缩略名词表 | 第1-8页 |
摘要 | 第8-11页 |
ABSTRACT | 第11-14页 |
1 前言 | 第14-33页 |
·MICRORNA—具有调节功能的NO-CODING RNA | 第14-23页 |
·Modern small RNA world | 第14-15页 |
·MicroRNA基因的发现和特点 | 第15-18页 |
·MicroRNA在拟南芥中的形成过程 | 第18-19页 |
·MicroRNA的对靶位点的识别 | 第19-20页 |
·microRNA调节靶基因的机制 | 第20-21页 |
·MicroRNA的进化 | 第21-22页 |
·与MicroRNA相关的一些研究方法 | 第22-23页 |
·MICRORNA在拟南芥生长发育中的调节作用 | 第23-29页 |
·MicroRNA与植物的生长发育 | 第23-26页 |
·MicroRNA与植物的激素 | 第26-27页 |
·MicroRNA与植物的逆境应答 | 第27-28页 |
·MicroRNA与small RNA的代谢 | 第28-29页 |
·其他几类具有调节功能的SMALL RNA的研究进展 | 第29-30页 |
·26—30nt长的small RNA | 第29页 |
·Natural siRNA | 第29-30页 |
·水稻功能基因组学与全长cDNA文库 | 第30-32页 |
·水稻基因功能研究的平台技术 | 第30-31页 |
·全长cDNA文库的意义和技术 | 第31-32页 |
·本研究的目的和意义 | 第32-33页 |
2 材料与方法 | 第33-42页 |
·实验材料 | 第33页 |
·水稻材料 | 第33页 |
·菌株 | 第33页 |
·RNA抽提 | 第33-34页 |
·cDNA文库构建 | 第34-35页 |
·水稻基因的克隆与转化 | 第35-36页 |
·OsSPL基因转化载体的构建 | 第35-36页 |
·基因的定点诱变 | 第36页 |
·基因表达分析 | 第36-38页 |
·Northern Blot | 第36页 |
·Semi-quantitative RT-PCR | 第36-37页 |
·Real-time qRT-PCR | 第37页 |
·Small RNA表达量检测 | 第37-38页 |
·Microarray分析水稻转录组 | 第38页 |
·RLM-RACE分析miRNA-RISC切断靶RNA的位点 | 第38页 |
·酵母双杂交 | 第38-39页 |
·Bait的构建 | 第38-39页 |
·文库的筛选 | 第39页 |
·互作的验证 | 第39页 |
·序列分析 | 第39-40页 |
·组织细胞学 | 第40-41页 |
·石蜡切片 | 第40页 |
·表皮细胞观察 | 第40-41页 |
·SEM | 第41页 |
·水稻器官的整体装片观察(whole mount) | 第41页 |
·In situ hybridization | 第41页 |
·植物生长与表型统计 | 第41-42页 |
·水稻的激素处理 | 第42页 |
·用于基因表达材料的激素处理 | 第42页 |
·MI7的激素处理 | 第42页 |
3 结果与分析 | 第42-102页 |
·水稻全长cDNA的分离 | 第42-48页 |
·明恢63 Normalized cDNA文库中全长cDNA的分离 | 第42-45页 |
·cDNA文库的构建 | 第45-48页 |
·MIR156与OsSPL基因的功能分析 | 第48-87页 |
·水稻miR156和SPL基因的分离与分析 | 第48-58页 |
·miR156与植物生长发育的调节 | 第58-69页 |
·miR156-OsSPL的互作与发育时间有关 | 第69-70页 |
·miR156的调节机制 | 第70-74页 |
·miR156与OsSPL基因互作的时间特异性 | 第74-76页 |
·Affymetrix rice microarray分析Md/Mh中转录组 | 第76-80页 |
·miR156-OsSPL互作的调节因素 | 第80-82页 |
·miR156的原位杂交 | 第82-84页 |
·Pri-miR156d和Pri-miR156h的表达与miR156表达模式相似 | 第84-85页 |
·OsSPL14基因的功能研究 | 第85-87页 |
·MIR164与水稻的发育 | 第87-102页 |
·水稻中miR164的序列分析与靶基因预测 | 第87-89页 |
·水稻中miR164的超表达 | 第89-91页 |
·miR164超表达对水稻生长发育的影响 | 第91-98页 |
·miR164的表达 | 第98-99页 |
·MI7的芯片分析 | 第99-100页 |
·miR164与光周期 | 第100-101页 |
·miR156-miR164的关系 | 第101-102页 |
4 讨论 | 第102-113页 |
·基于GATEWAY~(TM)技术的CDNA文库的应用 | 第102-104页 |
·基于Gateway~(TM)技术的文库的优点 | 第102-103页 |
·cDNA文库构建的下一步设想 | 第103-104页 |
·MIR156在水稻生长发育中的作用 | 第104-107页 |
·miR156调节植物发育的时间 | 第104-105页 |
·miR156是水稻叶片发育时间的Marker基因 | 第105页 |
·miR156的启动子控制miR156的表达 | 第105页 |
·miR156-OsSPL互作调节因子 | 第105-106页 |
·Md和Mh表型的部分解释 | 第106-107页 |
·MIR164在水稻生长发育中的调节作用 | 第107-109页 |
·miR164调节叶原基的发育 | 第107-108页 |
·miR164的功能与激素有关 | 第108页 |
·miR164在水稻中的新功能 | 第108-109页 |
·MIR156—MIR164PARADIGM模型 | 第109-111页 |
·miR156-miR164的调节模型 | 第109-110页 |
·水稻叶片的发育受众多基因的协同调节 | 第110页 |
·miR156-miR164与植物进化 | 第110-111页 |
·下一步工作设想 | 第111-113页 |
·利用miR156来控制水稻的发育和形态 | 第111页 |
·miR164 | 第111页 |
·Stem-loop qRT-PCR高通量筛选stress responsive small RNA | 第111-113页 |
参考文献 | 第113-124页 |
附录A 引物列表 | 第124-127页 |
附录B PROTOCOLS | 第127-139页 |
PROTOCOL 1 CDNA LIBRARY AND SEQUENCING | 第127-134页 |
Highthroughputplasmidpreparationforsequencing | 第127-128页 |
Modified Template-switch Method Full-length cDNA Library Construction | 第128-130页 |
Modified Oligo-capping cDNA Library Construction | 第130-134页 |
PROTOCOL 2 SMALL RNA ANALYSIS | 第134-139页 |
Small RNA Gel Blot | 第134-136页 |
Cleavage Site Mapping of MicroRNA-Targeted mRNAs | 第136-139页 |
简历 | 第139-141页 |
致谢 | 第141页 |