| 符号说明 | 第1-9页 |
| 中文摘要 | 第9-12页 |
| summary | 第12-16页 |
| 文献综述 | 第16-32页 |
| 1 影响鸡繁殖性状的因素 | 第16-18页 |
| ·光照 | 第16页 |
| ·温度 | 第16-17页 |
| ·饲料营养 | 第17-18页 |
| ·遗传因素 | 第18页 |
| 2 影响鸡繁殖性状的相关基因 | 第18-23页 |
| ·极低密度脂蛋白受体 | 第18-19页 |
| ·骨形态发生蛋白受体IB | 第19-21页 |
| ·骨形态发生蛋白 15 | 第21-23页 |
| 3 关于miRNA | 第23-30页 |
| ·miRNA的发现 | 第23-24页 |
| ·miRNA的命名 | 第24页 |
| ·miRNA的特征 | 第24-25页 |
| ·miRNA的生物合成机制 | 第25-26页 |
| ·miRNA的作用机制及其功能 | 第26-28页 |
| ·miRNA在家禽中的相关研究 | 第28-30页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第30-32页 |
| 第一章 VLDLR、BMPR-IB和BMP15 基因多态性与遗传效应分析 | 第32-71页 |
| 前言 | 第32页 |
| 1 试验材料 | 第32-34页 |
| ·实验群体 | 第32页 |
| ·主要仪器设备 | 第32-33页 |
| ·主要药品和限制性内切酶 | 第33页 |
| ·主要试剂及配制 | 第33-34页 |
| ·主要数据库及分析软件 | 第34页 |
| 2 试验方法 | 第34-41页 |
| ·性状测定记录 | 第34-35页 |
| ·血液基因组DNA抽提 | 第35页 |
| ·DNA池构建 | 第35页 |
| ·引物信息 | 第35-38页 |
| ·基因型分析 | 第38-39页 |
| ·DNA片段的克隆测序 | 第39-41页 |
| ·单倍型构建及关联分析 | 第41页 |
| 3 结果与分析 | 第41-64页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第41-42页 |
| ·VLDLR基因多态位点与繁殖性状关联分析 | 第42-50页 |
| ·BMPR-IB基因多态位点与繁殖性状关联分析 | 第50-58页 |
| ·BMP15 基因多态位点与繁殖性状关联分析 | 第58-64页 |
| 4 讨论 | 第64-69页 |
| 5 结论 | 第69-71页 |
| 第二章 VLDLR、BMPR-IB和BMP15 基因的表达分析 | 第71-84页 |
| 前言 | 第71页 |
| 1 试验材料 | 第71页 |
| ·试验群体 | 第71页 |
| ·主要仪器设备 | 第71页 |
| ·主要试剂 | 第71页 |
| 2 试验方法 | 第71-74页 |
| ·性状测定记录 | 第71-72页 |
| ·样本总RNA抽提 | 第72页 |
| ·RNA质量检测 | 第72页 |
| ·反转录 | 第72-73页 |
| ·RealTimePCR | 第73-74页 |
| 3 结果与分析 | 第74-79页 |
| ·总RNA电泳图 | 第74页 |
| ·荧光定量PCR扩增的标准曲线及溶解曲线 | 第74-75页 |
| ·鸡VLDLR基因表达规律 | 第75-77页 |
| ·鸡BMP15 基因表达规律 | 第77-78页 |
| ·鸡BMPR-IB基因表达规律 | 第78-79页 |
| 4 讨论 | 第79-83页 |
| 5 结论 | 第83-84页 |
| 第三章 高、低产汶上芦花鸡卵巢组织的转录组分析 | 第84-96页 |
| 前言 | 第84-86页 |
| 1 试验材料 | 第86页 |
| 2 试验方法 | 第86-88页 |
| ·卵巢组织总RNA制备提取 | 第86-87页 |
| ·高、低产鸡卵巢组织转录组测序技术路线 | 第87-88页 |
| ·转录组测序数据分析流程 | 第88页 |
| 3 结果与分析 | 第88-93页 |
| ·RNA质量检测 | 第88-89页 |
| ·原始测序数据产出量 | 第89页 |
| ·获得基因的GO注释及分类统计 | 第89-90页 |
| ·获得基因的pathway注释分析 | 第90页 |
| ·差异表达基因 | 第90-93页 |
| ·基因差异基因的GO注释及分类统计 | 第93页 |
| 4 讨论 | 第93-95页 |
| 5 结论 | 第95-96页 |
| 第四章 高、低产汶上芦花鸡卵巢差异表达miRNAs分析 | 第96-106页 |
| 前言 | 第96页 |
| 1 试验材料 | 第96-97页 |
| 2 试验方法 | 第97-98页 |
| ·卵巢组织总RNA制备提取 | 第97页 |
| ·小RNA测序技术路线 | 第97页 |
| ·小RNA测序数据分析流程 | 第97-98页 |
| 3 结果与分析 | 第98-102页 |
| ·RNA质量检测 | 第98页 |
| ·原始测序数据产出量 | 第98页 |
| ·序列长度分布统计 | 第98-99页 |
| ·Clean reads的碱基偏好 | 第99-100页 |
| ·NcRNA的过滤去除 | 第100-101页 |
| ·高、低产卵巢组织中的miRNAs分析 | 第101页 |
| ·高、低产卵巢组织中的差异表达miRNAs分析 | 第101-102页 |
| 4 讨论 | 第102-104页 |
| 5 结论 | 第104-106页 |
| 第五章 全文结论 | 第106-109页 |
| 1 结论 | 第106-108页 |
| 2 有待解决的问题 | 第108-109页 |
| 参考文献 | 第109-130页 |
| 作者简历 | 第130-131页 |
| 导师简介 | 第131-132页 |
| 致谢 | 第132页 |
