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仔猪腹泻相关基因GPI1的筛选及其功能研究

摘要第1-6页
Abstract第6-12页
第一章 文献综述第12-23页
 1 ETEC F4受体研究现状第12-17页
   ·F4受体的类型第12-14页
   ·受体的生化特征第14-15页
   ·肠毒素大肠杆菌F4是导致仔猪腹泻的重要的粘附素第15-17页
 2 拷贝数量变异(CNV)及其检测第17-19页
   ·拷贝数量变异(CNV)第17-18页
   ·CNVs对疾病的影响第18页
   ·比较基因组杂交(CGH)第18-19页
 3 GPI是细胞重要的免疫受体信号转导蛋白第19-20页
 4 GPI1基因的表达与抗病性紧密相关第20-21页
 5 本研究的目的与意义第21-23页
第二章 基因芯片法筛选F4受体相关CNVs第23-35页
 1 材料与方法第23-24页
   ·试验动物第23页
   ·大肠杆菌体外粘附测定第23-24页
   ·基因芯片第24页
   ·材料准备第24页
   ·数据分析方法第24页
 2 结果与分析第24-32页
   ·F4黏附型判定及黏附结果第24页
   ·Array-CGH检测F4受体相关CNVs及其基因第24-32页
 3 讨论第32-34页
   ·关于array-CGH芯片第32-33页
   ·关于检出的CNVs第33-34页
 4 小结第34-35页
第三章 GPI1基因部分序列的克隆第35-58页
 1 材料第35-36页
   ·试验动物第35页
   ·实验试剂第35-36页
 2 方法第36-44页
   ·总RNA的提取第36-38页
   ·总RNA的DNaseⅠ消化第38-39页
   ·cDNA合成第39页
   ·目的基因PCR第39-42页
   ·克隆测序第42-44页
   ·主要分子生物学分析工具软件第44页
 3 结果与分析第44-56页
   ·提取的样品总RNA的检测第44-45页
   ·cDNA的PCR扩增结果第45页
   ·目的基因片段的克隆和测序第45-46页
   ·目的基因片段的序列第46-47页
   ·目的基因片段的序列分析第47-48页
   ·基因序列提交第48-49页
   ·GPI1基因的蛋白质结构与基本特性第49-56页
 4 讨论第56-57页
   ·RNA的质量第56页
   ·GP1\基因及其蛋白质结构预测第56-57页
 5 小结第57-58页
第四章 GPI1基因的表达差异分析第58-66页
 1 试验材料第58页
   ·试验动物和样品第58页
   ·酶和试剂第58页
   ·主要仪器第58页
 2 试验方法第58-61页
   ·引物设计第58-59页
   ·试验分组第59页
   ·总RNA提取第59页
   ·荧光定量PCR标准品的制备第59-60页
   ·Real time RT-PCR检测GPI1基因的表达水平第60-61页
   ·统计分析第61页
 3 结果与分析第61-64页
   ·标准曲线的建立第61-62页
   ·GPI1基因的表达差异分析第62-64页
 4 讨论第64-65页
   ·关于荧光定量PCR第64页
   ·关于GPI1基因的表达差异第64-65页
 5 小结第65-66页
第五章 GPI1基因部分序列多态性与腹泻抗性的关联分析第66-76页
 1 材料第66页
   ·试验用猪及耳样第66页
   ·主要仪器和设备第66页
   ·主要药品和试剂第66页
   ·主要分子生物学分析工具软件第66页
 2 实验方法第66-69页
   ·猪基因组DNA的提取第66-67页
   ·猪GPI1基因序列候选SNPs位点的预测第67页
   ·猪GPI1基因exon3和exon5的PCR扩增第67-68页
   ·猪GPI1基因PCR-RFLP分析第68页
   ·测序第68页
   ·统计分析第68-69页
 3 结果与分析第69-74页
   ·猪GPI1基因exon3和exon5酶切位点和内切酶的预测第69页
   ·GPI1基因两个外显子的扩增结果第69-70页
   ·GPI1基因两个多态位点的PCR-RFLP分析第70-72页
   ·GPI1基因两个外显子的遗传结构分析第72-74页
 4 讨论第74-75页
   ·利用生物信息学方法筛选SNPs第74页
   ·exon3和exon5的SNPs与黏附特性的关联第74-75页
 5 小结第75-76页
第六章 结论第76-79页
 1 主要研究结果第76-77页
 2 创新之处第77页
 3 展望第77-79页
参考文献第79-96页
附录第96-106页
致谢第106-107页
作者简历第107-108页

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