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猪Klf4、Klf5、Klf7和Egr2基因的克隆及分子特性研究

摘要第1-11页
Abstract第11-13页
缩略语表第13-14页
1.文献综述第14-34页
   ·KLF家族概述第14-20页
     ·KLF因子的发现和进化分类第14-15页
     ·KLF因子的结构第15-18页
     ·KLF因子的功能第18-19页
     ·KLF因子的作用机理第19-20页
   ·KLF因子与癌症发生第20-27页
     ·Sp蛋白参与癌细胞增殖基因的表达调控第20-23页
     ·靶向Sp蛋白途径的癌症治疗策略第23-24页
     ·Sp蛋白作用于癌细胞的机理第24-27页
       ·Sp蛋白和启动子序列结合中的蛋白因子相互作用第24-25页
       ·Sp蛋白和其它核因子的相互作用第25-26页
       ·Sp蛋白的修饰第26-27页
   ·KLF因子在脉管形成及其病理中的作用第27-31页
     ·KLF因子在脉管中的作用第27-29页
     ·KLF因子与脉管细胞生长调控第29页
     ·KLF因子在脉管细胞中作用的分子机理第29-31页
   ·参与脂肪代谢的KLF因子第31-33页
     ·KLF4和KLF5第31-32页
     ·KLF7第32-33页
   ·和KLF因子共同参与脂肪代谢的EGR2第33-34页
2.研究的目的和意义第34-35页
3.材料与方法第35-49页
   ·实验材料第35-37页
     ·实验动物第35页
     ·样品采集第35页
     ·菌株和细胞第35页
     ·主要仪器第35-36页
     ·主要生化试剂第36页
     ·常用溶液配制第36-37页
     ·工具酶和试剂盒第37页
     ·分子生物学软件第37页
   ·实验方法第37-49页
     ·DNA/RNA提取和,cDNA制备第37-40页
       ·基因组DNA提取第38页
       ·总RNA的提取第38页
       ·总RNA的纯化(去除DNA)第38-39页
       ·总RNA含量测定及纯度鉴定第39页
       ·逆转录制备cDNA第39-40页
     ·DNA/cDNA片段的克隆和测序第40-42页
       ·PCR反应体系第40页
       ·PCR反应条件第40页
       ·目的条带的纯化第40-41页
       ·目的条带的TA克隆第41页
       ·菌落PCR筛选阳性克隆第41页
       ·重组质粒双酶切进一步验证阳性克隆第41-42页
       ·测序第42页
     ·目的基因的克隆第42-44页
       ·引物设计与PCR反应条件第42-43页
       ·各基因部分CDS序列的测序第43页
       ·拼接部分cDNA片段获得各基因完整CDS第43-44页
       ·BLAST检索猪各基因CDS对人的同源性第44页
       ·氨基酸水平分析猪各基因和其它物种的同源性第44页
     ·染色体定位第44-46页
       ·内含子序列的获得第44-45页
         ·引物设计第44-45页
         ·内含子的扩增和测序第45页
       ·基因的染色体定位(IMpRH克隆板)第45-46页
         ·引物设计第45页
         ·PCR反应条件和特异性检测第45-46页
         ·PCR信号分型第46页
         ·定位信号分析第46页
     ·半定量RT-PCR与组织表达谱研究第46-48页
       ·引物设计第46页
       ·组织分布引物的温度梯度PCR第46页
       ·目的基因及内参GAPDH扩增指数期的确定第46-47页
       ·半定量RT-PCR第47页
       ·组织表达谱的定量分析第47-48页
     ·药物刺激对3T3-L1前脂肪细胞中目的基因表达的影响第48-49页
       ·3T3-L1前脂肪细胞的培养和传代第48页
       ·药物刺激及对照设计第48页
         ·药物选择及浓度梯度第48页
         ·刺激处理及对照设计第48页
       ·细胞总RNA的抽提和逆转录第48页
       ·半定量RT-PCR及定量分析第48-49页
4.结果与分析第49-86页
   ·Klf4基因的分子特性研究第49-60页
     ·猪Klf4部分cDNA的克隆及完整CDS的分析第49-51页
       ·猪Klf4部分CDS的克隆及验证第49页
       ·氨基酸水平上猪KLF4与其它物种的同源性分析第49-51页
     ·猪Klf4基因的染色体定位第51-56页
       ·猪Klf4第三内含子的扩增第51-52页
       ·猪Klf4染色体定位PCR反应特异性检测第52页
       ·猪Klf4染色体定位PCR检测结果第52-53页
       ·猪Klf4染色体定位结果第53-54页
       ·猪Klf4染色体定位与人的比较第54-56页
     ·猪Klf4的组织表达谱第56-58页
       ·猪Klf4及内参GAPDH扩增指数期的确定第56-57页
       ·猪Klf4组织表达谱的RT-PCR结果及半定量分析第57-58页
     ·3T3-L1前脂肪细胞中Klf4的基因表达第58-60页
       ·胰岛素对3T3-L1前脂肪细胞中Klf4表达的影响第58-59页
       ·克伦特罗对3T3-L1前脂肪细胞中Klf4表达的影响第59-60页
   ·Klf5基因的分子特性研究第60-70页
     ·猪Klf5完整CDS的克隆及其氨基酸序列分析第60-62页
       ·猪Klf5 cDNA 3’和5’部分的克隆第60页
       ·氨基酸水平上猪KLF5与其它物种的同源性分析第60-62页
     ·猪Klf5基因的染色体定位第62-66页
       ·猪Klf5第二内含子的克隆第62-63页
       ·猪Klf5染色体定位PCR反应特异性检测第63页
       ·猪Klf5染色体定位PCR检测结果第63-64页
       ·猪Klf5染色体定位结果第64-65页
       ·猪Klf5染色体定位与人的比较第65-66页
     ·猪Klf5的组织表达谱第66-68页
       ·猪Klf5部分CDS扩增指数期的确定第66-67页
       ·猪Klf5组织表达谱的RT-PCR结果及半定量分析第67-68页
     ·3T3-L1前脂肪细胞中Klf5的基因表达第68-70页
       ·胰岛素对3T3-L1前脂肪细胞中Klf5表达的影响第68-69页
       ·克伦特罗对3T3-L1前脂肪细胞中Klf5表达的影响第69-70页
   ·Klf7基因的分子特性研究第70-75页
     ·猪Klf7完整CDS的克隆及其氨基酸序列分析第70-72页
       ·猪Klf7的3’、5’和中间部分cDNA的克隆第70页
       ·氨基酸水平上猪KLF7与其它物种的同源性分析第70-72页
     ·猪Klf7的组织表达谱第72-73页
       ·猪Klf7部分CDS扩增指数期的确定第72页
       ·猪Klf7组织表达谱RT-PCR结果及半定量分析第72-73页
     ·3T3-L1前脂肪细胞中Klf7的基因表达第73-75页
       ·胰岛素对3T3-L1前脂肪细胞中Klf7表达的影响第73-74页
       ·克伦特罗对3T3-L1前脂肪细胞中Klf7表达的影响第74-75页
   ·Egr2基因的分子特性研究第75-86页
     ·猪Egr2完整CDS的克隆及其氨基酸序列分析第75-78页
       ·猪Egr2 cDNA 3’、5’和中间部分的克隆第75-76页
       ·氨基酸水平上猪EGR2与其它物种的同源性分析第76-78页
     ·猪Egr2基因的染色体定位第78-82页
       ·猪Egr2第一内含子的克隆第78页
       ·猪Egr2染色体定位PCR反应特异性检测第78-79页
       ·猪Egr2染色体定位PCR检测结果第79-80页
       ·猪Egr2染色体定位结果第80-81页
       ·猪Egr2染色体定位与人的比较第81-82页
     ·猪Egr2的组织表达谱第82-84页
       ·猪Egr2部分CDS扩增指数期的确定第82-83页
       ·猪Egr2组织表达谱RT-PCR结果及半定量分析第83-84页
     ·3T3-L1前脂肪细胞中Egr2的基因表达第84-86页
       ·胰岛素对3T3-L1前脂肪细胞中Egr2表达的影响第84-85页
       ·克伦特罗对3T3-L1前脂肪细胞中Egr2表达的影响第85-86页
5.讨论第86-90页
   ·KLF4、KLF5,KLF7和EGR2锌指结构域氨基酸序列分析第86-87页
   ·IMpRH方法和KLF家族调控因子染色体分布特征第87-88页
   ·Klf4、Klf5、Klf7和Egr2的组织表达特征第88-90页
6.结论第90-91页
参考文献第91-107页
论文发表情况和提交的序列第107-108页
致谢第108-109页
附录1.猪Klf5 cDNA序列(Genbank:DQ682407)第109-111页
附录2.猪Klf7 cDNA序列(Genbank:DQ665828)第111-112页
附录3.猪Egr2 cDNA序列(Genbank:DQ665829)第112-114页
附录4.猪Klf4第三内含子序列(Genbank:DQ665830)第114-115页
附录5.猪Klf5第二内含子序列(Genbank:DQ665831)第115-116页
附录6.猪Egr2第一内含子序列(Genbank:DQ825667)第116-118页

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