基于智能算法的DNA序列比对研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-15页 |
| ·研究背景和意义 | 第9-10页 |
| ·研究背景 | 第9-10页 |
| ·序列比对意义 | 第10页 |
| ·国内外研究现状 | 第10-12页 |
| ·双序列比对 | 第10-11页 |
| ·多序列比对 | 第11-12页 |
| ·本文主要研究内容 | 第12-13页 |
| ·序列比对算法 | 第12页 |
| ·基于人工鱼群算法的DNA 双序列比对 | 第12页 |
| ·基于改进蚁群算法的DNA 双序列比对 | 第12-13页 |
| ·本文创新点 | 第13页 |
| ·本文组织结构 | 第13-15页 |
| 第二章 DNA 序列比对 | 第15-25页 |
| ·生物信息学背景知识 | 第15-17页 |
| ·蛋白质与核酸 | 第15-16页 |
| ·中心法则 | 第16-17页 |
| ·DNA 序列比对的数学描述 | 第17-20页 |
| ·DNA 双序列比对的数学描述 | 第17-18页 |
| ·DNA 多序列比对的数学描述 | 第18-20页 |
| ·序列比对基本原理 | 第20-25页 |
| ·基本操作 | 第20页 |
| ·相关定义 | 第20-21页 |
| ·空位罚分 | 第21-22页 |
| ·替换矩阵 | 第22-25页 |
| 第三章 序列比对算法研究 | 第25-32页 |
| ·双序列比对算法 | 第25-29页 |
| ·NW 算法 | 第25-26页 |
| ·Smith-Waterman 算法 | 第26-28页 |
| ·BLAST 算法 | 第28-29页 |
| ·多序列比对算法 | 第29-32页 |
| ·渐进比对算法 | 第29-31页 |
| ·迭代比对算法 | 第31-32页 |
| 第四章 基于人工鱼群算法的DNA 双序列比对 | 第32-44页 |
| ·人工鱼群算法 | 第32-37页 |
| ·人工鱼群算法的基本思想 | 第32-33页 |
| ·人工鱼群算法的定义 | 第33-34页 |
| ·人工鱼群算法的描述 | 第34-36页 |
| ·人工鱼群算法的研究现状 | 第36-37页 |
| ·人工鱼群算法在DNA 双序列中的应用 | 第37-42页 |
| ·算法思想 | 第37-40页 |
| ·算法描述 | 第40-41页 |
| ·算法流程 | 第41-42页 |
| ·算法实现与实验结果分析 | 第42-43页 |
| ·参数设置 | 第42页 |
| ·实验结果与分析 | 第42-43页 |
| ·本章小结 | 第43-44页 |
| 第五章 基于改进蚁群算法的DNA 双序列比对 | 第44-56页 |
| ·蚁群算法的原理与应用 | 第44-47页 |
| ·蚁群算法的基本原理 | 第44页 |
| ·蚁群算法的发展 | 第44-45页 |
| ·蚁群算法的计算模型 | 第45-46页 |
| ·蚁群算法的应用 | 第46-47页 |
| ·蚁群算法在DNA 双序列比对的应用 | 第47-50页 |
| ·蚁群算法求解DNA 双序列比对的模型 | 第47-48页 |
| ·蚁群算法求解DNA 序列比对的算法流程 | 第48-50页 |
| ·改进蚁群算法在DNA 双序列比对中的应用 | 第50-52页 |
| ·算法改进策略 | 第50-51页 |
| ·算法描述 | 第51-52页 |
| ·算法实现与实验结果分析 | 第52-55页 |
| ·参数设置 | 第52页 |
| ·实验结果与分析 | 第52-55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 第六章 总结与展望 | 第56-58页 |
| ·研究总结 | 第56页 |
| ·研究展望 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文和参与的项目 | 第63-64页 |
| 附录1 | 第64-67页 |
| 附录2 | 第67-72页 |
| 附录3 | 第72页 |
