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南四湖沉积物细菌多样性研究

摘要第1-4页
Abstract第4-7页
1 文献综述第7-12页
   ·微生物多样性研究进展第7页
   ·传统方法第7-8页
   ·生物标记法第8页
   ·分子生物学法第8-9页
     ·RFLP 技术第8页
     ·变形梯度凝胶电泳(DGGE/TGGE)第8-9页
   ·湖泊湿地生态系统微生物多样性研究现状第9-10页
   ·实验技术路线第10-11页
     ·基本原理第10页
     ·基因组总 DNA 的 16S rDNA 扩增第10页
     ·16S rDNA 文库构建第10-11页
   ·本课题的选题依据第11-12页
2 材料与方法第12-19页
   ·样品采集第12页
   ·主要试剂和溶液的配置第12-13页
   ·主要实验仪器第13页
   ·PCR 引物第13页
   ·沉积物总 DNA 的提取第13-14页
   ·PCR 扩增 16S rDNA 片段第14-15页
     ·PCR 扩增体系第14页
     ·PCR 扩增条件第14-15页
     ·PCR 扩增产物的纯化第15页
   ·16S rDNA 文库的构建第15-17页
     ·纯化片段与载体的连接第15页
     ·感受态细胞 DH5a 的制备第15-16页
     ·转化第16页
     ·阳性克隆的筛选第16-17页
     ·ARDRA 分型第17页
     ·克隆文库数据分析第17页
   ·序列的测定第17-18页
   ·序列的比较分析与数据处理第18-19页
3 实验结果第19-36页
   ·南四湖水质理化数据测定结果第19页
   ·细菌总 DNA 的提取第19页
   ·16S rDNA 片段的扩增第19-20页
   ·16S rDNA 文库的建立第20-21页
   ·菌落 PCR 筛选阳性克隆第21页
   ·细菌 16S rDNA 扩增片段的限制性酶切分析第21页
   ·DNA 序列的测定第21-22页
   ·南四湖细菌 16S rDNA 序列比对分析第22-28页
   ·南四湖细菌 16S rDNA 系统进化分析第28-36页
4 讨论第36-38页
   ·沉积物微生物多样性的研究方法第36页
   ·数据分析第36-37页
   ·南四湖沉积物中的优势种群变形菌第37-38页
5 结论和展望第38-39页
参考文献第39-42页
致谢第42页

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