| 中文摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 前言 | 第12-16页 |
| 第一章 人类胚胎干细胞的培养和分化 | 第16-27页 |
| 1 材料与方法 | 第16-19页 |
| ·材料和仪器 | 第16-17页 |
| ·方法 | 第17-19页 |
| 2 结果与分析 | 第19-25页 |
| ·胰酶消化传代使hES 细胞在大规模培养过程中仍维持良好的形态 | 第19-20页 |
| ·hESC 在培养过程中维持多潜能性 | 第20-21页 |
| ·hESC 自主分化为EB 细胞 | 第21-23页 |
| ·hESC 定向诱导分化为神经前体细胞（NPC） | 第23-25页 |
| 3 讨论 | 第25-26页 |
| ·发现人类胚胎干细胞系H9 在体外培养中的异质性 | 第25-26页 |
| ·hESC 培养方法优化 | 第26页 |
| 4 小结 | 第26-27页 |
| 第二章 4C-克隆筛选方法建立中的质量控制 | 第27-36页 |
| 1 材料和方法 | 第27-29页 |
| ·材料 | 第27-28页 |
| ·方法 | 第28-29页 |
| 2 结果与分析 | 第29-33页 |
| ·SOX2 Bait 的扩增和pMD18-T-SOX2-bait 载体构建 | 第29-31页 |
| ·PCR 条件的优化 | 第31-32页 |
| ·4C-克隆筛选方法的实例验证 | 第32-33页 |
| 3 讨论 | 第33-36页 |
| 第三章 有限4C-克隆筛选发现调节SOX2 基因表达潜在调控元件 | 第36-54页 |
| 1 材料和方法 | 第37-40页 |
| ·材料 | 第37-38页 |
| ·方法 | 第38-40页 |
| 2 实验结果 | 第40-50页 |
| ·SOX2 基因座位调控元件预测分析 | 第40-41页 |
| ·有限克隆筛选染色体内部相互作用以及3C 引物的设计 | 第41-44页 |
| ·3C 模板的质量控制以及实验条件的优化 | 第44页 |
| ·hESC 向EB 细胞分化中SOX2 表达阶段性改变 | 第44-45页 |
| ·Region1 为锚定序列相互作用验证 | 第45页 |
| ·Region2 为锚定区域相互作用验证 | 第45-49页 |
| ·Region011 可能具有远距离增强子活性 | 第49-50页 |
| 3 讨论 | 第50-52页 |
| ·SOX2 基因的调控模式体现出细胞特异性的特点 | 第50-52页 |
| ·蛋白复合体可能介导了染色体特异的相互作用 | 第52页 |
| ·调控SOX2 基因表达的其他机制 | 第52页 |
| 4 小结 | 第52-54页 |
| 第四章 4C-Seq 全基因组筛选与SOX2 相互作用的DNA 元件 | 第54-64页 |
| 1 材料和方法 | 第54-55页 |
| ·材料 | 第54页 |
| ·方法 | 第54-55页 |
| 2 实验结果 | 第55-62页 |
| ·SOX2 Bait（诱饵）片段的选择及其生物信息学分析 | 第55-56页 |
| ·4C-Seq 样品的制备 | 第56-57页 |
| ·4C-Seq 数据筛选与分析 | 第57-62页 |
| 3 讨论 | 第62-63页 |
| 4 小结 | 第63-64页 |
| 第五章 3D-DNA FISH 验证染色体间的相互作用 | 第64-77页 |
| 1 材料和方法 | 第64-65页 |
| ·材料 | 第64页 |
| ·方法 | 第64-65页 |
| 2 实验结果 | 第65-74页 |
| ·染色体间共定位的判定 | 第65-66页 |
| ·4C-seq 命中片段的相互作用验证 | 第66-67页 |
| ·SOX2 与HMCN1 基因的相互作用具有细胞特异性 | 第67-69页 |
| ·HMCN1 与SOX2 相互作用的生物学意义 | 第69-71页 |
| ·hESC 核心调控网络相关基因的空间分布 | 第71页 |
| ·hESC 中受到多个转录因子结合保守序列的空间分布 | 第71-74页 |
| 3 讨论 | 第74-75页 |
| ·对3D-DNA FISH 方法的评价 | 第74-75页 |
| ·染色体在细胞核空间靠近的生物学意义和机制探讨 | 第75页 |
| 4 小结 | 第75-76页 |
| 5 论文总结和下一步工作计划 | 第76-77页 |
| 参考文献 | 第77-81页 |
| 附录 | 第81-89页 |
| 文献综述 | 第89-99页 |
| 文献综述 | 第96-99页 |
| 相关论文 | 第99-107页 |
| 个人简历 | 第107-108页 |
| 致谢 | 第108页 |
