| 目录 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 缩略词表(ABBREVIATIONS) | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第11-30页 |
| ·研究问题的由来 | 第11-12页 |
| ·文献综述 | 第12-29页 |
| ·生物芯片技术 | 第12-16页 |
| ·基因芯片的分类 | 第16-18页 |
| ·根据芯片数据寻找差异表达基因的分析方法 | 第18-21页 |
| ·芯片数据的生物信息分析—挖掘数据的生物学意义 | 第21-25页 |
| ·芯片数据分析的常用软件 | 第25-26页 |
| ·国际通用的发表芯片文章的最小信息量(MIAMI)标准 | 第26-28页 |
| ·基因表达公共数据库 | 第28-29页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第29-30页 |
| 2 材料和方法 | 第30-40页 |
| ·材料 | 第30-32页 |
| ·用于本研究的组织样品 | 第30页 |
| ·主要仪器设备 | 第30-31页 |
| ·主要试剂 | 第31页 |
| ·主要试剂的配制 | 第31-32页 |
| ·计算机操作系统环境 | 第32页 |
| ·实验方法 | 第32-40页 |
| ·组织总RNA提取 | 第32-33页 |
| ·总RNA完整性检测 | 第33页 |
| ·总RNA的DNase-Ⅰ处理 | 第33页 |
| ·总RNA的反转录 | 第33-34页 |
| ·芯片杂交及芯片扫描 | 第34页 |
| ·基因表达芯片数据的前处理 | 第34-35页 |
| ·方差分析法筛选差异表达基因 | 第35-36页 |
| ·贝叶斯分析法筛选差异表达基因 | 第36-39页 |
| ·聚类分析方法 | 第39页 |
| ·Gene Ontology分析方法和Pathway分析方法 | 第39页 |
| ·Q-PCR | 第39页 |
| ·Q-PCR数据分析方法 | 第39-40页 |
| 3 结果 | 第40-52页 |
| ·芯片杂交效果 | 第40-42页 |
| ·芯片数据的标准化 | 第42页 |
| ·方差分析法分析结果 | 第42-45页 |
| ·贝叶斯方法分析结果 | 第45-47页 |
| ·聚类分析结果 | 第47-48页 |
| ·基因注释分类结果 | 第48-50页 |
| ·网络途径分析结果 | 第50页 |
| ·Q-PCR验证结果 | 第50-52页 |
| 4 讨论 | 第52-57页 |
| ·关于实验设计 | 第52页 |
| ·关于芯片的选择 | 第52页 |
| ·关于绝对定量与相对定量 | 第52-53页 |
| ·总RNA的质量 | 第53页 |
| ·关于芯片杂交质量控制及本次芯片杂交效果评价 | 第53-54页 |
| ·关于芯片数据的校正 | 第54页 |
| ·关于假阳性问题 | 第54-55页 |
| ·关于贝叶斯统计 | 第55页 |
| ·方差分析法和贝叶斯分析的比较 | 第55-56页 |
| ·关于聚类分析 | 第56-57页 |
| 5 小结 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 附录 | 第64-67页 |