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猪骨骼肌中印记基因的分析

中文摘要第1-10页
Abstract第10-12页
1 前言第12-23页
   ·印记基因的进化与发展第12-13页
   ·基因组印记特征第13-15页
     ·印记基因是成簇存在的第13-14页
     ·印记域中的非编码 RNA第14页
     ·印记基因表达的时空性第14-15页
     ·印记基因的保守性第15页
     ·印记域中的印记控制元件第15页
   ·印记基因的调控机制第15-17页
     ·印记的形成和维持第15-16页
     ·DNA 甲基化与基因组印记第16-17页
     ·印记基因的启动子修饰模式第17页
     ·绝缘子模型第17页
   ·印记基因的检测第17-18页
     ·细胞融合第17-18页
     ·系统扫描第18页
     ·基于 mRNA 差异显示的 AMD 方法第18页
     ·基因芯片第18页
     ·表达的 SNP 法第18页
   ·印记的生物学作用及研究意义第18-20页
     ·对胚胎和新生儿生长的作用第18-19页
     ·胚胎移植和动物克隆第19页
     ·人类疾病第19页
     ·家畜育种第19-20页
     ·生物进化第20页
   ·候选基因的研究现状第20-21页
     ·PWS-AS 综合征印记域第20-21页
     ·OSBPL5第21页
   ·本研究的目的及意义第21-23页
2 材料与方法第23-33页
   ·实验动物与样品采集第23页
     ·实验动物第23页
     ·样品采集第23页
   ·分子生物学数据库及软件第23页
   ·主要仪器设备第23-24页
   ·主要试剂及来源第24-25页
   ·主要试剂、培养基配制第25-26页
   ·实验方法第26-33页
     ·正反交实验设计第26-27页
     ·猪耳组织基因组提取第27页
     ·各组织 RNA 提取第27-28页
     ·DNaseⅠ消化及反转录第28页
     ·序列拼接基因克隆以及构建系统进化树第28-29页
     ·C/T 转换及 DNA 甲基化检测第29页
     ·PCR 及 PCR-RFLP 体系第29-31页
     ·cSNP 的鉴定及印记分析第31-33页
3 结果与分析第33-61页
   ·核酸提取第33-35页
     ·基因组的提取第33页
     ·RNA 提取及 cDNA 制备第33-35页
     ·SNRPN 基因第35-38页
     ·猪 SNRPN 基因克隆、序列分析第35页
     ·氨基酸同源性对比第35-37页
     ·cSNP 鉴定及印记分析第37-38页
     ·组织表达分析第38页
   ·NECD 基因第38-42页
     ·NECD 基因氨基酸同源性分析第38-40页
     ·cSNP 鉴定及印记分析第40页
     ·组织表达分析第40-42页
   ·UBE3A 基因第42-47页
     ·猪 UBE3A 基因克隆、序列分析第42-43页
     ·氨基酸同源性对比第43-46页
     ·cSNP 鉴定及印记分析第46页
     ·组织表达分析第46-47页
   ·MKRN3 基因第47-53页
     ·氨基酸同源性对比第47-49页
     ·cSNP 鉴定及印记分析第49-51页
     ·启动子甲基化分析第51-53页
     ·组织表达分析第53页
   ·OSBPL5 基因第53-61页
     ·氨基酸同源性对比第53-55页
     ·cSNP 及等位基因不平衡表达第55-57页
     ·5’远端 CpG 岛甲基化分析第57页
     ·组织表达分析第57-58页
     ·g.1873 多态群体检测结果第58-59页
     ·基因型与性状关联性分析第59-61页
4 讨论第61-64页
   ·候选基因的筛选第61页
   ·基因克隆第61页
   ·印记鉴定“表达的 SNP”法第61-62页
   ·猪品种间杂交实验第62页
   ·候选基因印记分析第62-64页
5 结论第64-65页
参考文献第65-73页
致谢第73-74页
攻读硕士期间发表论文情况第74-75页
附录 1第75-76页
附录 2第76-78页

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