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越橘果实转录组文库Solexa测序及花色素苷合成相关基因的表达分析

摘要第1-6页
Abstract第6-12页
第一章 前言第12-32页
   ·转录组研究概述第12-14页
   ·测序技术研究进展第14-18页
   ·基于高通量测序技术的转录组测序(RNA-Seq)第18-23页
   ·越橘花色素苷研究背景第23-30页
   ·研究的目的、内容和技术路线第30-32页
第二章 越橘果实转录组文库的构建及Solexa测序第32-66页
   ·材料与方法第32-39页
     ·植物材料第32-33页
     ·cDNA文库构建和测序第33-36页
     ·RNA-Seq信息分析第36-39页
   ·结果与分析第39-62页
     ·RNA提取及质量检测第39-40页
     ·数据产量及组装结果第40-44页
     ·All-unigene的功能注释第44-45页
     ·All-unigene的GO分类第45-46页
     ·All-unigene的代谢通路分析第46-47页
     ·编码蛋白框(CDS)预测第47-49页
     ·All-unigene的表达差异分析第49-62页
   ·讨论第62-66页
第三章 越橘花色素苷生物合成途径中重要酶基因的筛选与表达分析第66-80页
   ·材料与方法第66-70页
     ·植物材料第66页
     ·越橘花色素苷合成途径重要酶基因的筛选标准第66-67页
     ·候选基因的表达分析第67-70页
     ·越橘花色素苷含量的测定第70页
   ·结果与分析第70-77页
     ·花色素苷生物合成相关基因筛选结果第70-74页
     ·花色素苷生物合成相关基因在越橘果实发育过程中的表达分析第74-76页
     ·越橘果实成熟过程中花色素苷含量变化第76-77页
   ·讨论第77-80页
第四章 越橘花色素苷生物合成途径中关键酶基因的全长克隆与序列分析第80-90页
   ·材料与方法第81-84页
     ·植物材料第81页
     ·RACE技术克隆VcANS基因全长cDNA第81-84页
     ·序列分析第84页
   ·结果与分析第84-89页
     ·越橘VcANS基因全长cDNA序列的获得第84-85页
     ·越橘VcANS全长cDNA及其编码氨基酸序列的特征分析第85-88页
     ·VcANS基因编码氨基酸序列系统进化分析第88-89页
   ·讨论第89-90页
第五章 结论第90-91页
主要创新点第91页
进一步研究设想第91-92页
参考文献第92-105页
附录第105-111页
致谢第111-112页
作者简介第112页

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