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基于线粒体基因序列分析裂腹鱼亚科的系统进化关系及中国沿海银鲳群体的遗传结构

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
第一章 引言第10-19页
   ·裂腹鱼亚科鱼类的生物学特性及研究进展第10-13页
     ·裂腹鱼亚科鱼类的生物学特性第10-11页
     ·裂腹鱼亚科鱼类的研究进展第11-13页
   ·银鲳的生物学特性和研究进展第13-15页
     ·银鲳的生物学特性第13-14页
     ·银鲳的研究进展第14-15页
   ·鱼类线粒体基因组结构特征及其在分子系统进化研究中的应用第15-18页
     ·鱼类线粒体基因组的基本结构特征第15-17页
     ·线粒体基因在分子系统进化研究中的应用第17-18页
   ·研究的目的及意义第18-19页
第二章 四种裂腹鱼亚科鱼类线粒体全基因组的结构特征分析第19-36页
   ·材料与方法第19-23页
     ·实验试剂和仪器第19-20页
     ·研究用的样本第20页
     ·总 DNA 的提取第20-21页
     ·线粒体全基因组序列 PCR 扩增和目的产物测序第21-22页
     ·序列的拼接和分析第22-23页
   ·实验结果第23-34页
     ·总 DNA 的提取第23页
     ·线粒体全基因组序列结构特征第23-25页
     ·四种裂腹鱼亚科鱼类线粒体的密码子偏好性分析第25页
     ·四种裂腹鱼亚科鱼类线粒体氨基酸使用率的比较分析第25-32页
     ·四种裂腹鱼亚科鱼类线粒体蛋白编码基因的相似性比较分析第32页
     ·四种裂腹鱼亚科鱼类线粒体 tRNA 差异性比较分析第32-33页
     ·四种裂腹鱼亚科鱼类线粒体非编码区的比较分析第33-34页
   ·讨论第34-36页
     ·线粒体全基因组序列的测定方法第34-35页
     ·线粒体的基因组成分析第35-36页
第三章 基于线粒体全基因组的裂腹鱼亚科的系统进化分析第36-57页
   ·材料方法第36-39页
     ·实验用材料第36页
     ·实验用样本第36页
     ·样本总 DNA 的提取第36-37页
     ·四种裂腹鱼亚科鱼类序列的 PCR 扩增和目的产物的测序第37页
     ·裂腹鱼亚科线粒体 DNA 全基因组序列数据的获取第37页
     ·裂腹鱼亚科线粒体 DNA 基因组的基本结构分析第37-38页
     ·裂腹鱼亚科线粒体 DNA 基因组的自然选择检验第38页
     ·基于裂腹鱼亚科鱼类线粒体基因组的系统进化分析第38-39页
   ·实验结果第39-53页
     ·实验样本总 DNA 的提取第39页
     ·13 种裂腹鱼亚科鱼类线粒体全基因组的基本特征第39-41页
     ·裂腹鱼亚科线粒体 DNA 基因组的自然选择检验结果第41-43页
     ·基于线粒体基因组不同区域的裂腹鱼亚科的系统进化分析第43-47页
     ·线粒体基因组不同区域对裂腹鱼亚科系统进化分析的适用性分析第47-53页
   ·讨论第53-57页
     ·鱼类线粒体基因组基本特征第53-54页
     ·自然选择检验第54页
     ·系统进化分析的建树方法比较第54-55页
     ·线粒体基因的不同区域对系统进化的适用性分析第55-57页
第四章 基于线粒体 CYTB 基因全序列的中国沿海银鲳的种群遗传结构研究第57-73页
   ·材料与方法第57-60页
     ·实验用试剂和仪器第57页
     ·实验用样本第57-59页
     ·总 DNA 的提取第59页
     ·银鲳线粒体 Cytb 基因的扩增、纯化及测序第59-60页
     ·Cytb 数据的分析第60页
   ·实验结果第60-70页
     ·总 DNA 的提取第60-61页
     ·Cytb 基因序列特征第61-62页
     ·银鲳群体的系统进化分析-基于 Cytb 序列第62-66页
     ·银鲳 6 个群体的遗传多样性与中性检验分析第66-68页
     ·分子方差分析第68-69页
     ·错配分布分析第69-70页
   ·讨论第70-73页
     ·群体的遗传多样性第70-71页
     ·种群的遗传结构第71-73页
小结第73-75页
参考文献第75-83页
附录第83-88页
致谢第88页

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