大规模代谢网络极端途径的计算及可视化研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-16页 |
| ·课题背景 | 第9-14页 |
| ·系统生物学背景 | 第9-10页 |
| ·代谢网络的研究现状 | 第10-14页 |
| ·课题来源，目标及意义 | 第14-15页 |
| ·本文内容和结构 | 第15页 |
| ·本章小结 | 第15-16页 |
| 第2章 代谢网络的描述 | 第16-27页 |
| ·代谢网络研究概述 | 第16-20页 |
| ·极端途径和基元模式的应用 | 第20-21页 |
| ·求解极端途径的算法 | 第21-25页 |
| ·算法描述 | 第21-22页 |
| ·算法示例 | 第22-25页 |
| ·极端途径的分类 | 第25-26页 |
| ·本章小结 | 第26-27页 |
| 第3章 代谢网络的分解计算 | 第27-38页 |
| ·极端途径的分解计算 | 第27-29页 |
| ·代谢网络的分解 | 第27-28页 |
| ·分解计算的算法 | 第28-29页 |
| ·基于聚类的分解算法 | 第29-30页 |
| ·基于谱图论的分解算法 | 第30-32页 |
| ·算法描述 | 第30-31页 |
| ·算法示例 | 第31-32页 |
| ·两种分解算法的比较 | 第32-33页 |
| ·独立性检测方法的改进 | 第33页 |
| ·分解计算的实验分析 | 第33-37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 第4章 通路的可视化 | 第38-43页 |
| ·引论 | 第38页 |
| ·一个代谢通路的布局算法 | 第38-41页 |
| ·结果示例说明 | 第41页 |
| ·本章小结 | 第41-43页 |
| 第5章 系统实现 | 第43-49页 |
| ·系统概述 | 第43-44页 |
| ·模型文件 | 第44页 |
| ·系统模块介绍 | 第44-47页 |
| ·系统实现所用的技术 | 第47-48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 结论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-55页 |
| 致谢 | 第55页 |
