抗冻蛋白序列的模体分析与预测
摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-8页 |
目录 | 第8-10页 |
第一章 绪论 | 第10-18页 |
·研究课题的背景和意义 | 第10-12页 |
·国内外研究现状和进展 | 第12-14页 |
·抗冻蛋白的作用机制 | 第13页 |
·抗冻蛋白的预测 | 第13-14页 |
·数据库和软件介绍 | 第14-17页 |
·UniProt数据库 | 第14-16页 |
·蛋白质结构数据库PDB | 第16页 |
·PISCES软件 | 第16页 |
·模体搜索软件 | 第16-17页 |
·论文结构安排 | 第17-18页 |
第二章 抗冻蛋白序列的模体分析 | 第18-23页 |
·抗冻蛋白数据集的构建 | 第18页 |
·数据集序列相似性分析 | 第18-19页 |
·抗冻蛋白序列的分类 | 第19-20页 |
·抗冻蛋白序列模体的提取与分析 | 第20-21页 |
·有结构的抗冻蛋白 | 第21-23页 |
第三章 理论预测算法 | 第23-28页 |
·引言 | 第23页 |
·特征提取 | 第23-25页 |
·氨基酸组成成分信息 | 第23-24页 |
·氨基酸序列的n肽组分信息 | 第24页 |
·氨基酸的物理化学特征分布信息 | 第24-25页 |
·支持向量机算法 | 第25-26页 |
·算法的检验与评估 | 第26-28页 |
第四章 抗冻蛋白的预测 | 第28-32页 |
·数据集的构建 | 第28页 |
·特征参数集的构建 | 第28-29页 |
·SVM算法预测的结果与讨论 | 第29-32页 |
·单个特征参数的预测结果与讨论 | 第29-30页 |
·多个特征参数的预测结果与讨论 | 第30-32页 |
第五章 总结与展望 | 第32-33页 |
·全文总结 | 第32页 |
·展望 | 第32-33页 |
参考文献 | 第33-39页 |
附录 | 第39-44页 |
致谢 | 第44-45页 |
攻读硕士学位期间发表和完成的论文目录 | 第45页 |