| 致谢 | 第4-8页 |
| 摘要 | 第8-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-16页 |
| 1.1 甜瓜的耐冷性 | 第11-13页 |
| 1.1.1 甜瓜幼苗冷害症状 | 第11-12页 |
| 1.1.2 甜瓜耐冷性鉴定指标和评价方法 | 第12-13页 |
| 1.1.2.1 耐冷性鉴定指标 | 第12页 |
| 1.1.2.2 耐冷性评价方法 | 第12-13页 |
| 1.2 植物耐冷性相关基因研究概况 | 第13-14页 |
| 1.2.1 植物低温应答转录调控 | 第13页 |
| 1.2.2 植物耐冷性QTL定位 | 第13-14页 |
| 1.3 甜瓜基因组学研究进展 | 第14页 |
| 1.4 关联分析在植物数量性状研究中的应用 | 第14-16页 |
| 1.4.1 关联分析的基本原理 | 第14-15页 |
| 1.4.2 关联分析的应用 | 第15-16页 |
| 1.5 研究目的及意义 | 第16页 |
| 2 引言 | 第16-17页 |
| 3 材料与方法 | 第17-24页 |
| 3.1 试验材料 | 第17页 |
| 3.2 幼苗低温胁迫处理 | 第17-20页 |
| 3.2.1 用于低温处理的种质材料 | 第17-18页 |
| 3.2.2 低温处理及相关指标的统计 | 第18-19页 |
| 3.2.2.1 生理指标的获取 | 第18页 |
| 3.2.2.2 生长指标的获取 | 第18-19页 |
| 3.2.3 核心种质的低温处理及耐冷指标的统计 | 第19-20页 |
| 3.3 隶属函数计算 | 第20-21页 |
| 3.4 SSR标记全基因组扫描 | 第21页 |
| 3.4.1 引物筛选与开发 | 第21页 |
| 3.4.2 PCR反应条件和反应体系 | 第21页 |
| 3.5 分子标记数据分析 | 第21-23页 |
| 3.5.1 聚类分析 | 第22页 |
| 3.5.2 群体结构分析 | 第22页 |
| 3.5.3 亲缘关系分析 | 第22-23页 |
| 3.6 全基因组关联分析 | 第23-24页 |
| 3.6.1 连锁不平衡分析 | 第23页 |
| 3.6.2 GLM模型的关联分析 | 第23-24页 |
| 3.7 优异等位变异分析 | 第24页 |
| 4 结果与分析 | 第24-60页 |
| 4.1 甜瓜耐冷性的评价体系的构建 | 第24-32页 |
| 4.1.1 低温处理对幼苗各单项指标的影响 | 第24-27页 |
| 4.1.2 主成分分析筛选综合耐冷指标 | 第27-28页 |
| 4.1.3 耐冷性的综合评价 | 第28-30页 |
| 4.1.3.1 隶属函数分析 | 第28页 |
| 4.1.3.2 权重计算 | 第28页 |
| 4.1.3.3 综合评价 | 第28-30页 |
| 4.1.4 回归函数的建立 | 第30-31页 |
| 4.1.5 不同耐冷性类别特征分析 | 第31-32页 |
| 4.2 甜瓜核心种质的耐冷性变异 | 第32-35页 |
| 4.2.1 厚皮甜瓜幼苗的耐冷性变异 | 第32-33页 |
| 4.2.2 薄皮甜瓜幼苗的耐冷性变异 | 第33-35页 |
| 4.3 分子标记多态性 | 第35-44页 |
| 4.3.1 标记的密度和分布 | 第35-37页 |
| 4.3.2 标记的基本统计指标 | 第37-43页 |
| 4.3.3 薄皮种质的SSR分型 | 第43页 |
| 4.3.4 厚皮种质的SSR分型 | 第43页 |
| 4.3.5 厚皮和薄皮种质的比较 | 第43-44页 |
| 4.4 聚类分析 | 第44-46页 |
| 4.5 群体结构分析 | 第46-49页 |
| 4.5.1 甜瓜核心种质的群体结构 | 第46-47页 |
| 4.5.2 厚皮甜瓜群体结构分析 | 第47-48页 |
| 4.5.3 薄皮甜瓜群体结构分析 | 第48-49页 |
| 4.6 亲缘关系 | 第49-50页 |
| 4.7 耐冷性的GWAS分析 | 第50-56页 |
| 4.7.1 LD分析 | 第50-51页 |
| 4.7.1.1 厚皮群体LD分析 | 第50-51页 |
| 4.7.1.2 薄皮群体LD分析 | 第51页 |
| 4.7.2 基于GLM模型耐冷性相关的SSR位点分析 | 第51-56页 |
| 4.7.2.1 厚皮甜瓜种质的SSR耐冷位点 | 第51-54页 |
| 4.7.2.2 薄皮甜瓜种质的SSR耐冷位点 | 第54-56页 |
| 4.8 优异等位基因的分析 | 第56-60页 |
| 4.8.1 入选优异等位变异分析位点的确定 | 第56页 |
| 4.8.2 优异等位基因的表型效应及其载体材料 | 第56-60页 |
| 5 讨论 | 第60-65页 |
| 5.1 甜瓜幼苗耐冷性评价体系的可靠性 | 第60-61页 |
| 5.2 甜瓜幼苗耐性表型鉴定 | 第61-62页 |
| 5.3 甜瓜核心种质作为关联分析群体的可行性 | 第62页 |
| 5.4 基于GWAS的甜瓜幼苗耐冷性SSR位点 | 第62-63页 |
| 5.5 优异等位变异的利用途径 | 第63页 |
| 5.6 本研究结果的问题与改进措施 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-70页 |
| ABSTRACT | 第70-73页 |
| 附录1 192份甜瓜种质 | 第74-77页 |
| 附录2 272 对引物信息 | 第77-88页 |