病毒包装第19页
     ·嘌呤霉素对HeLa细胞的最小致死量筛选第19页
     ·HeLa细胞的病毒感染及敲除效果检测第19-20页
   ·CRISPR敲除HOIP的HeLa细胞中表达HOIP~(WT)和HOIP~(CS)第20-21页
     ·利用点突变方法构建pCDH-GFP-T2A-HOIP~(CS)质粒第20页
     ·病毒包装第20页
     ·病毒感染CRISPR敲除HOIP的He La细胞系第20页
     ·病毒感染细胞的分选第20-21页
     ·CRISPR敲除HOIP的HeLa细胞中转染pcDNA3.0-Myc-HOIP~(WT)/CS第21页
   ·免疫共沉淀方法检测线性泛素化修饰第21页
   ·质谱鉴定第21-23页
   ·统计学方法第23-24页
实验结果第24-39页
 1 CRISPR稳定敲除HOIP的He La细胞系建立第24-25页
   ·CRISPR稳定敲除HOIP的lentiCRISPRv2-sgRNA质粒的构建第24页
   ·稳定敲除HOIP的HeLa细胞系的构建第24-25页
 2 利用CRISPR稳定敲除细胞系,构建用于LUBAC底物筛选的阳性细胞体系(HOIP~(WT)组和对照细胞体系HOIP~(CS)组)第25-28页
   ·pCDH-GFP-T2A-HOIP~(CS)质粒的构建第25页
   ·稳定敲除HOIP的HeLa细胞中稳定表达外源HOIP~(WT)和HOIP~(CS)第25-26页
   ·稳定表达外源HOIP~(WT)和HOIP~(CS)体系中LUBAC已知底物NEMO线性泛素化的检测第26-28页
 3 瞬时表达HOIP~(WT)和HOIP~(CS)体系中NEMO线性泛素化的检测第28-29页
 4 质谱方法验证阳性体系的建立以及LUBAC底物的初步鉴定结果第29-39页
讨论第39-41页
总结第41-42页
参考文献第42-48页
附录第48-248页
 附录1 NEMO线性泛素化位点鉴定的原始谱图第48-50页
 附录2 LUBAC底物筛选对照组线性泛素化蛋白质谱鉴定结果第50-135页
 附录3 LUBAC底物筛选实验组线性泛素化蛋白质谱鉴定结果第135-248页
个人简历第248-249页
致谢第249-250页

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