基于基因组重测序比较早实枳与普通枳遗传差异
| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 缩略词表 | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第12-20页 |
| ·课题的提出 | 第12-13页 |
| ·前人研究进展 | 第13-18页 |
| ·遗传变异的形成机理 | 第13-14页 |
| ·遗传变异的分析方法 | 第14-17页 |
| ·基因组重测序在遗传变异分析中的应用 | 第17页 |
| ·InDel标记的研究现状 | 第17-18页 |
| ·本研究的内容及意义 | 第18-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-35页 |
| ·试验材料 | 第20-23页 |
| ·植物材料 | 第20页 |
| ·菌株及质粒载体 | 第20-21页 |
| ·试剂和仪器 | 第21-22页 |
| ·培养基配方 | 第22-23页 |
| ·试验方法 | 第23-35页 |
| ·差异基因的筛选 | 第23-26页 |
| ·超表达载体构建 | 第26-30页 |
| ·根癌农杆菌介导的烟草遗传转化 | 第30-31页 |
| ·根癌农杆菌介导的拟南芥遗传转化 | 第31-33页 |
| ·荧光定量PCR | 第33-34页 |
| ·半定量RT-PCR | 第34-35页 |
| 3 结果与分析 | 第35-49页 |
| ·早实枳与普通枳全基因组重测序数据比较 | 第35-37页 |
| ·早实枳与普通枳中InDel差异的数量分布 | 第35-36页 |
| ·早实枳与普通枳中InDel差异的分布区域 | 第36-37页 |
| ·转录组中InDel的比较分析 | 第37页 |
| ·早实枳关键差异Indel基因的筛选 | 第37-39页 |
| ·InDel差异数据可靠性分析 | 第37-38页 |
| ·关键InDel差异基因的筛选 | 第38-39页 |
| ·InDel差异基因的验证 | 第39-43页 |
| ·差异基因表达模式验证 | 第43-45页 |
| ·差异Pt-Cc-061基因氨基酸序列分析 | 第43页 |
| ·差异基因时空表达 | 第43-45页 |
| ·UN基因表达载体的构建 | 第45-47页 |
| ·质粒载体和UN基因的酶切 | 第45-46页 |
| ·含UN基因载体的农杆菌PCR阳性检测 | 第46-47页 |
| ·农杆菌介导的烟草遗传转化 | 第47页 |
| ·农杆菌介导的拟南芥遗传转化 | 第47-49页 |
| 4 讨论 | 第49-53页 |
| ·早实枳和普通枳遗传背景差异 | 第49页 |
| ·发育相关基因的发现 | 第49-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 附录 | 第59-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
